223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3546 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3546  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 		 147 aa  305  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.225278  normal  0.0570392 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2179  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.76 
 
 		 146 aa  124  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3098  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.48 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000850498  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0029  alkylhydroperoxidase  40.28 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622456  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3734  alkylhydroperoxidase  39.86 
 
 		 150 aa  115  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51777  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  41.04 
 
 		 157 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1943  hypothetical protein  39.16 
 
 		 159 aa  110  7.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.278152  normal  0.0324993 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1660  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.96 
 
 		 160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  38.06 
 
 		 146 aa  105  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.25 
 
 		 150 aa  100  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406059  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.32 
 
 		 163 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.32 
 
 		 163 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.17 
 
 		 152 aa  100  8e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1182  alkylhydroperoxidase  37.76 
 
 		 163 aa  100  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.4 
 
 		 163 aa  99.4  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.92 
 
 		 163 aa  98.6  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1333  alkylhydroperoxidase  36.97 
 
 		 151 aa  97.8  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.59317 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3259  alkylhydroperoxidase  34.25 
 
 		 150 aa  97.4  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.101599  normal  0.0335337 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1128  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.57 
 
 		 148 aa  96.3  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.453208 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  35.17 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  36.57 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5624  alkylhydroperoxidase  37.86 
 
 		 167 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  34.48 
 
 		 159 aa  95.5  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  34.25 
 
 		 145 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 147 aa  94.4  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  37.24 
 
 		 153 aa  94.7  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.04 
 
 		 145 aa  94  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  33.79 
 
 		 145 aa  93.6  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.17 
 
 		 145 aa  92.8  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.79 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.79 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.84 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  38.81 
 
 		 150 aa  92  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  34.25 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  33.79 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1402  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.78 
 
 		 146 aa  90.9  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.42 
 
 		 153 aa  90.9  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  33.08 
 
 		 147 aa  90.5  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.17 
 
 		 145 aa  90.9  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  35.17 
 
 		 149 aa  90.5  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.42 
 
 		 153 aa  90.5  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  38.06 
 
 		 156 aa  90.5  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.72 
 
 		 145 aa  90.1  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  34.06 
 
 		 143 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.03 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  34.33 
 
 		 159 aa  89.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6133  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.14 
 
 		 151 aa  88.6  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.17 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6812  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.92 
 
 		 151 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  34.51 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3241  hypothetical protein  31.25 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.371033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  32.59 
 
 		 145 aa  87.8  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  33.56 
 
 		 162 aa  87.8  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 		 145 aa  87.8  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  33.1 
 
 		 145 aa  87.8  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6087  alkylhydroperoxidase  30.14 
 
 		 151 aa  87.4  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6384  alkylhydroperoxidase  30.14 
 
 		 151 aa  87.4  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39128  normal  0.0625105 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  32.59 
 
 		 145 aa  87.4  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3956  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.76 
 
 		 165 aa  87  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4069  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.76 
 
 		 165 aa  87  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0996  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.51 
 
 		 150 aa  86.7  9e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.710241  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1929  alkylhydroperoxidase  33.8 
 
 		 149 aa  86.7  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.59 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1680  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.58 
 
 		 159 aa  86.3  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.581321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  32.59 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  35.29 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  32.59 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  32.59 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2014  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  33.58 
 
 		 159 aa  86.3  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.21 
 
 		 150 aa  85.5  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  32.77 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2658  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.1 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.764156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3554  alkylhydroperoxidase  30.14 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.249618 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.34 
 
 		 159 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  31.72 
 
 		 159 aa  85.5  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.72 
 
 		 145 aa  84.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2877  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.1 
 
 		 144 aa  84.7  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3440  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.04 
 
 		 152 aa  84.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2104  alkylhydroperoxidase  32.39 
 
 		 149 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.19 
 
 		 146 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3275  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.8 
 
 		 159 aa  84  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6098  alkylhydroperoxidase  29.45 
 
 		 149 aa  84  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2219  alkylhydroperoxidase  34.25 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108098  normal  0.214163 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.03 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.34 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.03 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  30.34 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6989  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.793098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4997  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.59 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.56474  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1874  alkylhydroperoxidase  31.69 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5085  alkylhydroperoxidase  37.59 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.03 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5378  alkylhydroperoxidase  37.59 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.09 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  29.66 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3376  alkylhydroperoxidase  29.85 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  31.03 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  31.03 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3272  alkylhydroperoxidase  32.85 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.82 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>