234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2612 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 
150 aa  298  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406059  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3259  alkylhydroperoxidase  97.33 
 
 
150 aa  288  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.101599  normal  0.0335337 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0996  alkylhydroperoxidase AhpD core  74.67 
 
 
150 aa  223  7e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.710241  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2219  alkylhydroperoxidase  48.05 
 
 
147 aa  139  9e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108098  normal  0.214163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  45.89 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3742  alkylhydroperoxidase  42.47 
 
 
169 aa  120  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  42.76 
 
 
145 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.18 
 
 
153 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  42.76 
 
 
145 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  43.45 
 
 
145 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.93 
 
 
163 aa  115  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.93 
 
 
163 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.07 
 
 
145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  42.07 
 
 
145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3734  alkylhydroperoxidase  36 
 
 
150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51777  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.69 
 
 
145 aa  114  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.58 
 
 
163 aa  114  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.07 
 
 
145 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  42.07 
 
 
145 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5624  alkylhydroperoxidase  42.57 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.69 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40.69 
 
 
145 aa  110  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  40.69 
 
 
149 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  41.1 
 
 
150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  41.26 
 
 
146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  40 
 
 
159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.38 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.73 
 
 
163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  39.31 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.82 
 
 
150 aa  108  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  40 
 
 
145 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1182  alkylhydroperoxidase  43.54 
 
 
163 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40 
 
 
145 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.52 
 
 
152 aa  106  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  37.09 
 
 
162 aa  105  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2179  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.89 
 
 
146 aa  105  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  39.16 
 
 
145 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40 
 
 
145 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1913  alkylhydroperoxidase  42.86 
 
 
149 aa  104  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.21 
 
 
153 aa  104  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  40.34 
 
 
158 aa  104  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1402  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.57 
 
 
146 aa  103  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3241  hypothetical protein  34.48 
 
 
144 aa  103  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.371033  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  38.46 
 
 
145 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  37.33 
 
 
159 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.55 
 
 
146 aa  102  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 
159 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.67 
 
 
159 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  36.67 
 
 
159 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3826  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.51 
 
 
141 aa  103  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0148218  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  37.24 
 
 
145 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3108  alkylhydroperoxidase  38.73 
 
 
159 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1929  alkylhydroperoxidase  40.82 
 
 
149 aa  102  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  36.67 
 
 
157 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1660  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.85 
 
 
160 aa  101  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0882  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.62 
 
 
151 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2104  alkylhydroperoxidase  40.82 
 
 
149 aa  101  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0899  alkylhydroperoxidase  35.62 
 
 
151 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0888  alkylhydroperoxidase  35.62 
 
 
151 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.302466 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  36.05 
 
 
159 aa  100  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 
159 aa  100  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3133  alkylhydroperoxidase  36.99 
 
 
158 aa  100  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3546  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.25 
 
 
147 aa  100  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.225278  normal  0.0570392 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
154 aa  100  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  36 
 
 
159 aa  100  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0029  alkylhydroperoxidase  34.72 
 
 
144 aa  100  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622456  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
159 aa  99.4  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2331  alkylhydroperoxidase  42.86 
 
 
149 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03920  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  43.36 
 
 
165 aa  99.4  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2448  alkylhydroperoxidase  42.86 
 
 
149 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.19874  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  41.96 
 
 
154 aa  99  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1874  alkylhydroperoxidase  39.46 
 
 
149 aa  99.4  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0825  alkylhydroperoxidase  43.57 
 
 
169 aa  98.6  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  38.85 
 
 
143 aa  99  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2015  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.18 
 
 
149 aa  98.6  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.419604  hitchhiker  0.00248557 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.73 
 
 
151 aa  98.2  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34 
 
 
159 aa  98.2  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.98 
 
 
155 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.55 
 
 
152 aa  97.8  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1098  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.27 
 
 
152 aa  98.2  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.574019 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3098  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.29 
 
 
150 aa  97.8  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000850498  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  35.86 
 
 
153 aa  97.4  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  34.67 
 
 
159 aa  97.8  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2331  alkylhydroperoxidase  42.18 
 
 
149 aa  97.8  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.224128  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  34.67 
 
 
159 aa  97.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36 
 
 
159 aa  97.4  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.53 
 
 
153 aa  97.1  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3376  alkylhydroperoxidase  38 
 
 
154 aa  97.1  8e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  32 
 
 
159 aa  96.7  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1998  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.91 
 
 
159 aa  96.7  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4997  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.22 
 
 
156 aa  96.7  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.56474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5085  alkylhydroperoxidase  44.22 
 
 
156 aa  96.7  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5378  alkylhydroperoxidase  44.22 
 
 
156 aa  96.7  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28383  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1943  hypothetical protein  32.43 
 
 
159 aa  96.3  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.278152  normal  0.0324993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.5 
 
 
157 aa  96.3  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.87 
 
 
153 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  39.73 
 
 
151 aa  95.9  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.67 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  41.91 
 
 
156 aa  95.9  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>