247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1098 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1098  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 
152 aa  310  4.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.574019 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3742  alkylhydroperoxidase  48.95 
 
 
169 aa  136  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0882  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.83 
 
 
151 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0899  alkylhydroperoxidase  44.83 
 
 
151 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0888  alkylhydroperoxidase  44.83 
 
 
151 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.302466 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03920  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  47.92 
 
 
165 aa  113  8.999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3634  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.33 
 
 
164 aa  107  6e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0996  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.41 
 
 
150 aa  105  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.710241  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.27 
 
 
150 aa  101  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406059  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3259  alkylhydroperoxidase  40.27 
 
 
150 aa  100  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.101599  normal  0.0335337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  41.1 
 
 
152 aa  97.8  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0825  alkylhydroperoxidase  41.67 
 
 
169 aa  96.3  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.57 
 
 
143 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.86 
 
 
143 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0761488 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2951  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  38.13 
 
 
144 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0696867  normal  0.0134978 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3003  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  38.13 
 
 
144 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047955 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2920  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  38.13 
 
 
144 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789877  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2986  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  38.13 
 
 
144 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3109  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  38.13 
 
 
144 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280387  normal  0.494752 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5624  alkylhydroperoxidase  42.18 
 
 
167 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2219  alkylhydroperoxidase  37.75 
 
 
147 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108098  normal  0.214163 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.44 
 
 
150 aa  92  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3720  alkylhydroperoxidase  37.88 
 
 
143 aa  90.1  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3272  alkylhydroperoxidase  42.42 
 
 
152 aa  89  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.15 
 
 
152 aa  87.8  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0103  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.43 
 
 
157 aa  87.8  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.335572 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2023  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.81 
 
 
158 aa  86.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0330638 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1680  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.03 
 
 
159 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.581321  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8880  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.74 
 
 
156 aa  85.5  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1660  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.73 
 
 
160 aa  85.9  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2014  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  36.03 
 
 
159 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  37.76 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1695  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.62 
 
 
157 aa  85.5  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.232521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0186  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.7 
 
 
159 aa  84.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2657  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.7 
 
 
149 aa  84.3  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0722342  normal  0.0242397 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.75 
 
 
152 aa  84  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1182  alkylhydroperoxidase  40.82 
 
 
163 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.23 
 
 
152 aa  83.6  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  37.31 
 
 
145 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3275  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.13 
 
 
159 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  33.59 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3517  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.3 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1327  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.39 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.284107  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.56 
 
 
143 aa  81.6  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.315709  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.78 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  37.78 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.78 
 
 
145 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3376  alkylhydroperoxidase  35.71 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  34.53 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  35.71 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3440  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.07 
 
 
152 aa  80.1  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3217  alkylhydroperoxidase-like protein  43.75 
 
 
157 aa  80.1  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  35.07 
 
 
145 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1900  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.65 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1369  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.65 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.5 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  34.31 
 
 
154 aa  80.1  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.06 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1057  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.65 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0811  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.65 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1211  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.65 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1219  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.65 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  38.46 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  39.37 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0021  alkylhydroperoxidase  39.25 
 
 
157 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  35.34 
 
 
150 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.82 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3822  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.85 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176848  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  35.77 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.92 
 
 
154 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3098  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.64 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000850498  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  33.8 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.04 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  34.06 
 
 
159 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2847  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150118  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3554  alkylhydroperoxidase  36.36 
 
 
151 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.249618 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 
159 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.78 
 
 
155 aa  77  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
159 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3133  alkylhydroperoxidase  34.11 
 
 
158 aa  77  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.64 
 
 
163 aa  77  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0029  alkylhydroperoxidase  32.84 
 
 
144 aa  77  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622456  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.65 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1128  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.453208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4101  alkylhydroperoxidase  34.53 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  32.59 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  36.5 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.96 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.17 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.11 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6705  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.62 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.625581  normal  0.389522 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.28 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.09 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  35.09 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3843  putative peroxidase  36.7 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.46 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  38.26 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.28 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0996  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.91 
 
 
283 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.353647  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6384  alkylhydroperoxidase  36.76 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39128  normal  0.0625105 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>