265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1128 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1128  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 
148 aa  301  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.453208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  46.48 
 
 
146 aa  150  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1402  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  53.91 
 
 
146 aa  135  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1182  alkylhydroperoxidase  45.89 
 
 
163 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3734  alkylhydroperoxidase  46.3 
 
 
150 aa  124  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51777  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  45.93 
 
 
154 aa  124  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5624  alkylhydroperoxidase  42.47 
 
 
167 aa  124  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.21 
 
 
147 aa  123  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1660  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.67 
 
 
160 aa  121  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  46.62 
 
 
150 aa  121  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.37 
 
 
150 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  44.2 
 
 
159 aa  118  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0029  alkylhydroperoxidase  42.25 
 
 
144 aa  118  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622456  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  42.25 
 
 
145 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3217  alkylhydroperoxidase-like protein  49.58 
 
 
157 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3822  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.82 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176848  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.48 
 
 
163 aa  114  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.61 
 
 
152 aa  115  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.17 
 
 
163 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0103  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  54.37 
 
 
157 aa  114  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.335572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  49.56 
 
 
163 aa  114  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.17 
 
 
163 aa  113  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3241  hypothetical protein  39.72 
 
 
144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.371033  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  40.14 
 
 
145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  40.14 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6098  alkylhydroperoxidase  40.88 
 
 
149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.67 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0186  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  52.38 
 
 
159 aa  111  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.69 
 
 
146 aa  111  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  46.55 
 
 
157 aa  110  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  49.14 
 
 
152 aa  110  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2023  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  52.29 
 
 
158 aa  110  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0330638 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4997  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.84 
 
 
156 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.56474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5085  alkylhydroperoxidase  43.84 
 
 
156 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5378  alkylhydroperoxidase  43.84 
 
 
156 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28383  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3554  alkylhydroperoxidase  40.88 
 
 
151 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.249618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8880  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  49.54 
 
 
156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7113  hypothetical protein  48.59 
 
 
154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  41.67 
 
 
162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  41.79 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5805  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.03 
 
 
152 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0418506  normal  0.111709 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6989  alkylhydroperoxidase  40.15 
 
 
151 aa  107  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.793098  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1943  hypothetical protein  43.09 
 
 
159 aa  107  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.278152  normal  0.0324993 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1695  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50.88 
 
 
157 aa  106  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.232521 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6705  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.28 
 
 
158 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.625581  normal  0.389522 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1929  alkylhydroperoxidase  41.04 
 
 
149 aa  106  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  44.55 
 
 
158 aa  105  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4737  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.2 
 
 
152 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223994  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.06 
 
 
155 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3104  alkylhydroperoxidase  40.14 
 
 
149 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207419  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6087  alkylhydroperoxidase  37.96 
 
 
151 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6384  alkylhydroperoxidase  37.96 
 
 
151 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39128  normal  0.0625105 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  37.67 
 
 
145 aa  104  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0825  alkylhydroperoxidase  41.22 
 
 
169 aa  104  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.46 
 
 
145 aa  104  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.32 
 
 
159 aa  104  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1333  alkylhydroperoxidase  42.74 
 
 
151 aa  103  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.59317 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  35.92 
 
 
145 aa  103  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2104  alkylhydroperoxidase  40.3 
 
 
149 aa  103  8e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.97 
 
 
145 aa  103  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.24 
 
 
146 aa  102  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3843  putative peroxidase  46.49 
 
 
167 aa  102  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.1 
 
 
145 aa  102  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  40.44 
 
 
143 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.37 
 
 
145 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  42.37 
 
 
149 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  41.32 
 
 
145 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6133  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.69 
 
 
151 aa  101  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1913  alkylhydroperoxidase  39.55 
 
 
149 aa  101  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  41.32 
 
 
145 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.51 
 
 
151 aa  101  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0013  alkylhydroperoxidase  41.41 
 
 
158 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3098  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.88 
 
 
150 aa  101  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000850498  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  40.94 
 
 
157 aa  100  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  42.28 
 
 
145 aa  100  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8871  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.61 
 
 
161 aa  100  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2061  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.58 
 
 
151 aa  100  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1874  alkylhydroperoxidase  39.55 
 
 
149 aa  100  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2331  alkylhydroperoxidase  40.3 
 
 
149 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.224128  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  34.27 
 
 
159 aa  99.8  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  34.78 
 
 
153 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  42.34 
 
 
156 aa  99.4  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.02 
 
 
145 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2015  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.3 
 
 
149 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.419604  hitchhiker  0.00248557 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0021  alkylhydroperoxidase  45.61 
 
 
158 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106747  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.53 
 
 
145 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3437  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.55 
 
 
144 aa  99  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330272  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.5 
 
 
153 aa  98.6  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2448  alkylhydroperoxidase  40.3 
 
 
149 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.19874  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.13 
 
 
154 aa  99  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.66 
 
 
159 aa  99  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  37.06 
 
 
159 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3108  alkylhydroperoxidase  40.28 
 
 
159 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  37.06 
 
 
159 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.53 
 
 
145 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  41.53 
 
 
145 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  41.53 
 
 
145 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  43.51 
 
 
151 aa  98.2  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.66 
 
 
159 aa  98.6  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  42.74 
 
 
155 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>