229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3634 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3634  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 
164 aa  332  2e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0882  alkylhydroperoxidase AhpD core  50.99 
 
 
151 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0899  alkylhydroperoxidase  50.99 
 
 
151 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0888  alkylhydroperoxidase  50.99 
 
 
151 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.302466 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3742  alkylhydroperoxidase  44.37 
 
 
169 aa  125  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03920  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  45.52 
 
 
165 aa  123  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1098  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.33 
 
 
152 aa  121  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.574019 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0825  alkylhydroperoxidase  46.98 
 
 
169 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3259  alkylhydroperoxidase  41.22 
 
 
150 aa  112  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.101599  normal  0.0335337 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2219  alkylhydroperoxidase  42.86 
 
 
147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108098  normal  0.214163 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.14 
 
 
150 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406059  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  39.38 
 
 
162 aa  102  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1128  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.87 
 
 
148 aa  99  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.453208 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5624  alkylhydroperoxidase  38.3 
 
 
167 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.29 
 
 
159 aa  98.6  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2179  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.06 
 
 
146 aa  97.1  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.57 
 
 
152 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1182  alkylhydroperoxidase  37.41 
 
 
163 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3734  alkylhydroperoxidase  34.53 
 
 
150 aa  95.9  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51777  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  38.57 
 
 
145 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  41.07 
 
 
158 aa  94.4  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  35.92 
 
 
152 aa  94.4  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0029  alkylhydroperoxidase  34.97 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622456  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.88 
 
 
145 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  36.43 
 
 
153 aa  92.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.46 
 
 
157 aa  92.8  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1943  hypothetical protein  33.33 
 
 
159 aa  92  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.278152  normal  0.0324993 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1660  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.64 
 
 
160 aa  92  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0996  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.87 
 
 
150 aa  90.9  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.710241  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.04 
 
 
159 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  34.04 
 
 
159 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3376  alkylhydroperoxidase  35.25 
 
 
154 aa  90.9  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1333  alkylhydroperoxidase  39.5 
 
 
151 aa  90.9  8e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.59317 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  34.04 
 
 
159 aa  90.5  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3098  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.5 
 
 
150 aa  90.5  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000850498  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.91 
 
 
146 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  33.08 
 
 
147 aa  89.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3826  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.64 
 
 
141 aa  90.1  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0148218  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  37.24 
 
 
145 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.93 
 
 
159 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  43.36 
 
 
155 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6098  alkylhydroperoxidase  42.86 
 
 
149 aa  89.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  37.86 
 
 
159 aa  89.4  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3554  alkylhydroperoxidase  42.86 
 
 
151 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.249618 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6384  alkylhydroperoxidase  41.96 
 
 
151 aa  89  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39128  normal  0.0625105 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6087  alkylhydroperoxidase  41.96 
 
 
151 aa  89  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  37.67 
 
 
157 aa  88.6  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.71 
 
 
153 aa  88.2  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.91 
 
 
150 aa  87.8  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  35 
 
 
149 aa  87.8  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35 
 
 
145 aa  87.8  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2023  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.92 
 
 
158 aa  87.4  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0330638 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.17 
 
 
145 aa  87.4  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3241  hypothetical protein  32.17 
 
 
144 aa  87.4  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.371033  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  31.33 
 
 
159 aa  87  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0021  alkylhydroperoxidase  39.57 
 
 
157 aa  86.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35 
 
 
153 aa  87  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  34.48 
 
 
159 aa  86.7  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  35 
 
 
143 aa  87  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.86 
 
 
153 aa  85.9  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1402  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.82 
 
 
146 aa  86.3  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.21 
 
 
159 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  34.29 
 
 
145 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  35.86 
 
 
145 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  35.71 
 
 
146 aa  85.5  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3217  alkylhydroperoxidase-like protein  37.66 
 
 
157 aa  85.5  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.04 
 
 
145 aa  85.5  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.57 
 
 
155 aa  85.1  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.94 
 
 
163 aa  85.5  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2658  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.29 
 
 
151 aa  85.5  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.764156  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3546  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.8 
 
 
147 aa  85.5  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.225278  normal  0.0570392 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 
159 aa  85.1  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.29 
 
 
145 aa  85.1  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1695  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.5 
 
 
157 aa  85.1  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.232521 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.48 
 
 
152 aa  84.7  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6989  alkylhydroperoxidase  41.82 
 
 
151 aa  84.7  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.793098  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8880  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.55 
 
 
156 aa  84.3  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0021  alkylhydroperoxidase  38.3 
 
 
158 aa  84  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106747  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.29 
 
 
145 aa  84  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  34.21 
 
 
150 aa  84  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  32.05 
 
 
157 aa  83.6  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3272  alkylhydroperoxidase  39.16 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.09 
 
 
143 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0761488 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 
159 aa  83.6  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.84 
 
 
143 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0013  alkylhydroperoxidase  38.3 
 
 
158 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  30.47 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3108  alkylhydroperoxidase  32.14 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.51 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3003  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  37.59 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047955 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2951  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  37.59 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0696867  normal  0.0134978 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2920  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  37.59 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789877  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1998  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.53 
 
 
159 aa  82.8  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3109  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  37.59 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280387  normal  0.494752 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
159 aa  82.8  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2986  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  37.59 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6812  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.36 
 
 
151 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  32.62 
 
 
145 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0811  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.8 
 
 
150 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1211  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.8 
 
 
150 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>