260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1660 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1660  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 
160 aa  330  5e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5624  alkylhydroperoxidase  49.29 
 
 
167 aa  141  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1182  alkylhydroperoxidase  46.1 
 
 
163 aa  133  8e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  50.77 
 
 
145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0029  alkylhydroperoxidase  43.45 
 
 
144 aa  125  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622456  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  50 
 
 
145 aa  124  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3440  alkylhydroperoxidase AhpD core  50.39 
 
 
152 aa  123  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  44.12 
 
 
146 aa  122  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0103  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.89 
 
 
157 aa  121  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.335572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.32 
 
 
150 aa  121  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3241  hypothetical protein  42.34 
 
 
144 aa  121  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.371033  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1128  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.67 
 
 
148 aa  121  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.453208 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  48.55 
 
 
145 aa  121  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3554  alkylhydroperoxidase  51.75 
 
 
151 aa  120  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.249618 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6087  alkylhydroperoxidase  50 
 
 
151 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6384  alkylhydroperoxidase  50 
 
 
151 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39128  normal  0.0625105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  48.84 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  48.55 
 
 
145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  48.55 
 
 
149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3734  alkylhydroperoxidase  34.97 
 
 
150 aa  118  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51777  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  50 
 
 
145 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  49.23 
 
 
146 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.46 
 
 
145 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50.79 
 
 
163 aa  118  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  53.04 
 
 
145 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  43.75 
 
 
153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.69 
 
 
145 aa  117  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  45.31 
 
 
145 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  47.83 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.69 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.41 
 
 
163 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  53.04 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  47.69 
 
 
145 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1680  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.31 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.581321  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2014  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  45.31 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6098  alkylhydroperoxidase  48.67 
 
 
149 aa  115  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  53.04 
 
 
145 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6989  alkylhydroperoxidase  51.4 
 
 
151 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.793098  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  52.17 
 
 
145 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  52.17 
 
 
145 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  52.17 
 
 
145 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3275  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.31 
 
 
159 aa  114  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  45.74 
 
 
154 aa  114  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  46.56 
 
 
162 aa  114  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3217  alkylhydroperoxidase-like protein  46.32 
 
 
157 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.08 
 
 
146 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  42 
 
 
154 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.74 
 
 
152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  48.74 
 
 
158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  51.3 
 
 
145 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  44.19 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.8 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  42.19 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  48.51 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8880  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.88 
 
 
156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6133  alkylhydroperoxidase AhpD core  50.47 
 
 
151 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.94 
 
 
151 aa  111  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0186  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50 
 
 
159 aa  112  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3956  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.92 
 
 
165 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405644  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4069  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.92 
 
 
165 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.44 
 
 
163 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1874  alkylhydroperoxidase  43.26 
 
 
149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.36 
 
 
155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  41.3 
 
 
150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  43.41 
 
 
159 aa  110  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.44 
 
 
163 aa  110  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.62 
 
 
153 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  44.96 
 
 
157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1943  hypothetical protein  35.42 
 
 
159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.278152  normal  0.0324993 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1929  alkylhydroperoxidase  43.26 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  43.61 
 
 
151 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2104  alkylhydroperoxidase  42.55 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  40 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3546  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.96 
 
 
147 aa  108  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.225278  normal  0.0570392 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1913  alkylhydroperoxidase  43.85 
 
 
149 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.84 
 
 
153 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4737  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.11 
 
 
152 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223994  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  39.42 
 
 
159 aa  107  7.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.69 
 
 
154 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4997  alkylhydroperoxidase AhpD core  50.38 
 
 
156 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.56474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5085  alkylhydroperoxidase  50.38 
 
 
156 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5378  alkylhydroperoxidase  50.38 
 
 
156 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28383  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.03 
 
 
147 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2658  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.11 
 
 
151 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.764156  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  42.75 
 
 
159 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.86 
 
 
159 aa  105  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  42.75 
 
 
159 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  39.29 
 
 
145 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8871  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.94 
 
 
161 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1998  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.13 
 
 
159 aa  105  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0996  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40.67 
 
 
283 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.353647  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.46 
 
 
159 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3259  alkylhydroperoxidase  39.42 
 
 
150 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.101599  normal  0.0335337 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.23 
 
 
159 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2023  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.79 
 
 
158 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0330638 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0996  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.77 
 
 
150 aa  102  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.710241  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0022  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.22 
 
 
156 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.76 
 
 
153 aa  101  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2015  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.84 
 
 
149 aa  101  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.419604  hitchhiker  0.00248557 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2448  alkylhydroperoxidase  41.84 
 
 
149 aa  101  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.19874  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>