239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0825 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0825  alkylhydroperoxidase  100 
 
 
169 aa  346  7e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3742  alkylhydroperoxidase  43.75 
 
 
169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0882  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.47 
 
 
151 aa  120  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0899  alkylhydroperoxidase  42.47 
 
 
151 aa  120  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0888  alkylhydroperoxidase  42.47 
 
 
151 aa  120  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.302466 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1128  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.84 
 
 
148 aa  114  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.453208 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4737  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.68 
 
 
152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223994  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0996  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.29 
 
 
150 aa  111  6e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.710241  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.57 
 
 
150 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406059  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  40.58 
 
 
152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3634  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.06 
 
 
164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1660  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.86 
 
 
160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.73 
 
 
152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2023  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.28 
 
 
158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0330638 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03920  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  43.24 
 
 
165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3259  alkylhydroperoxidase  43.57 
 
 
150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.101599  normal  0.0335337 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.34 
 
 
153 aa  108  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  40.71 
 
 
154 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0186  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.92 
 
 
159 aa  107  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2219  alkylhydroperoxidase  44.93 
 
 
147 aa  106  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108098  normal  0.214163 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3217  alkylhydroperoxidase-like protein  46.55 
 
 
157 aa  105  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  44.55 
 
 
158 aa  105  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  41.35 
 
 
156 aa  104  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  40.46 
 
 
159 aa  104  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1098  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.67 
 
 
152 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.574019 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.94 
 
 
146 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.59 
 
 
152 aa  102  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.95 
 
 
157 aa  102  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.1 
 
 
163 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0103  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.17 
 
 
157 aa  101  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.335572 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0606  putative redox protein  38.06 
 
 
157 aa  101  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.79 
 
 
145 aa  100  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.69 
 
 
154 aa  100  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  47.27 
 
 
155 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  40.3 
 
 
145 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.48 
 
 
146 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.05 
 
 
153 aa  99.8  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2269  alkylhydroperoxidase  38.06 
 
 
157 aa  99.8  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608052  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  43.36 
 
 
145 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3734  alkylhydroperoxidase  39.17 
 
 
150 aa  99  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51777  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.25 
 
 
145 aa  98.2  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1695  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.96 
 
 
157 aa  98.6  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.232521 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  43.36 
 
 
145 aa  98.2  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  44.95 
 
 
146 aa  97.8  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3826  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.86 
 
 
141 aa  97.8  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0148218  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40.65 
 
 
145 aa  97.4  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  38.06 
 
 
145 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.6 
 
 
159 aa  97.1  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  40.77 
 
 
154 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8880  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.16 
 
 
156 aa  97.1  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3275  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.18 
 
 
159 aa  96.3  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  36.88 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3440  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.17 
 
 
152 aa  96.3  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.3 
 
 
145 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.48 
 
 
145 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  43.36 
 
 
145 aa  96.3  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  42.48 
 
 
145 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  39.55 
 
 
145 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  42.48 
 
 
145 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40.65 
 
 
145 aa  96.3  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  40.65 
 
 
149 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  39.71 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.86 
 
 
147 aa  95.9  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.64 
 
 
155 aa  95.5  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  40.68 
 
 
145 aa  95.1  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0272  alkylhydroperoxidase  38.28 
 
 
150 aa  95.1  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300614  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40.65 
 
 
145 aa  94.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  36.57 
 
 
145 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  42.73 
 
 
143 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  40.91 
 
 
157 aa  94.4  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  36.88 
 
 
157 aa  94.4  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1680  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.85 
 
 
159 aa  94.4  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.581321  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2014  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  31.85 
 
 
159 aa  94.4  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.8 
 
 
163 aa  94  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.04 
 
 
145 aa  94  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  38.98 
 
 
147 aa  94  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8871  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.98 
 
 
161 aa  93.2  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.04 
 
 
145 aa  93.6  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.71 
 
 
163 aa  93.6  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.62 
 
 
159 aa  93.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  39.06 
 
 
145 aa  93.6  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.92 
 
 
159 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2935  hypothetical protein  40.98 
 
 
146 aa  92.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5624  alkylhydroperoxidase  37.5 
 
 
167 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.71 
 
 
163 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.64 
 
 
143 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  37.82 
 
 
147 aa  91.7  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2847  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.36 
 
 
158 aa  91.7  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150118  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.88 
 
 
152 aa  92  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.32 
 
 
151 aa  92  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3843  putative peroxidase  40.37 
 
 
167 aa  91.7  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.07 
 
 
155 aa  91.7  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.88 
 
 
143 aa  91.3  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0761488 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1182  alkylhydroperoxidase  37.5 
 
 
163 aa  91.3  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4997  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.38 
 
 
156 aa  90.9  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.56474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5085  alkylhydroperoxidase  41.38 
 
 
156 aa  90.9  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5378  alkylhydroperoxidase  41.38 
 
 
156 aa  90.9  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28383  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3554  alkylhydroperoxidase  40.34 
 
 
151 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.249618 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.46 
 
 
159 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1594  alkylhydroperoxidase  38.6 
 
 
144 aa  90.5  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.119891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>