267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5085 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4997  alkylhydroperoxidase AhpD core  100 
 
 
156 aa  316  7e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.56474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5085  alkylhydroperoxidase  100 
 
 
156 aa  316  7e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5378  alkylhydroperoxidase  100 
 
 
156 aa  316  7e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28383  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5624  alkylhydroperoxidase  71.79 
 
 
167 aa  223  7e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1182  alkylhydroperoxidase  67.95 
 
 
163 aa  210  5.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  55.15 
 
 
150 aa  148  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  48.53 
 
 
150 aa  138  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3734  alkylhydroperoxidase  44.83 
 
 
150 aa  134  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51777  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0029  alkylhydroperoxidase  49.26 
 
 
144 aa  134  6.0000000000000005e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622456  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1660  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50.38 
 
 
160 aa  128  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1128  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.84 
 
 
148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.453208 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  45.39 
 
 
159 aa  123  8.000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.55 
 
 
153 aa  123  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  48.3 
 
 
152 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  44.37 
 
 
146 aa  122  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  50.37 
 
 
145 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  50.37 
 
 
149 aa  121  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  49.63 
 
 
145 aa  120  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  43.88 
 
 
162 aa  120  8e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2179  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.65 
 
 
146 aa  120  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.48 
 
 
147 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0996  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.22 
 
 
150 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.710241  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  47.83 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.38 
 
 
152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.83 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.29 
 
 
159 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  49.63 
 
 
145 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1929  alkylhydroperoxidase  42.75 
 
 
149 aa  118  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  41.43 
 
 
147 aa  118  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.1 
 
 
145 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.86 
 
 
159 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.89 
 
 
153 aa  116  9e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  46.38 
 
 
145 aa  117  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.93 
 
 
146 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.38 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0013  alkylhydroperoxidase  45.99 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  46.38 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  46.38 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2104  alkylhydroperoxidase  41.3 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  48.41 
 
 
158 aa  115  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3554  alkylhydroperoxidase  51.79 
 
 
151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.249618 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.86 
 
 
159 aa  114  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3822  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.22 
 
 
152 aa  114  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176848  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0103  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.43 
 
 
157 aa  114  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.335572 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  42.47 
 
 
154 aa  114  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  44.68 
 
 
159 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  39.29 
 
 
147 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  43.17 
 
 
159 aa  113  8.999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.22 
 
 
150 aa  113  8.999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406059  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  44.85 
 
 
157 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6087  alkylhydroperoxidase  50 
 
 
151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.48 
 
 
145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.67 
 
 
146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0039  alkylhydroperoxidase  44.85 
 
 
158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0050  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.85 
 
 
158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464213  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6989  alkylhydroperoxidase  50.44 
 
 
151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.793098  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6384  alkylhydroperoxidase  50 
 
 
151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39128  normal  0.0625105 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0020  alkylhydroperoxidase  44.85 
 
 
158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0186  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  54.55 
 
 
159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  45.65 
 
 
145 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.55 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.48 
 
 
145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0021  alkylhydroperoxidase  43.38 
 
 
158 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106747  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6133  alkylhydroperoxidase AhpD core  50.44 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  42.86 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.77 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0021  alkylhydroperoxidase  44.85 
 
 
157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.26 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  42.86 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  44.2 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3205  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.12 
 
 
158 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.019288  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  44.6 
 
 
145 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3259  alkylhydroperoxidase  43.54 
 
 
150 aa  111  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.101599  normal  0.0335337 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.04 
 
 
152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1402  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.18 
 
 
146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  43.57 
 
 
145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2847  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.45 
 
 
158 aa  110  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150118  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1874  alkylhydroperoxidase  39.86 
 
 
149 aa  110  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  41.55 
 
 
159 aa  110  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.29 
 
 
155 aa  110  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.83 
 
 
163 aa  110  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  43.88 
 
 
145 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  42.86 
 
 
159 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6098  alkylhydroperoxidase  49.11 
 
 
149 aa  110  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.41 
 
 
152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2331  alkylhydroperoxidase  39.86 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.224128  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1695  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  54.95 
 
 
157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.232521 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.14 
 
 
159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  42.14 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.34 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  42.14 
 
 
159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1913  alkylhydroperoxidase  38.24 
 
 
149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2015  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.86 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.419604  hitchhiker  0.00248557 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2331  alkylhydroperoxidase  40.58 
 
 
149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  43.8 
 
 
157 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  51.24 
 
 
155 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.48 
 
 
145 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  46.43 
 
 
154 aa  108  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  42.14 
 
 
145 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3108  alkylhydroperoxidase  39.29 
 
 
159 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>