251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1874 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1874  alkylhydroperoxidase  100 
 
 
149 aa  306  5e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2104  alkylhydroperoxidase  97.32 
 
 
149 aa  296  6e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1929  alkylhydroperoxidase  93.96 
 
 
149 aa  291  3e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2331  alkylhydroperoxidase  84.56 
 
 
149 aa  261  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.224128  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2015  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  84.56 
 
 
149 aa  260  4e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.419604  hitchhiker  0.00248557 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2448  alkylhydroperoxidase  83.89 
 
 
149 aa  259  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.19874  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2331  alkylhydroperoxidase  83.22 
 
 
149 aa  256  6e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1913  alkylhydroperoxidase  81.88 
 
 
149 aa  253  5e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.25 
 
 
146 aa  141  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  45.52 
 
 
154 aa  136  8.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  48.59 
 
 
145 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  53.08 
 
 
155 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  47.65 
 
 
162 aa  134  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.59 
 
 
145 aa  134  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.89 
 
 
145 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.85 
 
 
145 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  47.55 
 
 
145 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  55.83 
 
 
151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  46.85 
 
 
145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  56.67 
 
 
151 aa  131  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.92 
 
 
152 aa  130  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  46.85 
 
 
145 aa  130  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.76 
 
 
153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.32 
 
 
163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  52.38 
 
 
155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  45.45 
 
 
145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0021  alkylhydroperoxidase  47.79 
 
 
157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  44.37 
 
 
145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.76 
 
 
146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  47.89 
 
 
154 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.45 
 
 
145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0021  alkylhydroperoxidase  48.18 
 
 
158 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106747  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0013  alkylhydroperoxidase  48.18 
 
 
158 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  45.45 
 
 
145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  44.37 
 
 
149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.45 
 
 
145 aa  127  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.04 
 
 
163 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.07 
 
 
145 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.85 
 
 
153 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  44.37 
 
 
145 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  45.07 
 
 
145 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  43.36 
 
 
153 aa  127  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.32 
 
 
163 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.76 
 
 
145 aa  126  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  44.83 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  44.78 
 
 
145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  44.59 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  47.14 
 
 
157 aa  124  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0606  putative redox protein  50 
 
 
157 aa  124  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.96 
 
 
145 aa  124  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  42.54 
 
 
145 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  44.78 
 
 
145 aa  123  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  45.11 
 
 
143 aa  122  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  45.27 
 
 
159 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  45.27 
 
 
159 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.95 
 
 
159 aa  123  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6098  alkylhydroperoxidase  45.99 
 
 
149 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  44.03 
 
 
145 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.93 
 
 
152 aa  121  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2061  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.06 
 
 
151 aa  121  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.27 
 
 
159 aa  121  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3108  alkylhydroperoxidase  43.66 
 
 
159 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.25 
 
 
152 aa  121  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.53 
 
 
159 aa  120  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2657  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.44 
 
 
149 aa  120  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0722342  normal  0.0242397 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  39.86 
 
 
157 aa  120  8e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.55 
 
 
153 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  43.24 
 
 
159 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5468  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.32 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3843  putative peroxidase  47.06 
 
 
167 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2269  alkylhydroperoxidase  47.66 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608052  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  45.83 
 
 
159 aa  118  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.94 
 
 
155 aa  117  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1680  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.38 
 
 
159 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.581321  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2014  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  41.38 
 
 
159 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.51 
 
 
159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  45.95 
 
 
159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.95 
 
 
159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  45.95 
 
 
159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5624  alkylhydroperoxidase  41.96 
 
 
167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3133  alkylhydroperoxidase  43.36 
 
 
158 aa  117  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0050  alkylhydroperoxidase AhpD core  50.38 
 
 
158 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464213  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0039  alkylhydroperoxidase  50.38 
 
 
158 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0020  alkylhydroperoxidase  50.38 
 
 
158 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.53 
 
 
159 aa  117  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.27 
 
 
159 aa  116  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3275  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.83 
 
 
159 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6087  alkylhydroperoxidase  42.57 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.86 
 
 
143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6384  alkylhydroperoxidase  42.57 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39128  normal  0.0625105 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.07 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3205  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.45 
 
 
158 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.019288  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2951  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  42.14 
 
 
144 aa  114  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0696867  normal  0.0134978 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3003  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  42.14 
 
 
144 aa  114  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047955 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6989  alkylhydroperoxidase  43.24 
 
 
151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.793098  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.51 
 
 
153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  39.58 
 
 
147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3554  alkylhydroperoxidase  42.57 
 
 
151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.249618 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6133  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.57 
 
 
151 aa  114  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.14 
 
 
143 aa  114  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0761488 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>