More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2053 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  100 
 
 
154 aa  318  9.999999999999999e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  60.96 
 
 
153 aa  185  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  52.38 
 
 
152 aa  184  4e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  52.67 
 
 
159 aa  176  8e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  54.79 
 
 
153 aa  175  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  53.42 
 
 
153 aa  173  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  50.98 
 
 
163 aa  167  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  52.48 
 
 
146 aa  164  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.63 
 
 
163 aa  164  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  51.75 
 
 
145 aa  163  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50.98 
 
 
163 aa  163  9e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  51.75 
 
 
145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  52.74 
 
 
155 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  51.75 
 
 
145 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  51.05 
 
 
145 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  51.05 
 
 
145 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.94 
 
 
145 aa  157  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  49.65 
 
 
146 aa  157  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  50.35 
 
 
145 aa  157  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  50.35 
 
 
145 aa  156  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.25 
 
 
145 aa  156  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  50 
 
 
155 aa  155  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  49.32 
 
 
153 aa  155  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  50.65 
 
 
154 aa  154  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.55 
 
 
145 aa  153  7e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  49.65 
 
 
145 aa  152  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  49.65 
 
 
149 aa  152  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  48.25 
 
 
145 aa  152  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  50.7 
 
 
162 aa  152  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  49.66 
 
 
154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  49.65 
 
 
157 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  47.55 
 
 
145 aa  151  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  50.71 
 
 
157 aa  150  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  48.23 
 
 
145 aa  149  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.45 
 
 
157 aa  149  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  48.95 
 
 
145 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.15 
 
 
145 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.55 
 
 
145 aa  148  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.89 
 
 
155 aa  147  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  50 
 
 
159 aa  147  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3843  putative peroxidase  50 
 
 
167 aa  144  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  53.51 
 
 
158 aa  144  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.1 
 
 
153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0021  alkylhydroperoxidase  47.14 
 
 
157 aa  142  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  51.88 
 
 
152 aa  143  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  48.91 
 
 
143 aa  142  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.55 
 
 
159 aa  141  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  45.65 
 
 
145 aa  141  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.85 
 
 
159 aa  140  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  52.11 
 
 
151 aa  140  7e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0050  alkylhydroperoxidase AhpD core  49.65 
 
 
158 aa  140  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464213  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0020  alkylhydroperoxidase  49.65 
 
 
158 aa  140  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0039  alkylhydroperoxidase  49.65 
 
 
158 aa  140  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  46.15 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.85 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.88 
 
 
163 aa  138  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1929  alkylhydroperoxidase  47.48 
 
 
149 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.55 
 
 
159 aa  138  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2847  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.73 
 
 
158 aa  138  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150118  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  47.55 
 
 
159 aa  138  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3133  alkylhydroperoxidase  48.23 
 
 
158 aa  138  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  47.55 
 
 
159 aa  138  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  47.55 
 
 
159 aa  138  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.9 
 
 
147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5468  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.86 
 
 
156 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4773  alkylhydroperoxidase  45.58 
 
 
157 aa  137  4.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.792481  normal  0.557734 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  52.11 
 
 
151 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  44.2 
 
 
145 aa  137  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4737  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.79 
 
 
152 aa  136  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223994  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0791  alkylhydroperoxidase  46.43 
 
 
167 aa  136  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1874  alkylhydroperoxidase  45.52 
 
 
149 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3205  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.81 
 
 
158 aa  136  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.019288  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0021  alkylhydroperoxidase  47.18 
 
 
158 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106747  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2104  alkylhydroperoxidase  45.52 
 
 
149 aa  136  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  44.06 
 
 
145 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2061  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.33 
 
 
151 aa  135  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0013  alkylhydroperoxidase  46.1 
 
 
158 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1680  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.81 
 
 
159 aa  134  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.581321  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2014  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  46.81 
 
 
159 aa  134  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  50 
 
 
156 aa  134  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.45 
 
 
159 aa  134  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.67 
 
 
150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3949  alkylhydroperoxidase  46.81 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  42.66 
 
 
145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.36 
 
 
159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  45.07 
 
 
146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3272  alkylhydroperoxidase  46.76 
 
 
152 aa  130  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  45.93 
 
 
150 aa  130  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2331  alkylhydroperoxidase  44.14 
 
 
149 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.99 
 
 
155 aa  130  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3822  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.6 
 
 
152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176848  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  45.45 
 
 
159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.45 
 
 
159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  45.45 
 
 
159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1333  alkylhydroperoxidase  41.67 
 
 
151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.59317 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1913  alkylhydroperoxidase  42.07 
 
 
149 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2331  alkylhydroperoxidase  43.45 
 
 
149 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.224128  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2015  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.45 
 
 
149 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.419604  hitchhiker  0.00248557 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.06 
 
 
159 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2448  alkylhydroperoxidase  43.45 
 
 
149 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.19874  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>