More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5297 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 		 155 aa  321  3e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  65.81 
 
 		 157 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  56.21 
 
 		 158 aa  179  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  51.95 
 
 		 162 aa  171  3.9999999999999995e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0272  alkylhydroperoxidase  47.71 
 
 		 150 aa  164  5.9999999999999996e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  49.66 
 
 		 157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  50 
 
 		 163 aa  161  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  52.05 
 
 		 153 aa  159  9e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  53.9 
 
 		 146 aa  159  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  52.11 
 
 		 152 aa  159  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  53.19 
 
 		 145 aa  157  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  51.06 
 
 		 145 aa  157  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  51.06 
 
 		 149 aa  157  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  52.48 
 
 		 145 aa  157  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  52.48 
 
 		 145 aa  157  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  50.35 
 
 		 145 aa  157  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  52.48 
 
 		 145 aa  156  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  51.77 
 
 		 145 aa  156  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  51.06 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48 
 
 		 163 aa  155  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6288  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.79 
 
 		 153 aa  155  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00669161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  51.06 
 
 		 145 aa  154  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  51.77 
 
 		 145 aa  154  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  50.35 
 
 		 145 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.33 
 
 		 163 aa  153  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.94 
 
 		 145 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  50.35 
 
 		 145 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  52.48 
 
 		 155 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.94 
 
 		 145 aa  152  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.23 
 
 		 145 aa  150  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  49.3 
 
 		 159 aa  150  8.999999999999999e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.62 
 
 		 151 aa  149  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  49.65 
 
 		 145 aa  149  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  47.89 
 
 		 154 aa  147  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.81 
 
 		 145 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  45.1 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.81 
 
 		 146 aa  145  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  45.27 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  51.06 
 
 		 155 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.59 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  44.59 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  44.59 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3554  alkylhydroperoxidase  45.77 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.249618 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  44.52 
 
 		 159 aa  140  6e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  45.58 
 
 		 151 aa  140  7e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  43.24 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.45 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  43.24 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6989  alkylhydroperoxidase  44.37 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.793098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.84 
 
 		 159 aa  138  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.47 
 
 		 159 aa  138  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6384  alkylhydroperoxidase  45.07 
 
 		 151 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39128  normal  0.0625105 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6087  alkylhydroperoxidase  45.07 
 
 		 151 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  43.15 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.48 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.36 
 
 		 153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.76 
 
 		 155 aa  134  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6098  alkylhydroperoxidase  44.37 
 
 		 149 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  44 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0996  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  44.6 
 
 		 283 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.353647  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  45 
 
 		 145 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  42.14 
 
 		 145 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  45.39 
 
 		 146 aa  133  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4737  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.36 
 
 		 152 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  42.14 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3822  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.19 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.78 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3133  alkylhydroperoxidase  46.48 
 
 		 158 aa  131  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.78 
 
 		 159 aa  131  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.41 
 
 		 159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1369  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  43.26 
 
 		 150 aa  130  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.1 
 
 		 159 aa  130  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0811  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  43.26 
 
 		 150 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1900  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  43.26 
 
 		 150 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6133  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.72 
 
 		 151 aa  130  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1219  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  43.26 
 
 		 150 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1057  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  43.26 
 
 		 150 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1333  alkylhydroperoxidase  42.96 
 
 		 151 aa  130  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.59317 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.45 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.51 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  42.14 
 
 		 147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1070  alkylhydroperoxidase  43.51 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1211  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  43.17 
 
 		 150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5468  alkylhydroperoxidase AhpD core  54.05 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  43.57 
 
 		 145 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  42.14 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1998  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.19 
 
 		 159 aa  127  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0022  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.9 
 
 		 156 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2623  alkylhydroperoxidase  43.51 
 
 		 153 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  42.55 
 
 		 143 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.67 
 
 		 154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  43.57 
 
 		 157 aa  127  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3734  alkylhydroperoxidase  40.41 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51777  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.97 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.41 
 
 		 163 aa  125  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000236  4-carboxymuconolactone decarboxylase domain/alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  40.26 
 
 		 153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0186  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.23 
 
 		 159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6705  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.24 
 
 		 158 aa  124  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.625581  normal  0.389522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  44.2 
 
 		 152 aa  124  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3720  alkylhydroperoxidase  43.97 
 
 		 143 aa  124  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>