247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000236 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000236  4-carboxymuconolactone decarboxylase domain/alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  100 
 
 		 153 aa  320  4e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2623  alkylhydroperoxidase  64.71 
 
 		 153 aa  213  8e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1070  alkylhydroperoxidase  61.44 
 
 		 153 aa  204  5e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1341  alkylhydroperoxidase  59.87 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.728032 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2464  alkylhydroperoxidase  56.29 
 
 		 151 aa  181  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4693  alkylhydroperoxidase  55.33 
 
 		 149 aa  176  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2738  alkylhydroperoxidase  46.62 
 
 		 147 aa  144  6e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0546441  hitchhiker  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  45.45 
 
 		 158 aa  143  8.000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.65 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  40 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.06 
 
 		 163 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.42 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0272  alkylhydroperoxidase  40.4 
 
 		 150 aa  124  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300614  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.26 
 
 		 155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.84 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.41 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  42.96 
 
 		 147 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  37.58 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.04 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.67 
 
 		 155 aa  114  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.74 
 
 		 153 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  40.85 
 
 		 147 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  51.89 
 
 		 155 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.53 
 
 		 157 aa  110  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  39.04 
 
 		 145 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.99 
 
 		 145 aa  110  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.04 
 
 		 145 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.04 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  39.73 
 
 		 145 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.36 
 
 		 145 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  38.36 
 
 		 145 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2179  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40 
 
 		 146 aa  107  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.36 
 
 		 145 aa  107  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6989  alkylhydroperoxidase  37.41 
 
 		 151 aa  107  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.793098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  37.67 
 
 		 145 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6384  alkylhydroperoxidase  36.73 
 
 		 151 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39128  normal  0.0625105 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6087  alkylhydroperoxidase  36.73 
 
 		 151 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  39.73 
 
 		 145 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  39.73 
 
 		 145 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  39.73 
 
 		 149 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6133  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.73 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  37.67 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3554  alkylhydroperoxidase  36.73 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.249618 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  40.51 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.3 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  39.73 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  38.36 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.61 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0791  alkylhydroperoxidase  40.54 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.04 
 
 		 145 aa  104  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  35.62 
 
 		 154 aa  103  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4737  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.36 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  36.88 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  36.3 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2877  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.78 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1327  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.86 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.284107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  36.99 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3949  alkylhydroperoxidase  39.04 
 
 		 156 aa  102  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3241  hypothetical protein  34.46 
 
 		 144 aa  100  8e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.371033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.36 
 
 		 153 aa  100  9e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6098  alkylhydroperoxidase  34.69 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.67 
 
 		 153 aa  99.4  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.07 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38 
 
 		 159 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3196  alkylhydroperoxidase  38.4 
 
 		 167 aa  98.6  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  38.56 
 
 		 159 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  35.81 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7113  hypothetical protein  38.71 
 
 		 154 aa  98.6  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.49 
 
 		 153 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1998  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.71 
 
 		 159 aa  97.8  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  33.77 
 
 		 159 aa  97.4  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  33.77 
 
 		 159 aa  97.4  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  43.1 
 
 		 151 aa  97.8  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3205  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.67 
 
 		 158 aa  97.4  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.019288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.1 
 
 		 151 aa  97.1  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.32 
 
 		 150 aa  97.4  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0050  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.67 
 
 		 158 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464213  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.91 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0022  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.44 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0020  alkylhydroperoxidase  37.67 
 
 		 158 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  37.91 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3734  alkylhydroperoxidase  35.95 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51777  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0039  alkylhydroperoxidase  37.67 
 
 		 158 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.44 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6705  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.58 
 
 		 158 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.625581  normal  0.389522 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.91 
 
 		 159 aa  94.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.43 
 
 		 155 aa  94.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1333  alkylhydroperoxidase  34.39 
 
 		 151 aa  94  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.59317 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2847  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.37 
 
 		 158 aa  94  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3133  alkylhydroperoxidase  37.84 
 
 		 158 aa  93.2  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  35.76 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.75 
 
 		 154 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3843  putative peroxidase  45.71 
 
 		 167 aa  93.6  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5805  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.31 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0418506  normal  0.111709 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0013  alkylhydroperoxidase  35.62 
 
 		 158 aa  93.6  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  37.24 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3822  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.99 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2565  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.55 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.929389  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0029  alkylhydroperoxidase  38.57 
 
 		 144 aa  92.8  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622456  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6288  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.39 
 
 		 153 aa  91.7  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00669161  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>