More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3241 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3241  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  293  5e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.371033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1943  hypothetical protein  46.48 
 
 		 159 aa  148  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.278152  normal  0.0324993 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0029  alkylhydroperoxidase  47.55 
 
 		 144 aa  142  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622456  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3734  alkylhydroperoxidase  46.15 
 
 		 150 aa  142  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51777  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2179  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.48 
 
 		 146 aa  142  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.88 
 
 		 163 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.88 
 
 		 163 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.73 
 
 		 145 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  42.45 
 
 		 145 aa  134  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.01 
 
 		 163 aa  133  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  40.97 
 
 		 159 aa  131  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.73 
 
 		 145 aa  131  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  41.73 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  41.73 
 
 		 157 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  41.13 
 
 		 146 aa  130  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.45 
 
 		 145 aa  130  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.57 
 
 		 145 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.01 
 
 		 145 aa  128  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.01 
 
 		 145 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.13 
 
 		 145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3098  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.75 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000850498  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.85 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  38.85 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.73 
 
 		 146 aa  124  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  38.13 
 
 		 145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  39.57 
 
 		 153 aa  124  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.29 
 
 		 146 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  38.13 
 
 		 145 aa  123  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  38.13 
 
 		 145 aa  122  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  40 
 
 		 162 aa  122  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.13 
 
 		 145 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  38.13 
 
 		 145 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.89 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.13 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3554  alkylhydroperoxidase  40.71 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.249618 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6989  alkylhydroperoxidase  40.71 
 
 		 151 aa  121  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.793098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  38.13 
 
 		 145 aa  121  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1660  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.34 
 
 		 160 aa  121  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.19 
 
 		 153 aa  120  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.58 
 
 		 152 aa  120  8e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  37.76 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  38.19 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6087  alkylhydroperoxidase  39.29 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6384  alkylhydroperoxidase  39.29 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39128  normal  0.0625105 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6133  alkylhydroperoxidase AhpD core  40 
 
 		 151 aa  118  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  41.91 
 
 		 152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.76 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6098  alkylhydroperoxidase  39.29 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  40 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4773  alkylhydroperoxidase  42.36 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.792481  normal  0.557734 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.58 
 
 		 155 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.42 
 
 		 147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3217  alkylhydroperoxidase-like protein  42.96 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  38.46 
 
 		 145 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  38.03 
 
 		 145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.69 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1128  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.72 
 
 		 148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.453208 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  37.76 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  37.14 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.44 
 
 		 151 aa  111  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.41 
 
 		 157 aa  110  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5624  alkylhydroperoxidase  39.29 
 
 		 167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.97 
 
 		 163 aa  110  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1182  alkylhydroperoxidase  41.01 
 
 		 163 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  39.13 
 
 		 150 aa  110  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  38.03 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.97 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  35.97 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  35.97 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0996  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.17 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.710241  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  40.44 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7113  hypothetical protein  41.26 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4737  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.72 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.72 
 
 		 150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  33.81 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  38.85 
 
 		 157 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.93 
 
 		 154 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  33.81 
 
 		 147 aa  107  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  37.24 
 
 		 154 aa  107  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6288  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.97 
 
 		 153 aa  106  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00669161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.53 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1402  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.3 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.5 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.75 
 
 		 159 aa  105  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0103  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.17 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.335572 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.81 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  35.25 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3108  alkylhydroperoxidase  36.17 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2464  alkylhydroperoxidase  38.57 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.59 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  33.09 
 
 		 159 aa  104  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  36.81 
 
 		 155 aa  103  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.48 
 
 		 150 aa  103  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406059  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2565  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.55 
 
 		 129 aa  103  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.929389  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3376  alkylhydroperoxidase  41.04 
 
 		 154 aa  102  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4693  alkylhydroperoxidase  37.14 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0272  alkylhydroperoxidase  35.56 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300614  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 		 159 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.81 
 
 		 159 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.17 
 
 		 143 aa  100  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0761488 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>