255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3843 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3843  putative peroxidase  100 
 
 		 167 aa  343  8.999999999999999e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5468  alkylhydroperoxidase AhpD core  86.9 
 
 		 156 aa  271  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0021  alkylhydroperoxidase  77.24 
 
 		 157 aa  246  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  77.93 
 
 		 157 aa  244  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0013  alkylhydroperoxidase  76.71 
 
 		 158 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0021  alkylhydroperoxidase  76.03 
 
 		 158 aa  239  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3205  alkylhydroperoxidase AhpD core  76.71 
 
 		 158 aa  236  8e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.019288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0039  alkylhydroperoxidase  78.32 
 
 		 158 aa  234  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0050  alkylhydroperoxidase AhpD core  78.32 
 
 		 158 aa  234  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464213  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0020  alkylhydroperoxidase  78.32 
 
 		 158 aa  234  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3949  alkylhydroperoxidase  67.74 
 
 		 156 aa  231  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2061  alkylhydroperoxidase AhpD core  66.89 
 
 		 151 aa  218  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  57.69 
 
 		 155 aa  171  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  57.14 
 
 		 152 aa  170  7.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  54.49 
 
 		 155 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  53.9 
 
 		 154 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  53.5 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  53.57 
 
 		 145 aa  149  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  52.14 
 
 		 145 aa  148  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.43 
 
 		 145 aa  148  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  51.77 
 
 		 158 aa  147  6e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  53.57 
 
 		 145 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  53.57 
 
 		 149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  50 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  50 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  50 
 
 		 146 aa  144  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  50.71 
 
 		 145 aa  143  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  52.86 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  52.86 
 
 		 145 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  51.43 
 
 		 145 aa  142  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  50.71 
 
 		 145 aa  140  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  51.63 
 
 		 153 aa  140  7e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  49.29 
 
 		 153 aa  140  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.43 
 
 		 146 aa  138  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  49.64 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  50.7 
 
 		 145 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  48.57 
 
 		 145 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.71 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.14 
 
 		 145 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.86 
 
 		 145 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  47.86 
 
 		 145 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.14 
 
 		 145 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  49.3 
 
 		 145 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  47.14 
 
 		 145 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  49.29 
 
 		 157 aa  134  5e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  46.43 
 
 		 145 aa  134  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  46.43 
 
 		 145 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.86 
 
 		 163 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.86 
 
 		 163 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.43 
 
 		 145 aa  131  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.14 
 
 		 163 aa  130  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.14 
 
 		 159 aa  130  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  49.3 
 
 		 145 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45 
 
 		 159 aa  127  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  55.26 
 
 		 151 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.71 
 
 		 153 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45 
 
 		 153 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4737  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.26 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3133  alkylhydroperoxidase  51.09 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  47.18 
 
 		 145 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4773  alkylhydroperoxidase  46.1 
 
 		 157 aa  124  9e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.792481  normal  0.557734 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  46.76 
 
 		 143 aa  123  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  53.51 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50.45 
 
 		 155 aa  121  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1874  alkylhydroperoxidase  47.06 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.86 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.86 
 
 		 159 aa  119  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2104  alkylhydroperoxidase  47.06 
 
 		 149 aa  118  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.14 
 
 		 159 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  42.86 
 
 		 159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.44 
 
 		 155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  40.58 
 
 		 159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1929  alkylhydroperoxidase  46.32 
 
 		 149 aa  117  7e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0606  putative redox protein  46.9 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.14 
 
 		 159 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2269  alkylhydroperoxidase  46.9 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608052  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0791  alkylhydroperoxidase  45.71 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  39.01 
 
 		 147 aa  115  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  54.21 
 
 		 152 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  39.72 
 
 		 147 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.86 
 
 		 159 aa  114  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  40.14 
 
 		 159 aa  114  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  40.14 
 
 		 159 aa  114  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.38 
 
 		 147 aa  114  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1998  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.86 
 
 		 159 aa  114  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  41.43 
 
 		 159 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1913  alkylhydroperoxidase  50.89 
 
 		 149 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.9 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  43.07 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.14 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  42.14 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2847  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.83 
 
 		 158 aa  112  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  42.14 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3108  alkylhydroperoxidase  40 
 
 		 159 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6098  alkylhydroperoxidase  43.66 
 
 		 149 aa  111  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0029  alkylhydroperoxidase  49.12 
 
 		 144 aa  111  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622456  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2015  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50 
 
 		 149 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.419604  hitchhiker  0.00248557 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2448  alkylhydroperoxidase  50 
 
 		 149 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.19874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2331  alkylhydroperoxidase  50 
 
 		 149 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.224128  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.78 
 
 		 150 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>