283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2344 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 
159 aa  330  4e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  86.16 
 
 
159 aa  297  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  86.16 
 
 
159 aa  297  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  86.16 
 
 
159 aa  296  8e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  85.53 
 
 
159 aa  296  9e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  87.97 
 
 
159 aa  295  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  83.65 
 
 
159 aa  291  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  81.65 
 
 
159 aa  286  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  75.95 
 
 
159 aa  264  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  73.42 
 
 
159 aa  258  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  73.42 
 
 
159 aa  257  5.0000000000000005e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  72.78 
 
 
159 aa  256  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  75.32 
 
 
159 aa  250  6e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  75.32 
 
 
159 aa  250  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1998  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  70.44 
 
 
159 aa  237  4e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3108  alkylhydroperoxidase  59.49 
 
 
159 aa  209  9e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  50.63 
 
 
159 aa  176  8e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  51.02 
 
 
162 aa  167  7e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  49.32 
 
 
163 aa  164  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.71 
 
 
153 aa  157  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.58 
 
 
163 aa  152  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.89 
 
 
163 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  46.21 
 
 
145 aa  150  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.28 
 
 
146 aa  149  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.63 
 
 
157 aa  149  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.61 
 
 
154 aa  149  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.89 
 
 
151 aa  145  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.55 
 
 
152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  42.76 
 
 
145 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  49.3 
 
 
153 aa  143  9e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  44.52 
 
 
157 aa  143  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  47.89 
 
 
151 aa  142  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  46.85 
 
 
159 aa  142  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  44.83 
 
 
145 aa  140  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  42.18 
 
 
149 aa  140  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  46.98 
 
 
154 aa  140  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.76 
 
 
145 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.45 
 
 
145 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  44.44 
 
 
145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.47 
 
 
155 aa  138  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.14 
 
 
145 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  41.38 
 
 
145 aa  137  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.07 
 
 
145 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.07 
 
 
145 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0272  alkylhydroperoxidase  44.52 
 
 
150 aa  136  8.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300614  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.07 
 
 
145 aa  136  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.75 
 
 
145 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3133  alkylhydroperoxidase  47.18 
 
 
158 aa  136  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  43.75 
 
 
145 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  44.44 
 
 
145 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.07 
 
 
145 aa  135  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.75 
 
 
145 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  43.71 
 
 
158 aa  135  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.07 
 
 
145 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  43.06 
 
 
145 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0606  putative redox protein  45.14 
 
 
157 aa  134  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  45.45 
 
 
154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  43.06 
 
 
153 aa  133  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  42.36 
 
 
145 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.75 
 
 
146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  41.67 
 
 
145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  41.43 
 
 
147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.5 
 
 
150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2269  alkylhydroperoxidase  43.75 
 
 
157 aa  131  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608052  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.45 
 
 
155 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  40.28 
 
 
145 aa  130  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.14 
 
 
153 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  45.71 
 
 
157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  45.45 
 
 
155 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  40 
 
 
147 aa  128  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.44 
 
 
153 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  43.8 
 
 
143 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2014  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  37.14 
 
 
159 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1680  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.14 
 
 
159 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.581321  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1929  alkylhydroperoxidase  47.3 
 
 
149 aa  125  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.85 
 
 
152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6288  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.93 
 
 
153 aa  124  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00669161  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.43 
 
 
155 aa  123  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1874  alkylhydroperoxidase  45.95 
 
 
149 aa  123  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2104  alkylhydroperoxidase  45.95 
 
 
149 aa  123  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0013  alkylhydroperoxidase  43.97 
 
 
158 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1913  alkylhydroperoxidase  43.92 
 
 
149 aa  123  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.14 
 
 
152 aa  121  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0021  alkylhydroperoxidase  42.86 
 
 
157 aa  122  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5624  alkylhydroperoxidase  44.6 
 
 
167 aa  121  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2658  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.07 
 
 
151 aa  121  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.764156  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  39.16 
 
 
150 aa  121  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1402  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.73 
 
 
146 aa  121  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0021  alkylhydroperoxidase  43.97 
 
 
158 aa  120  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106747  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  37.93 
 
 
146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6098  alkylhydroperoxidase  37.84 
 
 
149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2331  alkylhydroperoxidase  44.59 
 
 
149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2061  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.86 
 
 
151 aa  118  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4773  alkylhydroperoxidase  41.55 
 
 
157 aa  118  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.792481  normal  0.557734 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40 
 
 
147 aa  117  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6133  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.62 
 
 
151 aa  117  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2015  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.92 
 
 
149 aa  117  7e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.419604  hitchhiker  0.00248557 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2448  alkylhydroperoxidase  43.92 
 
 
149 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.19874  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2331  alkylhydroperoxidase  43.92 
 
 
149 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.224128  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6989  alkylhydroperoxidase  37.93 
 
 
151 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.793098  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>