264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0021 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0021  alkylhydroperoxidase  100 
 
 		 158 aa  323  5e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0013  alkylhydroperoxidase  98.1 
 
 		 158 aa  317  6e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0021  alkylhydroperoxidase  93.04 
 
 		 157 aa  278  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3205  alkylhydroperoxidase AhpD core  92.41 
 
 		 158 aa  263  7e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.019288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0050  alkylhydroperoxidase AhpD core  94.41 
 
 		 158 aa  259  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464213  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0020  alkylhydroperoxidase  94.41 
 
 		 158 aa  259  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0039  alkylhydroperoxidase  93.71 
 
 		 158 aa  259  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  77.85 
 
 		 157 aa  245  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5468  alkylhydroperoxidase AhpD core  77.4 
 
 		 156 aa  240  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3843  putative peroxidase  76.03 
 
 		 167 aa  239  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3949  alkylhydroperoxidase  69.68 
 
 		 156 aa  220  6e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2061  alkylhydroperoxidase AhpD core  69.08 
 
 		 151 aa  210  4.9999999999999996e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  53.25 
 
 		 152 aa  159  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  57.05 
 
 		 155 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  54.19 
 
 		 154 aa  150  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  56.94 
 
 		 155 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  53.21 
 
 		 154 aa  147  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  54.23 
 
 		 159 aa  142  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  52.26 
 
 		 153 aa  140  7e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.94 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  49.65 
 
 		 145 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  48.41 
 
 		 162 aa  137  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  50.35 
 
 		 145 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  50.35 
 
 		 149 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  47.18 
 
 		 154 aa  137  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.94 
 
 		 146 aa  136  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  48.39 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  49.65 
 
 		 145 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  48.23 
 
 		 145 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  48.59 
 
 		 145 aa  133  9e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  57.14 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50.7 
 
 		 153 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.68 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  46.81 
 
 		 145 aa  131  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  46.81 
 
 		 145 aa  130  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  44.68 
 
 		 145 aa  130  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.1 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.39 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2104  alkylhydroperoxidase  48.91 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  45.39 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  53.39 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1874  alkylhydroperoxidase  48.18 
 
 		 149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  44.68 
 
 		 145 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.59 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  44.68 
 
 		 145 aa  128  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1929  alkylhydroperoxidase  48.18 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  51.26 
 
 		 152 aa  127  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  48.25 
 
 		 145 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  46.81 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.36 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4773  alkylhydroperoxidase  53.04 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.792481  normal  0.557734 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.32 
 
 		 153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  51.69 
 
 		 145 aa  124  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.55 
 
 		 146 aa  123  9e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.18 
 
 		 159 aa  123  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  50.85 
 
 		 145 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.68 
 
 		 159 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.77 
 
 		 163 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  50 
 
 		 152 aa  122  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.26 
 
 		 157 aa  121  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  53.91 
 
 		 151 aa  120  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.97 
 
 		 159 aa  120  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4737  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.51 
 
 		 152 aa  120  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.68 
 
 		 163 aa  120  9e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.55 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.55 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.97 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  45 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.43 
 
 		 147 aa  118  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3133  alkylhydroperoxidase  49.64 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2015  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.26 
 
 		 149 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.419604  hitchhiker  0.00248557 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  43.97 
 
 		 159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2331  alkylhydroperoxidase  45.26 
 
 		 149 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.224128  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.26 
 
 		 159 aa  117  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2448  alkylhydroperoxidase  45.26 
 
 		 149 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.19874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.97 
 
 		 159 aa  117  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2331  alkylhydroperoxidase  44.53 
 
 		 149 aa  116  9e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.96 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  52.17 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0791  alkylhydroperoxidase  46.43 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1913  alkylhydroperoxidase  45.99 
 
 		 149 aa  115  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  41.84 
 
 		 159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.84 
 
 		 159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  41.84 
 
 		 159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.84 
 
 		 159 aa  114  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  40.56 
 
 		 159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  40.56 
 
 		 159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  47.92 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  42.03 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  43.26 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0606  putative redox protein  47.37 
 
 		 157 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3275  alkylhydroperoxidase AhpD core  49.11 
 
 		 159 aa  111  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  42.14 
 
 		 159 aa  111  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5624  alkylhydroperoxidase  44.85 
 
 		 167 aa  110  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2269  alkylhydroperoxidase  47.37 
 
 		 157 aa  110  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608052  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.55 
 
 		 155 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.44 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1998  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.97 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  38.73 
 
 		 147 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0186  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.6 
 
 		 159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>