268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1010 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  100 
 
 		 153 aa  320  3e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  59.73 
 
 		 162 aa  196  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  57.72 
 
 		 152 aa  195  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  59.59 
 
 		 157 aa  194  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  60.81 
 
 		 158 aa  190  6e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  57.04 
 
 		 145 aa  188  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  57.04 
 
 		 149 aa  188  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  60.69 
 
 		 163 aa  187  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  57.04 
 
 		 145 aa  186  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  56.34 
 
 		 145 aa  186  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  55.63 
 
 		 145 aa  184  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  57.24 
 
 		 163 aa  183  9e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  56.55 
 
 		 163 aa  181  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  54.23 
 
 		 145 aa  174  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  61.36 
 
 		 155 aa  173  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  52.11 
 
 		 145 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  53.52 
 
 		 145 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  59.7 
 
 		 155 aa  170  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  52.82 
 
 		 145 aa  170  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  51.06 
 
 		 145 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  52.82 
 
 		 146 aa  170  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  51.06 
 
 		 145 aa  169  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  51.77 
 
 		 145 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  51.41 
 
 		 145 aa  169  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  51.06 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  51.06 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  59.09 
 
 		 157 aa  169  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  51.06 
 
 		 145 aa  167  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  53.19 
 
 		 145 aa  167  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  51.06 
 
 		 145 aa  166  8e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  52.48 
 
 		 146 aa  166  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.77 
 
 		 145 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  49.34 
 
 		 159 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  52.82 
 
 		 145 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.68 
 
 		 159 aa  164  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  48.68 
 
 		 159 aa  164  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  51.77 
 
 		 145 aa  163  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  50 
 
 		 159 aa  163  8e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  52.11 
 
 		 145 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  54.41 
 
 		 151 aa  160  8.000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  52.05 
 
 		 155 aa  159  9e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.71 
 
 		 159 aa  159  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  51.45 
 
 		 143 aa  158  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.71 
 
 		 159 aa  157  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.39 
 
 		 159 aa  157  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  54.41 
 
 		 151 aa  157  7e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.71 
 
 		 159 aa  156  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  49.32 
 
 		 154 aa  155  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  46.71 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3133  alkylhydroperoxidase  50.7 
 
 		 158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.42 
 
 		 159 aa  152  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  50.68 
 
 		 153 aa  152  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  45.39 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  45.39 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  48.99 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.08 
 
 		 159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  50 
 
 		 152 aa  150  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  42.11 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  53.47 
 
 		 154 aa  149  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50 
 
 		 154 aa  147  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  45.39 
 
 		 159 aa  147  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.42 
 
 		 159 aa  147  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3108  alkylhydroperoxidase  44.08 
 
 		 159 aa  147  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  49.3 
 
 		 150 aa  147  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1998  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.76 
 
 		 159 aa  147  7e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.48 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  51.09 
 
 		 157 aa  145  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0272  alkylhydroperoxidase  54.84 
 
 		 150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300614  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.76 
 
 		 153 aa  144  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2179  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.59 
 
 		 146 aa  144  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2565  alkylhydroperoxidase AhpD core  67.33 
 
 		 129 aa  143  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.929389  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  46.1 
 
 		 146 aa  143  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  45.77 
 
 		 150 aa  140  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3843  putative peroxidase  57.66 
 
 		 167 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0606  putative redox protein  43.45 
 
 		 157 aa  137  6e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2014  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  45.71 
 
 		 159 aa  137  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1680  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.71 
 
 		 159 aa  137  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.581321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  45.99 
 
 		 147 aa  137  7e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0029  alkylhydroperoxidase  49.63 
 
 		 144 aa  137  7.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622456  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2269  alkylhydroperoxidase  43.45 
 
 		 157 aa  136  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608052  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5468  alkylhydroperoxidase AhpD core  52.71 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  45.99 
 
 		 147 aa  136  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0021  alkylhydroperoxidase  48.18 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3949  alkylhydroperoxidase  53.98 
 
 		 156 aa  134  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2061  alkylhydroperoxidase AhpD core  53.51 
 
 		 151 aa  134  5e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4737  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  49.62 
 
 		 152 aa  133  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.73 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.67 
 
 		 152 aa  131  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.58 
 
 		 163 aa  131  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3554  alkylhydroperoxidase  42.96 
 
 		 151 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.249618 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6087  alkylhydroperoxidase  43.66 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6384  alkylhydroperoxidase  43.66 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39128  normal  0.0625105 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2847  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.06 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6098  alkylhydroperoxidase  42.25 
 
 		 149 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  47.01 
 
 		 156 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3205  alkylhydroperoxidase AhpD core  50.77 
 
 		 158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.019288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4773  alkylhydroperoxidase  46.88 
 
 		 157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.792481  normal  0.557734 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6133  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.96 
 
 		 151 aa  126  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6989  alkylhydroperoxidase  42.25 
 
 		 151 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.793098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7113  hypothetical protein  42.38 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>