262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1341 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1341  alkylhydroperoxidase  100 
 
 		 156 aa  328  2e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.728032 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2623  alkylhydroperoxidase  73.03 
 
 		 153 aa  241  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1070  alkylhydroperoxidase  71.71 
 
 		 153 aa  232  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000236  4-carboxymuconolactone decarboxylase domain/alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  59.87 
 
 		 153 aa  201  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2464  alkylhydroperoxidase  55.63 
 
 		 151 aa  178  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4693  alkylhydroperoxidase  57.33 
 
 		 149 aa  173  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2738  alkylhydroperoxidase  47.3 
 
 		 147 aa  145  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0546441  hitchhiker  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  43.87 
 
 		 158 aa  133  8e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  41.94 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.88 
 
 		 163 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.45 
 
 		 155 aa  123  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.65 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.91 
 
 		 163 aa  117  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  41.96 
 
 		 147 aa  117  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.1 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  40.28 
 
 		 147 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  42.75 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.47 
 
 		 152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.96 
 
 		 153 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0272  alkylhydroperoxidase  40.4 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300614  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.73 
 
 		 146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  37.67 
 
 		 145 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.11 
 
 		 155 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.67 
 
 		 145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.22 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.99 
 
 		 145 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  36.99 
 
 		 145 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3196  alkylhydroperoxidase  37.33 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  36.99 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  36.99 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.91 
 
 		 151 aa  104  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7113  hypothetical protein  41.29 
 
 		 154 aa  104  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  36.3 
 
 		 145 aa  103  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  47.71 
 
 		 154 aa  103  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  47.06 
 
 		 155 aa  103  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  43.09 
 
 		 159 aa  103  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.99 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  45.37 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3376  alkylhydroperoxidase  44.17 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.22 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.78 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  41.67 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.64 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  38.82 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  38.82 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  45.37 
 
 		 145 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  39.04 
 
 		 145 aa  101  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  42.28 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0013  alkylhydroperoxidase  40 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6989  alkylhydroperoxidase  40.94 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.793098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  45.37 
 
 		 145 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  45.37 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.86 
 
 		 145 aa  100  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0050  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.4 
 
 		 158 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464213  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0021  alkylhydroperoxidase  40 
 
 		 158 aa  100  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0020  alkylhydroperoxidase  42.4 
 
 		 158 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0039  alkylhydroperoxidase  42.4 
 
 		 158 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1327  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.5 
 
 		 150 aa  100  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.284107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.75 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3554  alkylhydroperoxidase  39.6 
 
 		 151 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.249618 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  36.3 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  41.26 
 
 		 154 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3949  alkylhydroperoxidase  42.55 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3205  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.8 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.019288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.86 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.33 
 
 		 155 aa  99  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1333  alkylhydroperoxidase  38.78 
 
 		 151 aa  99.4  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.59317 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  44.44 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6098  alkylhydroperoxidase  37.58 
 
 		 149 aa  97.4  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2179  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.14 
 
 		 146 aa  97.1  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0021  alkylhydroperoxidase  37.24 
 
 		 157 aa  97.1  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6705  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.17 
 
 		 158 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.625581  normal  0.389522 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1998  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.83 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0791  alkylhydroperoxidase  42.75 
 
 		 167 aa  96.7  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1929  alkylhydroperoxidase  48.15 
 
 		 149 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3108  alkylhydroperoxidase  39.07 
 
 		 159 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6288  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.13 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00669161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6133  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.6 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6087  alkylhydroperoxidase  36.91 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6384  alkylhydroperoxidase  36.91 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39128  normal  0.0625105 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2877  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.86 
 
 		 144 aa  94.7  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  44.86 
 
 		 157 aa  94.7  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3843  putative peroxidase  40 
 
 		 167 aa  94.4  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1913  alkylhydroperoxidase  47.22 
 
 		 149 aa  94.4  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2104  alkylhydroperoxidase  46.3 
 
 		 149 aa  94  8e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3275  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.97 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5805  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.17 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0418506  normal  0.111709 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  39.32 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  40.54 
 
 		 143 aa  92  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1874  alkylhydroperoxidase  45.37 
 
 		 149 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4773  alkylhydroperoxidase  47.62 
 
 		 157 aa  92.8  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.792481  normal  0.557734 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.71 
 
 		 154 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2331  alkylhydroperoxidase  47.22 
 
 		 149 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  37.25 
 
 		 159 aa  92  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  39.32 
 
 		 145 aa  92  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2847  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.28 
 
 		 158 aa  92  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2331  alkylhydroperoxidase  47.22 
 
 		 149 aa  91.7  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.224128  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2448  alkylhydroperoxidase  47.22 
 
 		 149 aa  91.7  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.19874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2015  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.22 
 
 		 149 aa  91.7  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.419604  hitchhiker  0.00248557 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.64 
 
 		 159 aa  91.3  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>