267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3376 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3376  alkylhydroperoxidase  100 
 
 
154 aa  309  9e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  55.7 
 
 
152 aa  174  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  49.66 
 
 
163 aa  149  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  46.1 
 
 
145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  49.15 
 
 
146 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.75 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  45.11 
 
 
145 aa  115  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  42.96 
 
 
159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  44.03 
 
 
154 aa  114  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.26 
 
 
146 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  41.13 
 
 
157 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  43.26 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  43.26 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  42.25 
 
 
162 aa  111  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  41.35 
 
 
145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  42.18 
 
 
158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.13 
 
 
146 aa  110  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5805  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.15 
 
 
152 aa  110  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0418506  normal  0.111709 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.13 
 
 
145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.84 
 
 
145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.79 
 
 
163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  41.48 
 
 
143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.26 
 
 
145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.55 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  42.55 
 
 
145 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.55 
 
 
150 aa  108  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  43.36 
 
 
156 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  41.84 
 
 
145 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  42.55 
 
 
145 aa  107  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3822  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.94 
 
 
152 aa  107  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176848  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.6 
 
 
145 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6705  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.36 
 
 
158 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.625581  normal  0.389522 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  42.55 
 
 
145 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  47.01 
 
 
159 aa  106  9.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  42.52 
 
 
145 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.55 
 
 
145 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  42.55 
 
 
145 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.55 
 
 
145 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6288  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.4 
 
 
153 aa  106  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00669161  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.03 
 
 
153 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.85 
 
 
145 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.3 
 
 
163 aa  104  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  40.94 
 
 
145 aa  104  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.3 
 
 
163 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  39.01 
 
 
150 aa  103  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3734  alkylhydroperoxidase  33.09 
 
 
150 aa  103  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51777  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  43.41 
 
 
151 aa  103  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.8 
 
 
151 aa  103  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.13 
 
 
155 aa  103  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0272  alkylhydroperoxidase  39.1 
 
 
150 aa  103  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3241  hypothetical protein  41.04 
 
 
144 aa  102  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.371033  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1341  alkylhydroperoxidase  44.17 
 
 
156 aa  102  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.728032 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  38.81 
 
 
159 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  38.81 
 
 
159 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1327  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.59 
 
 
150 aa  101  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.284107  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.68 
 
 
154 aa  100  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5624  alkylhydroperoxidase  37.09 
 
 
167 aa  99.4  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  43.31 
 
 
154 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  42.52 
 
 
145 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3272  alkylhydroperoxidase  41.91 
 
 
152 aa  99  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4773  alkylhydroperoxidase  45.83 
 
 
157 aa  99  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.792481  normal  0.557734 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.5 
 
 
155 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7113  hypothetical protein  45 
 
 
154 aa  98.2  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.48 
 
 
157 aa  97.8  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.1 
 
 
159 aa  97.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2269  alkylhydroperoxidase  45.69 
 
 
157 aa  97.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608052  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1070  alkylhydroperoxidase  39.86 
 
 
153 aa  97.4  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.26 
 
 
152 aa  97.1  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  36.88 
 
 
153 aa  97.1  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38 
 
 
150 aa  97.1  9e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1402  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.24 
 
 
146 aa  97.1  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.88 
 
 
143 aa  97.1  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  35.46 
 
 
159 aa  96.7  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.35 
 
 
159 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1660  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.73 
 
 
160 aa  95.5  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  40.16 
 
 
145 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1128  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.31 
 
 
148 aa  95.9  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.453208 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.12 
 
 
143 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0761488 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0996  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.26 
 
 
150 aa  95.1  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.710241  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1182  alkylhydroperoxidase  36.67 
 
 
163 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3259  alkylhydroperoxidase  37.58 
 
 
150 aa  94.7  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.101599  normal  0.0335337 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.57 
 
 
159 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.35 
 
 
159 aa  94.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1998  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.88 
 
 
159 aa  94.7  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  42.5 
 
 
155 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  32.03 
 
 
147 aa  94  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3109  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  39.06 
 
 
144 aa  94  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280387  normal  0.494752 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2920  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  39.06 
 
 
144 aa  94  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789877  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2986  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  39.06 
 
 
144 aa  94  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2951  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  38.64 
 
 
144 aa  93.6  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0696867  normal  0.0134978 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0606  putative redox protein  43.97 
 
 
157 aa  93.6  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3003  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  38.64 
 
 
144 aa  93.6  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047955 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2847  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.17 
 
 
158 aa  93.6  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150118  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  33.82 
 
 
147 aa  93.2  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1874  alkylhydroperoxidase  37.76 
 
 
149 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2452  hypothetical protein  40.94 
 
 
148 aa  92.8  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2353  alkylhydroperoxidase  43.7 
 
 
152 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0029  alkylhydroperoxidase  34.56 
 
 
144 aa  92  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622456  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.72 
 
 
152 aa  92  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1943  hypothetical protein  33.58 
 
 
159 aa  92.8  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.278152  normal  0.0324993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>