280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2353 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2353  alkylhydroperoxidase  100 
 
 
152 aa  314  3e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5352  hypothetical protein  60.53 
 
 
151 aa  171  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416302  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3822  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  58.11 
 
 
152 aa  169  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176848  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7127  hypothetical protein  62.91 
 
 
149 aa  168  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6041  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  56.29 
 
 
152 aa  163  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5805  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  53.69 
 
 
152 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0418506  normal  0.111709 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6705  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  52.7 
 
 
158 aa  159  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.625581  normal  0.389522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4639  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  53.64 
 
 
150 aa  144  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0713771  normal  0.0185757 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3513  alkylhydroperoxidase AhpD  50.68 
 
 
167 aa  141  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3016  alkylhydroperoxidase  52.98 
 
 
149 aa  141  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.325881  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2023  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  52.54 
 
 
158 aa  128  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0330638 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0186  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  52 
 
 
159 aa  128  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3217  alkylhydroperoxidase-like protein  49.61 
 
 
157 aa  122  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7113  hypothetical protein  51.01 
 
 
154 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0103  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.05 
 
 
157 aa  121  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.335572 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1695  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.76 
 
 
157 aa  121  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.232521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8880  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.69 
 
 
156 aa  120  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  42.86 
 
 
145 aa  114  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.97 
 
 
147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  45.83 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.82 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.11 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.11 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  42.47 
 
 
150 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.58 
 
 
152 aa  110  7.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0662  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.8 
 
 
166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236463  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.15 
 
 
150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.11 
 
 
145 aa  108  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  42.75 
 
 
149 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.11 
 
 
145 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3376  alkylhydroperoxidase  43.7 
 
 
154 aa  107  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  38.62 
 
 
145 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1128  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.7 
 
 
148 aa  105  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.453208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.54 
 
 
163 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.71 
 
 
157 aa  105  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  38.62 
 
 
145 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  44.09 
 
 
145 aa  104  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  39.1 
 
 
145 aa  104  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  42.45 
 
 
154 aa  104  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.35 
 
 
145 aa  103  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  41.78 
 
 
152 aa  103  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.85 
 
 
145 aa  103  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.62 
 
 
145 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  38.26 
 
 
162 aa  102  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  42.52 
 
 
145 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.24 
 
 
145 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  37.24 
 
 
145 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  37.24 
 
 
145 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  37.93 
 
 
145 aa  100  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.04 
 
 
155 aa  100  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1402  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.9 
 
 
146 aa  99.8  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  39.86 
 
 
156 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  36.99 
 
 
154 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.84 
 
 
163 aa  98.2  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.28 
 
 
151 aa  97.8  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0029  alkylhydroperoxidase  39.44 
 
 
144 aa  97.4  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622456  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2040  alkylhydroperoxidase  44.78 
 
 
168 aa  97.4  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8871  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.42 
 
 
161 aa  97.1  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  37.5 
 
 
153 aa  96.7  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  38.1 
 
 
159 aa  96.7  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1660  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.61 
 
 
160 aa  96.3  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.35 
 
 
145 aa  95.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  37.06 
 
 
159 aa  94.7  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.35 
 
 
146 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.81 
 
 
154 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  43.9 
 
 
159 aa  94  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  43.9 
 
 
159 aa  94  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6288  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.21 
 
 
153 aa  94  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00669161  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3241  hypothetical protein  39.37 
 
 
144 aa  94  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.371033  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3734  alkylhydroperoxidase  33.11 
 
 
150 aa  93.2  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51777  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.84 
 
 
146 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  38.24 
 
 
157 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.14 
 
 
159 aa  92  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4773  alkylhydroperoxidase  37.67 
 
 
157 aa  91.3  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.792481  normal  0.557734 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  40 
 
 
145 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.67 
 
 
163 aa  90.9  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.27 
 
 
159 aa  90.5  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  38.93 
 
 
151 aa  90.5  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  40.77 
 
 
145 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.67 
 
 
163 aa  90.1  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2183  carboxymuconolactone decarboxylase  42.07 
 
 
148 aa  90.1  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.534725  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.86 
 
 
155 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3742  alkylhydroperoxidase  37.4 
 
 
169 aa  88.6  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  40.94 
 
 
143 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  33.07 
 
 
147 aa  87.8  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.09 
 
 
153 aa  87.8  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.13 
 
 
159 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  38.13 
 
 
159 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.53 
 
 
159 aa  87.4  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  33.55 
 
 
158 aa  87.4  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1182  alkylhydroperoxidase  43.24 
 
 
163 aa  87  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  37.41 
 
 
159 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3108  alkylhydroperoxidase  37.14 
 
 
159 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5624  alkylhydroperoxidase  40 
 
 
167 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  35.77 
 
 
159 aa  85.9  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  36.69 
 
 
157 aa  85.5  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2269  alkylhydroperoxidase  34.72 
 
 
157 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608052  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3843  putative peroxidase  39.64 
 
 
167 aa  85.1  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 
153 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2565  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.54 
 
 
129 aa  85.1  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.929389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>