249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2040 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2040  alkylhydroperoxidase  100 
 
 		 168 aa  341  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3822  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  53.29 
 
 		 152 aa  157  9e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7113  hypothetical protein  56 
 
 		 154 aa  153  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6705  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  54.14 
 
 		 158 aa  143  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.625581  normal  0.389522 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5805  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.49 
 
 		 152 aa  141  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0418506  normal  0.111709 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3513  alkylhydroperoxidase AhpD  54.07 
 
 		 167 aa  133  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  47.14 
 
 		 146 aa  132  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.22 
 
 		 155 aa  131  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.89 
 
 		 157 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.67 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3217  alkylhydroperoxidase-like protein  45.39 
 
 		 157 aa  124  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.31 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  37.84 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  38.62 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0186  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  56.14 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  37.93 
 
 		 145 aa  121  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.14 
 
 		 163 aa  121  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  37.93 
 
 		 145 aa  120  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  40 
 
 		 146 aa  120  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3734  alkylhydroperoxidase  36.11 
 
 		 150 aa  120  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51777  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  39.86 
 
 		 158 aa  120  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  40 
 
 		 157 aa  120  9e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2023  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.42 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0330638 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  39.74 
 
 		 149 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  39.86 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  44.53 
 
 		 152 aa  118  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.46 
 
 		 153 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.24 
 
 		 145 aa  117  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.55 
 
 		 145 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  36.55 
 
 		 145 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  40.82 
 
 		 150 aa  117  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  39.31 
 
 		 145 aa  117  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.78 
 
 		 163 aa  117  9e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.24 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.78 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  39.73 
 
 		 145 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.06 
 
 		 147 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0103  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.59 
 
 		 157 aa  116  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.335572 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1695  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.33 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232521 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  35.86 
 
 		 145 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  37.24 
 
 		 145 aa  115  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  39.13 
 
 		 147 aa  115  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  43.17 
 
 		 145 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0272  alkylhydroperoxidase  34.67 
 
 		 150 aa  115  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300614  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2179  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.03 
 
 		 146 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  36.55 
 
 		 145 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  39.04 
 
 		 145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.24 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  41.73 
 
 		 145 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8880  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.86 
 
 		 156 aa  111  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7127  hypothetical protein  44.22 
 
 		 149 aa  111  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0029  alkylhydroperoxidase  38.03 
 
 		 144 aa  110  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622456  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.55 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  34.93 
 
 		 154 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.17 
 
 		 145 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4639  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.65 
 
 		 150 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0713771  normal  0.0185757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  38.57 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5352  hypothetical protein  42.28 
 
 		 151 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  37.06 
 
 		 145 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1402  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.3 
 
 		 146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.79 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  40.6 
 
 		 154 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  38.35 
 
 		 159 aa  107  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.65 
 
 		 155 aa  107  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.26 
 
 		 152 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1327  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.12 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.284107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.48 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.19 
 
 		 163 aa  106  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3016  alkylhydroperoxidase  45.65 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.325881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.24 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2847  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.13 
 
 		 158 aa  105  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3133  alkylhydroperoxidase  37.82 
 
 		 158 aa  105  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.75 
 
 		 145 aa  104  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.69 
 
 		 151 aa  104  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3098  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.59 
 
 		 150 aa  104  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000850498  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2353  alkylhydroperoxidase  44.78 
 
 		 152 aa  104  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  38.62 
 
 		 155 aa  104  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3272  alkylhydroperoxidase  45.11 
 
 		 152 aa  104  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40 
 
 		 155 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8871  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.67 
 
 		 161 aa  103  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6098  alkylhydroperoxidase  40.14 
 
 		 149 aa  103  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  38.61 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1333  alkylhydroperoxidase  37.84 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.59317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.97 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  37.97 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  33.79 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.24 
 
 		 159 aa  101  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.22 
 
 		 154 aa  101  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.89 
 
 		 159 aa  100  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2565  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.54 
 
 		 129 aa  100  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.929389  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4773  alkylhydroperoxidase  40.77 
 
 		 157 aa  100  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.792481  normal  0.557734 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  32.65 
 
 		 159 aa  100  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3376  alkylhydroperoxidase  38.99 
 
 		 154 aa  100  9e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000236  4-carboxymuconolactone decarboxylase domain/alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  36.77 
 
 		 153 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  35.14 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  35.14 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6041  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.46 
 
 		 152 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2877  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.58 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6288  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.97 
 
 		 153 aa  99.4  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00669161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.87 
 
 		 153 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>