269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5352 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5352  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  310  4.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416302  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3822  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  55.41 
 
 
152 aa  177  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176848  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5805  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  53.33 
 
 
152 aa  175  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0418506  normal  0.111709 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2353  alkylhydroperoxidase  60.53 
 
 
152 aa  174  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6705  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50.67 
 
 
158 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.625581  normal  0.389522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7127  hypothetical protein  58.78 
 
 
149 aa  164  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4639  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  62.09 
 
 
150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0713771  normal  0.0185757 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6041  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  54.73 
 
 
152 aa  162  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3513  alkylhydroperoxidase AhpD  48.67 
 
 
167 aa  144  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3016  alkylhydroperoxidase  51.35 
 
 
149 aa  143  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.325881  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1695  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.32 
 
 
157 aa  124  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.232521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0186  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.03 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  52.78 
 
 
163 aa  115  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.86 
 
 
147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8880  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.7 
 
 
156 aa  114  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0103  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.22 
 
 
157 aa  112  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.335572 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3217  alkylhydroperoxidase-like protein  50 
 
 
157 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7113  hypothetical protein  44.3 
 
 
154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  49.17 
 
 
152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.6 
 
 
145 aa  110  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2023  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.96 
 
 
158 aa  110  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0330638 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  43.09 
 
 
145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.51 
 
 
145 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2040  alkylhydroperoxidase  47.58 
 
 
168 aa  107  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  38.36 
 
 
145 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  38.36 
 
 
145 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.82 
 
 
145 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  38.82 
 
 
149 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  41.26 
 
 
154 aa  107  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.44 
 
 
157 aa  106  9.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  40.44 
 
 
146 aa  105  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  42.86 
 
 
145 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.82 
 
 
145 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.14 
 
 
145 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  40.3 
 
 
150 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0029  alkylhydroperoxidase  41.96 
 
 
144 aa  104  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622456  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2183  carboxymuconolactone decarboxylase  41.33 
 
 
148 aa  104  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.534725  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.16 
 
 
145 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.5 
 
 
145 aa  103  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.67 
 
 
145 aa  102  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.67 
 
 
145 aa  102  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  37.12 
 
 
145 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.53 
 
 
145 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  41.53 
 
 
145 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.68 
 
 
155 aa  103  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.86 
 
 
150 aa  102  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.62 
 
 
152 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  42.02 
 
 
145 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2847  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.36 
 
 
158 aa  102  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150118  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  42.24 
 
 
159 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  42.24 
 
 
159 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2657  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.22 
 
 
149 aa  100  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0722342  normal  0.0242397 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1128  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.52 
 
 
148 aa  100  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.453208 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.33 
 
 
163 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  39.29 
 
 
157 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  42.24 
 
 
145 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8871  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.16 
 
 
161 aa  99.4  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  38.71 
 
 
158 aa  98.2  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  37.8 
 
 
162 aa  97.4  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  43.1 
 
 
156 aa  97.4  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  36.69 
 
 
153 aa  97.1  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.76 
 
 
159 aa  96.3  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  40.52 
 
 
145 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.41 
 
 
143 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1327  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.01 
 
 
150 aa  94.7  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.284107  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.69 
 
 
143 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0761488 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.33 
 
 
163 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  35.25 
 
 
159 aa  93.6  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1333  alkylhydroperoxidase  36.43 
 
 
151 aa  93.6  9e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.59317 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.33 
 
 
163 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3376  alkylhydroperoxidase  39.13 
 
 
154 aa  92.8  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6288  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.07 
 
 
153 aa  92.8  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00669161  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0272  alkylhydroperoxidase  40.83 
 
 
150 aa  92  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300614  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  40.52 
 
 
145 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5624  alkylhydroperoxidase  42.61 
 
 
167 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.56 
 
 
154 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1402  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.52 
 
 
146 aa  91.3  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.6 
 
 
153 aa  91.3  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  33.09 
 
 
147 aa  91.3  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1660  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.99 
 
 
160 aa  90.9  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  38.79 
 
 
145 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  34.03 
 
 
154 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.5 
 
 
159 aa  90.1  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.41 
 
 
155 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2565  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.63 
 
 
129 aa  90.1  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.929389  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  37.41 
 
 
155 aa  88.6  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2951  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  35.82 
 
 
144 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0696867  normal  0.0134978 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  33.83 
 
 
159 aa  89.4  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3109  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  35.82 
 
 
144 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280387  normal  0.494752 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2986  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  35.82 
 
 
144 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2920  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  35.82 
 
 
144 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789877  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.97 
 
 
153 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3003  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  35.82 
 
 
144 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047955 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.48 
 
 
159 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.82 
 
 
146 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.53 
 
 
153 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.1 
 
 
153 aa  88.6  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.76 
 
 
159 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  39.47 
 
 
143 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2179  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.66 
 
 
146 aa  88.6  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.982088 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>