256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3513 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3513  alkylhydroperoxidase AhpD  100 
 
 
167 aa  343  7e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6705  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  66 
 
 
158 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.625581  normal  0.389522 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5805  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  62.67 
 
 
152 aa  205  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0418506  normal  0.111709 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3822  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  62.16 
 
 
152 aa  196  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176848  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7113  hypothetical protein  56.76 
 
 
154 aa  157  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2353  alkylhydroperoxidase  50.68 
 
 
152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5352  hypothetical protein  48.67 
 
 
151 aa  142  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416302  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2040  alkylhydroperoxidase  54.07 
 
 
168 aa  130  9e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6041  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.97 
 
 
152 aa  130  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0186  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  49.25 
 
 
159 aa  129  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1695  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.52 
 
 
157 aa  128  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.232521 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2847  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  54.63 
 
 
158 aa  127  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150118  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8880  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.39 
 
 
156 aa  125  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.32 
 
 
157 aa  122  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.41 
 
 
152 aa  122  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2183  carboxymuconolactone decarboxylase  49.33 
 
 
148 aa  122  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.534725  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0103  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.48 
 
 
157 aa  122  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.335572 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2023  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.5 
 
 
158 aa  122  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0330638 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  39.74 
 
 
162 aa  121  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.07 
 
 
146 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  41.56 
 
 
158 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  45.19 
 
 
145 aa  119  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.8 
 
 
155 aa  118  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  43.85 
 
 
145 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.28 
 
 
145 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  39.55 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  41.91 
 
 
146 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  45.19 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  39.55 
 
 
145 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  45.19 
 
 
149 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.29 
 
 
153 aa  115  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3217  alkylhydroperoxidase-like protein  45.83 
 
 
157 aa  115  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  42.31 
 
 
145 aa  114  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  42.11 
 
 
145 aa  114  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1327  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40 
 
 
150 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.284107  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  42.14 
 
 
159 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  42.14 
 
 
159 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  41.04 
 
 
154 aa  114  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.11 
 
 
150 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0029  alkylhydroperoxidase  41.26 
 
 
144 aa  114  8.999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622456  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  37.12 
 
 
147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  44.44 
 
 
145 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  38.81 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  37.12 
 
 
147 aa  112  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.06 
 
 
145 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  38.06 
 
 
145 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.22 
 
 
145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.29 
 
 
163 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7127  hypothetical protein  42.95 
 
 
149 aa  111  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  39.55 
 
 
145 aa  111  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  40.14 
 
 
159 aa  110  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.31 
 
 
145 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0272  alkylhydroperoxidase  42.34 
 
 
150 aa  110  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300614  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  39.04 
 
 
152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.04 
 
 
145 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2179  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.46 
 
 
146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  35.81 
 
 
150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  36.57 
 
 
145 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  37.86 
 
 
157 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50.93 
 
 
163 aa  107  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  40.77 
 
 
145 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0606  putative redox protein  40.97 
 
 
157 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2269  alkylhydroperoxidase  43.06 
 
 
157 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608052  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.1 
 
 
146 aa  105  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  38.46 
 
 
143 aa  106  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3016  alkylhydroperoxidase  42.95 
 
 
149 aa  105  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.325881  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.04 
 
 
154 aa  105  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36 
 
 
163 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3133  alkylhydroperoxidase  41.45 
 
 
158 aa  104  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36 
 
 
163 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  38.97 
 
 
159 aa  104  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.06 
 
 
145 aa  104  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  37.5 
 
 
154 aa  103  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.71 
 
 
159 aa  103  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.31 
 
 
145 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2464  alkylhydroperoxidase  38.73 
 
 
151 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2920  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  41.67 
 
 
144 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789877  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2986  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  41.67 
 
 
144 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3109  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  41.67 
 
 
144 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280387  normal  0.494752 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3098  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.23 
 
 
150 aa  102  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000850498  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.41 
 
 
147 aa  102  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  39.04 
 
 
155 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  39.23 
 
 
145 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4639  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.61 
 
 
150 aa  102  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0713771  normal  0.0185757 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3376  alkylhydroperoxidase  39.23 
 
 
154 aa  101  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3003  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  41.67 
 
 
144 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047955 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.71 
 
 
159 aa  101  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2951  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  41.67 
 
 
144 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0696867  normal  0.0134978 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  40.44 
 
 
159 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  38.24 
 
 
159 aa  100  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1070  alkylhydroperoxidase  39.16 
 
 
153 aa  100  9e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.5 
 
 
159 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8871  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.78 
 
 
161 aa  99.8  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6288  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35 
 
 
153 aa  100  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00669161  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  34.72 
 
 
153 aa  99.4  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.71 
 
 
159 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  39.71 
 
 
159 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1594  alkylhydroperoxidase  37.67 
 
 
144 aa  99.4  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.119891 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1807  alkylhydroperoxidase  37.67 
 
 
144 aa  99.4  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.99 
 
 
151 aa  99.8  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>