282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5805 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5805  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 
152 aa  308  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0418506  normal  0.111709 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6705  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  85.53 
 
 
158 aa  273  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.625581  normal  0.389522 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3822  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  64.19 
 
 
152 aa  201  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176848  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3513  alkylhydroperoxidase AhpD  62.67 
 
 
167 aa  188  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5352  hypothetical protein  53.33 
 
 
151 aa  157  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416302  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7113  hypothetical protein  56.95 
 
 
154 aa  155  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2353  alkylhydroperoxidase  53.69 
 
 
152 aa  144  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  46.05 
 
 
162 aa  137  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6041  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  54.05 
 
 
152 aa  136  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  50.7 
 
 
146 aa  133  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  48.51 
 
 
145 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  51.13 
 
 
145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.89 
 
 
152 aa  131  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  47.76 
 
 
149 aa  130  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  47.76 
 
 
145 aa  130  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  45.07 
 
 
150 aa  128  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.39 
 
 
163 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.26 
 
 
150 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50 
 
 
163 aa  127  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.78 
 
 
146 aa  126  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  47.76 
 
 
154 aa  126  9.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  47.01 
 
 
145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  48.87 
 
 
145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  42.25 
 
 
157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  44.62 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  48.48 
 
 
152 aa  124  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0186  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50 
 
 
159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7127  hypothetical protein  50.68 
 
 
149 aa  124  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.85 
 
 
153 aa  124  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  47.01 
 
 
145 aa  124  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  46.92 
 
 
145 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.03 
 
 
155 aa  122  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2040  alkylhydroperoxidase  51.11 
 
 
168 aa  122  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.01 
 
 
145 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.91 
 
 
157 aa  121  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.78 
 
 
145 aa  120  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.27 
 
 
145 aa  120  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  45.52 
 
 
145 aa  120  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  45.52 
 
 
145 aa  120  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  45.74 
 
 
145 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  45.52 
 
 
145 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3217  alkylhydroperoxidase-like protein  50 
 
 
157 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0103  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.21 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.335572 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.26 
 
 
163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6288  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.96 
 
 
153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00669161  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1695  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.2 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.232521 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.26 
 
 
163 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2847  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.67 
 
 
158 aa  118  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150118  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2023  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.12 
 
 
158 aa  117  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0330638 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3016  alkylhydroperoxidase  47.3 
 
 
149 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.325881  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.78 
 
 
145 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  44.78 
 
 
145 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.52 
 
 
145 aa  116  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2179  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.36 
 
 
146 aa  116  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.78 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8880  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.03 
 
 
156 aa  116  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  41.43 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0029  alkylhydroperoxidase  43.36 
 
 
144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622456  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.86 
 
 
147 aa  115  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.53 
 
 
146 aa  114  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4639  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.7 
 
 
150 aa  113  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0713771  normal  0.0185757 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  43.28 
 
 
145 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  40.15 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1327  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.54 
 
 
150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.284107  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  43.15 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0272  alkylhydroperoxidase  40.88 
 
 
150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300614  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  43.41 
 
 
145 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  40.58 
 
 
159 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  40.58 
 
 
159 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  42.86 
 
 
156 aa  110  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3376  alkylhydroperoxidase  46.15 
 
 
154 aa  110  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1402  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.1 
 
 
146 aa  110  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  37.67 
 
 
153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  41.86 
 
 
145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.57 
 
 
151 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.71 
 
 
155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2183  carboxymuconolactone decarboxylase  43.05 
 
 
148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.534725  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  43.41 
 
 
143 aa  108  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1128  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.03 
 
 
148 aa  108  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.453208 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  40.97 
 
 
154 aa  107  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  34.51 
 
 
147 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  34.85 
 
 
147 aa  106  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2565  alkylhydroperoxidase AhpD core  52.58 
 
 
129 aa  104  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.929389  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4737  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.61 
 
 
152 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223994  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  36.91 
 
 
159 aa  103  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3734  alkylhydroperoxidase  35.86 
 
 
150 aa  102  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51777  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.16 
 
 
159 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.04 
 
 
154 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4773  alkylhydroperoxidase  45.31 
 
 
157 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.792481  normal  0.557734 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  41.89 
 
 
151 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4069  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.96 
 
 
165 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3956  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.96 
 
 
165 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405644  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1660  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.8 
 
 
160 aa  100  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2269  alkylhydroperoxidase  43.06 
 
 
157 aa  100  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608052  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  37.23 
 
 
159 aa  100  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0606  putative redox protein  40.97 
 
 
157 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1070  alkylhydroperoxidase  44.26 
 
 
153 aa  99.8  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  37.23 
 
 
159 aa  97.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.23 
 
 
159 aa  97.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  37.23 
 
 
159 aa  97.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>