266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3098 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3098  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 
150 aa  306  5e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000850498  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0029  alkylhydroperoxidase  54.41 
 
 
144 aa  157  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622456  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2179  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.43 
 
 
146 aa  153  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1943  hypothetical protein  48.94 
 
 
159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.278152  normal  0.0324993 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3734  alkylhydroperoxidase  45.52 
 
 
150 aa  137  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51777  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3241  hypothetical protein  42.75 
 
 
144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.371033  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.31 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  40.88 
 
 
162 aa  119  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  41.91 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  40.46 
 
 
147 aa  118  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.52 
 
 
153 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.86 
 
 
151 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  39.86 
 
 
146 aa  117  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.52 
 
 
153 aa  117  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.51 
 
 
153 aa  117  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.42 
 
 
163 aa  117  7e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.42 
 
 
163 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.42 
 
 
163 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3546  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.48 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.225278  normal  0.0570392 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  43.57 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  38.93 
 
 
147 aa  114  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  40.29 
 
 
157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  42.19 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  39.86 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.04 
 
 
147 aa  111  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.96 
 
 
159 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  41.13 
 
 
150 aa  111  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5624  alkylhydroperoxidase  45.38 
 
 
167 aa  111  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1182  alkylhydroperoxidase  49.11 
 
 
163 aa  110  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.43 
 
 
150 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.18 
 
 
155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.98 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.75 
 
 
157 aa  108  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.98 
 
 
145 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  40 
 
 
154 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.96 
 
 
159 aa  107  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  36.43 
 
 
159 aa  107  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  38.58 
 
 
153 aa  107  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2847  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.67 
 
 
158 aa  106  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150118  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.15 
 
 
159 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.43 
 
 
145 aa  104  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.43 
 
 
145 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  36.43 
 
 
145 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.43 
 
 
145 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  36.43 
 
 
149 aa  104  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  38.64 
 
 
159 aa  104  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  36.43 
 
 
145 aa  103  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  35.66 
 
 
145 aa  103  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  35.66 
 
 
145 aa  103  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  40.98 
 
 
155 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.84 
 
 
154 aa  103  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  37.21 
 
 
159 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.43 
 
 
145 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.51 
 
 
159 aa  102  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.37 
 
 
155 aa  103  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7113  hypothetical protein  39.13 
 
 
154 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  35.66 
 
 
145 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.66 
 
 
159 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.43 
 
 
159 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  36.43 
 
 
159 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.43 
 
 
146 aa  101  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1128  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.88 
 
 
148 aa  101  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.453208 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.28 
 
 
145 aa  100  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.21 
 
 
145 aa  100  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  36.43 
 
 
145 aa  100  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  32.61 
 
 
159 aa  100  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.9 
 
 
153 aa  99.4  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2565  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.91 
 
 
129 aa  99.4  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.929389  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.69 
 
 
163 aa  99.4  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  40.6 
 
 
143 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  40.91 
 
 
156 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0996  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.55 
 
 
150 aa  98.2  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.710241  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3822  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.22 
 
 
152 aa  98.2  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176848  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.88 
 
 
159 aa  98.2  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.5 
 
 
145 aa  98.2  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.29 
 
 
150 aa  97.8  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406059  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  35.66 
 
 
159 aa  97.8  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3259  alkylhydroperoxidase  40.29 
 
 
150 aa  97.8  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.101599  normal  0.0335337 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2269  alkylhydroperoxidase  38.24 
 
 
157 aa  98.2  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608052  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.51 
 
 
152 aa  97.4  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1998  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.93 
 
 
159 aa  97.4  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.43 
 
 
145 aa  97.4  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.66 
 
 
159 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0606  putative redox protein  37.5 
 
 
157 aa  97.1  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  34.92 
 
 
145 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  35.66 
 
 
145 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3843  putative peroxidase  37.32 
 
 
167 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5805  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.69 
 
 
152 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0418506  normal  0.111709 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0103  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.24 
 
 
157 aa  95.5  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.335572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1402  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.34 
 
 
146 aa  95.9  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1327  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.56 
 
 
150 aa  95.9  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.284107  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2014  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  34.88 
 
 
159 aa  95.5  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1680  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.88 
 
 
159 aa  95.5  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.581321  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1660  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.69 
 
 
160 aa  95.5  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3272  alkylhydroperoxidase  37.78 
 
 
152 aa  94.7  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.09 
 
 
146 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0186  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46 
 
 
159 aa  94.7  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  34.4 
 
 
145 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2657  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.09 
 
 
149 aa  93.6  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0722342  normal  0.0242397 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.23 
 
 
152 aa  93.2  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>