268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7113 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7113  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  317  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3822  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  60.67 
 
 
152 aa  180  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176848  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6705  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  59.6 
 
 
158 aa  176  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.625581  normal  0.389522 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5805  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  56.95 
 
 
152 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0418506  normal  0.111709 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  55 
 
 
146 aa  161  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3513  alkylhydroperoxidase AhpD  56.76 
 
 
167 aa  159  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  51.72 
 
 
152 aa  154  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  48.65 
 
 
162 aa  154  5.0000000000000005e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2040  alkylhydroperoxidase  56 
 
 
168 aa  150  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  48.65 
 
 
157 aa  150  7e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0029  alkylhydroperoxidase  46.94 
 
 
144 aa  149  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622456  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0103  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.97 
 
 
157 aa  148  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.335572 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3217  alkylhydroperoxidase-like protein  55.15 
 
 
157 aa  147  7e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8880  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  58.87 
 
 
156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  52.14 
 
 
145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  50 
 
 
145 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2179  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.07 
 
 
146 aa  144  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0186  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  53.64 
 
 
159 aa  144  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50.35 
 
 
147 aa  143  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.95 
 
 
145 aa  142  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.9 
 
 
145 aa  142  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  48.28 
 
 
145 aa  142  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2023  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.68 
 
 
158 aa  142  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0330638 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  50 
 
 
145 aa  141  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  48.95 
 
 
145 aa  140  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  47.55 
 
 
145 aa  140  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  47.55 
 
 
145 aa  140  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  49.29 
 
 
145 aa  140  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.15 
 
 
145 aa  140  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.55 
 
 
146 aa  140  9e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1402  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.55 
 
 
146 aa  139  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  46.36 
 
 
149 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  48.34 
 
 
158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  47.55 
 
 
145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.55 
 
 
145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  47.55 
 
 
145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  54.29 
 
 
163 aa  138  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.33 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  47.59 
 
 
145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.33 
 
 
163 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  49.66 
 
 
150 aa  138  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  44 
 
 
163 aa  138  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3734  alkylhydroperoxidase  39.86 
 
 
150 aa  137  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51777  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  46.15 
 
 
145 aa  137  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.38 
 
 
153 aa  136  7.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  44.06 
 
 
145 aa  136  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.52 
 
 
145 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  47.55 
 
 
145 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1695  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  49.33 
 
 
157 aa  135  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.232521 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  44.14 
 
 
154 aa  135  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  44.59 
 
 
150 aa  134  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.15 
 
 
145 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.76 
 
 
146 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0272  alkylhydroperoxidase  42 
 
 
150 aa  132  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300614  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  40 
 
 
147 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  42.76 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.14 
 
 
145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.24 
 
 
155 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1327  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.76 
 
 
150 aa  130  9e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.284107  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6041  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  53.38 
 
 
152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2847  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.83 
 
 
158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150118  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  37.14 
 
 
147 aa  128  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.57 
 
 
157 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  49.66 
 
 
155 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  47.14 
 
 
152 aa  127  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  45.99 
 
 
143 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  40.69 
 
 
153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1128  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.59 
 
 
148 aa  127  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.453208 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.9 
 
 
155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2353  alkylhydroperoxidase  51.01 
 
 
152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2877  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.04 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3241  hypothetical protein  41.26 
 
 
144 aa  124  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.371033  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  47.1 
 
 
154 aa  124  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1943  hypothetical protein  39.86 
 
 
159 aa  123  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.278152  normal  0.0324993 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0996  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.18 
 
 
150 aa  122  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.710241  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8871  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  49.59 
 
 
161 aa  121  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  40.54 
 
 
159 aa  121  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1070  alkylhydroperoxidase  44.59 
 
 
153 aa  121  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.54 
 
 
159 aa  120  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.36 
 
 
153 aa  120  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  43.24 
 
 
159 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  39.61 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  39.61 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.19 
 
 
159 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.57 
 
 
159 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  42.57 
 
 
159 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.22 
 
 
159 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3098  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.13 
 
 
150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000850498  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4773  alkylhydroperoxidase  47.33 
 
 
157 aa  117  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.792481  normal  0.557734 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.58 
 
 
153 aa  117  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1333  alkylhydroperoxidase  39.22 
 
 
151 aa  117  7.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.59317 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.89 
 
 
153 aa  116  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.76 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.86 
 
 
159 aa  114  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.54 
 
 
159 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  39.86 
 
 
159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.84 
 
 
159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1341  alkylhydroperoxidase  41.29 
 
 
156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.728032 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2464  alkylhydroperoxidase  39.35 
 
 
151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5352  hypothetical protein  44.3 
 
 
151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416302  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>