226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0662 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0662  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 
166 aa  337  5.9999999999999996e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236463  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0576  Carboxymuconolactone decarboxylase  55.48 
 
 
168 aa  168  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2710  Carboxymuconolactone decarboxylase  54.84 
 
 
156 aa  160  7e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193796  normal  0.369057 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3822  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.33 
 
 
152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176848  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2353  alkylhydroperoxidase  43.8 
 
 
152 aa  97.8  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6705  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.13 
 
 
158 aa  95.5  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.625581  normal  0.389522 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5805  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.69 
 
 
152 aa  89.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0418506  normal  0.111709 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2023  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.74 
 
 
158 aa  85.1  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0330638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3513  alkylhydroperoxidase AhpD  34.69 
 
 
167 aa  84  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0103  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.58 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.335572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7113  hypothetical protein  38.73 
 
 
154 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.3 
 
 
163 aa  82  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0186  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.51 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.06 
 
 
145 aa  81.3  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  37.32 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  36.36 
 
 
149 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.55 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.36 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  37.84 
 
 
162 aa  79  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.18 
 
 
145 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  36.69 
 
 
152 aa  79  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.79 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  34.96 
 
 
145 aa  77  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.84 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.8 
 
 
145 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6041  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.09 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.53 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.5 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  30.58 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.58 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4639  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.24 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0713771  normal  0.0185757 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  34.43 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  33.09 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  35.25 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  34.43 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  34.64 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3217  alkylhydroperoxidase-like protein  37.7 
 
 
157 aa  73.9  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.43 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8871  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.02 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  34.43 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1128  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.07 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.453208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8880  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.78 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.88 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.93 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  29.73 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.43 
 
 
145 aa  72  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  36.84 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.45 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0029  alkylhydroperoxidase  32.39 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622456  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5352  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416302  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  32.33 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  32.79 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  33.61 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.5 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0021  alkylhydroperoxidase  34.81 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  29.75 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2040  alkylhydroperoxidase  36.02 
 
 
168 aa  68.6  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1695  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.88 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.232521 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0013  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  35.09 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7127  hypothetical protein  30.61 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  35.59 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0021  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106747  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.21 
 
 
163 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  30.23 
 
 
145 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  36.04 
 
 
157 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  33.88 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.06 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  32.54 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2847  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.82 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150118  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  32.54 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1402  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.64 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.75 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6288  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.05 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00669161  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  31.54 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0022  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.75 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0996  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.62 
 
 
283 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.353647  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0272  alkylhydroperoxidase  29.93 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300614  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3376  alkylhydroperoxidase  30.43 
 
 
154 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.14 
 
 
163 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2183  carboxymuconolactone decarboxylase  33.58 
 
 
148 aa  63.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.534725  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.35 
 
 
154 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  42.65 
 
 
157 aa  63.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.58 
 
 
155 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1900  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.1 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1369  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.1 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.06 
 
 
146 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3843  putative peroxidase  33.63 
 
 
167 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.14 
 
 
163 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1057  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.1 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0811  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.1 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1211  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.62 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1219  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.1 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  33.03 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2464  alkylhydroperoxidase  31.09 
 
 
151 aa  62.8  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5468  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.63 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3437  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.69 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330272  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.62 
 
 
159 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  31.62 
 
 
159 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>