220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2710 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2710  Carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
156 aa  317  3e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193796  normal  0.369057 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0662  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  54.84 
 
 
166 aa  179  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236463  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0576  Carboxymuconolactone decarboxylase  50.68 
 
 
168 aa  148  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3822  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.51 
 
 
152 aa  94.7  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176848  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6705  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.91 
 
 
158 aa  88.2  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.625581  normal  0.389522 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5805  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.86 
 
 
152 aa  87  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0418506  normal  0.111709 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0103  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.6 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.335572 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6041  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.3 
 
 
152 aa  80.1  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2023  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.81 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0330638 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.97 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0186  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.06 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1695  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.81 
 
 
157 aa  73.9  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.232521 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.33 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8871  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.5 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2353  alkylhydroperoxidase  34.33 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  35.71 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8880  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3275  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0021  alkylhydroperoxidase  36.76 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  32.84 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  35.37 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.11 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  34.71 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3217  alkylhydroperoxidase-like protein  34.43 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.17 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.09 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0021  alkylhydroperoxidase  35.29 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106747  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.17 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
159 aa  67  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
159 aa  67  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.04 
 
 
145 aa  67  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  34.96 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0013  alkylhydroperoxidase  35.29 
 
 
158 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0022  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.68 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2183  carboxymuconolactone decarboxylase  37.78 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.534725  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.64 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  33.57 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.57 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  30.22 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  35.14 
 
 
158 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.48 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3513  alkylhydroperoxidase AhpD  34.25 
 
 
167 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7127  hypothetical protein  36.22 
 
 
149 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.17 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  32.74 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  31.4 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  33.77 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.35 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0761488 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1333  alkylhydroperoxidase  35.77 
 
 
151 aa  62.4  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.59317 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0027  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.34 
 
 
157 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.456012 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7113  hypothetical protein  35.21 
 
 
154 aa  62.4  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1128  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.16 
 
 
148 aa  61.6  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.453208 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.35 
 
 
143 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.4 
 
 
145 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.08 
 
 
152 aa  61.6  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2847  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.45 
 
 
158 aa  61.6  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150118  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0050  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.03 
 
 
158 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464213  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6087  alkylhydroperoxidase  39.83 
 
 
151 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.03 
 
 
145 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6384  alkylhydroperoxidase  39.83 
 
 
151 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39128  normal  0.0625105 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0020  alkylhydroperoxidase  36.03 
 
 
158 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0039  alkylhydroperoxidase  36.03 
 
 
158 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35 
 
 
147 aa  61.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6989  alkylhydroperoxidase  39.83 
 
 
151 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.793098  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6288  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.41 
 
 
153 aa  60.8  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00669161  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0272  alkylhydroperoxidase  30.95 
 
 
150 aa  60.8  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2331  alkylhydroperoxidase  33.81 
 
 
149 aa  60.8  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.224128  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.28 
 
 
146 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.45 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.58 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  30.58 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2331  alkylhydroperoxidase  33.81 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2448  alkylhydroperoxidase  33.81 
 
 
149 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.19874  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.45 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1913  alkylhydroperoxidase  31.65 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2015  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.81 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.419604  hitchhiker  0.00248557 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  31.54 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1900  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.33 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2951  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  35.2 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0696867  normal  0.0134978 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3109  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  35.2 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280387  normal  0.494752 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4639  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.11 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0713771  normal  0.0185757 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  27.91 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1057  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.33 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2920  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  35.2 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789877  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0811  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.33 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1211  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.33 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1219  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.33 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3554  alkylhydroperoxidase  39.82 
 
 
151 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.249618 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.33 
 
 
155 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1327  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.71 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.284107  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2986  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  35.2 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3003  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  35.2 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047955 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5352  hypothetical protein  33.56 
 
 
151 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416302  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1369  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.33 
 
 
150 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0996  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.02 
 
 
283 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.353647  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2452  hypothetical protein  44.44 
 
 
148 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  29.17 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.09 
 
 
154 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  29.17 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>