250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3437 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3437  alkylhydroperoxidase AhpD core  100 
 
 		 144 aa  296  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330272  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4101  alkylhydroperoxidase  58.57 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0737  alkylhydroperoxidase  52.08 
 
 		 144 aa  154  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.213985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  42.45 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.03 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  40.74 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  43.75 
 
 		 145 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  42.45 
 
 		 143 aa  110  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  43.36 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  43.75 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  39.86 
 
 		 159 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.15 
 
 		 145 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  40.58 
 
 		 145 aa  107  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40.88 
 
 		 145 aa  107  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  40.88 
 
 		 153 aa  106  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.86 
 
 		 159 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  42.96 
 
 		 145 aa  105  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.01 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3108  alkylhydroperoxidase  44.53 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.31 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  42.96 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  42.22 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.3 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  41.3 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  41.13 
 
 		 159 aa  104  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.61 
 
 		 145 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  41.61 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.61 
 
 		 145 aa  103  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  40.58 
 
 		 159 aa  103  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.26 
 
 		 146 aa  103  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.85 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.44 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2104  alkylhydroperoxidase  40 
 
 		 149 aa  102  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.68 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2269  alkylhydroperoxidase  42.11 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608052  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  41.18 
 
 		 162 aa  102  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1929  alkylhydroperoxidase  40 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.38 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0606  putative redox protein  41.98 
 
 		 157 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4773  alkylhydroperoxidase  44.96 
 
 		 157 aa  101  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.792481  normal  0.557734 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.2 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.26 
 
 		 152 aa  100  7e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1874  alkylhydroperoxidase  39.31 
 
 		 149 aa  100  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3003  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  40.15 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047955 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2951  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  40.15 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0696867  normal  0.0134978 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.78 
 
 		 145 aa  99  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.68 
 
 		 153 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  37.96 
 
 		 145 aa  99  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.25 
 
 		 153 aa  99  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1128  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.55 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.453208 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40.91 
 
 		 143 aa  98.6  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.67 
 
 		 143 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0761488 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  36.3 
 
 		 145 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  37.68 
 
 		 157 aa  98.2  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  36.96 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  36.96 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.85 
 
 		 163 aa  97.8  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  42.06 
 
 		 155 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.78 
 
 		 145 aa  98.2  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.04 
 
 		 145 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  36.3 
 
 		 145 aa  98.2  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  37.04 
 
 		 145 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1680  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.3 
 
 		 159 aa  97.4  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.581321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2014  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  36.3 
 
 		 159 aa  97.4  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0791  alkylhydroperoxidase  37.14 
 
 		 167 aa  97.8  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0013  alkylhydroperoxidase  41.01 
 
 		 158 aa  97.8  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.78 
 
 		 145 aa  97.4  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  37.04 
 
 		 145 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.62 
 
 		 163 aa  96.7  9e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  40.58 
 
 		 154 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  39.26 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3109  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  39.39 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280387  normal  0.494752 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.51 
 
 		 153 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1594  alkylhydroperoxidase  39.39 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.119891 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1807  alkylhydroperoxidase  39.39 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3133  alkylhydroperoxidase  40.74 
 
 		 158 aa  96.3  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2920  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  39.39 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789877  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1913  alkylhydroperoxidase  42.36 
 
 		 149 aa  96.3  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2986  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  39.39 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0021  alkylhydroperoxidase  41.01 
 
 		 158 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.84 
 
 		 163 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3843  putative peroxidase  45.95 
 
 		 167 aa  95.5  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  48.18 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.96 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.97 
 
 		 153 aa  94.4  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3217  alkylhydroperoxidase-like protein  42.54 
 
 		 157 aa  93.6  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3822  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.23 
 
 		 152 aa  94  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3720  alkylhydroperoxidase  35.04 
 
 		 143 aa  94  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.78 
 
 		 159 aa  93.6  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.96 
 
 		 150 aa  93.6  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.44 
 
 		 163 aa  93.2  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5468  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.36 
 
 		 156 aa  92.8  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0050  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.45 
 
 		 158 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464213  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0020  alkylhydroperoxidase  42.45 
 
 		 158 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3272  alkylhydroperoxidase  39.06 
 
 		 152 aa  92.8  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0186  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.48 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0039  alkylhydroperoxidase  43.17 
 
 		 158 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  36.72 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3275  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.79 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2061  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.23 
 
 		 151 aa  92  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>