248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3196 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3196  alkylhydroperoxidase  100 
 
 
167 aa  348  2e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  42.68 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1327  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.13 
 
 
150 aa  136  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.284107  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  42.21 
 
 
162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.79 
 
 
163 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.47 
 
 
163 aa  131  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.82 
 
 
163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.55 
 
 
145 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  40.51 
 
 
158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  41.55 
 
 
149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  43.51 
 
 
145 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0272  alkylhydroperoxidase  43.92 
 
 
150 aa  125  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  42.18 
 
 
145 aa  123  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.83 
 
 
153 aa  123  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40.85 
 
 
145 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.55 
 
 
145 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  45.52 
 
 
145 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  41.56 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.91 
 
 
146 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  39.73 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6812  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.57 
 
 
151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.28 
 
 
145 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  40.41 
 
 
159 aa  118  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.67 
 
 
145 aa  117  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.67 
 
 
155 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  41.67 
 
 
145 aa  115  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.18 
 
 
145 aa  115  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.19 
 
 
155 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6288  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.18 
 
 
153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00669161  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.47 
 
 
152 aa  114  7.999999999999999e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3133  alkylhydroperoxidase  40.62 
 
 
158 aa  114  7.999999999999999e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  44.19 
 
 
155 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.25 
 
 
155 aa  112  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  43.65 
 
 
153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  50 
 
 
152 aa  111  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.18 
 
 
152 aa  111  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.6 
 
 
153 aa  110  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  49.59 
 
 
157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0791  alkylhydroperoxidase  47.54 
 
 
167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  44.26 
 
 
154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  38.24 
 
 
145 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.09 
 
 
145 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.09 
 
 
145 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  38.97 
 
 
145 aa  108  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  37.5 
 
 
145 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2623  alkylhydroperoxidase  36.67 
 
 
153 aa  108  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.5 
 
 
145 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  37.5 
 
 
145 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  37.5 
 
 
145 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  40.91 
 
 
159 aa  107  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3949  alkylhydroperoxidase  41.22 
 
 
156 aa  107  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.2 
 
 
153 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5468  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.11 
 
 
156 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.5 
 
 
145 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1341  alkylhydroperoxidase  37.33 
 
 
156 aa  106  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.728032 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1070  alkylhydroperoxidase  38.67 
 
 
153 aa  106  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1900  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.92 
 
 
150 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1369  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.92 
 
 
150 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2061  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.22 
 
 
151 aa  106  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.31 
 
 
157 aa  105  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1057  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.92 
 
 
150 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0811  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.92 
 
 
150 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1219  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.92 
 
 
150 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  38.1 
 
 
146 aa  105  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0021  alkylhydroperoxidase  47.11 
 
 
157 aa  105  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1211  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.92 
 
 
150 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0022  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.71 
 
 
156 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  39.46 
 
 
143 aa  105  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0021  alkylhydroperoxidase  46.28 
 
 
158 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106747  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.16 
 
 
159 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0013  alkylhydroperoxidase  45.45 
 
 
158 aa  104  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.44 
 
 
146 aa  103  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  43.97 
 
 
152 aa  103  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0996  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.76 
 
 
283 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.353647  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2657  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.31 
 
 
149 aa  103  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0722342  normal  0.0242397 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.43 
 
 
151 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3843  putative peroxidase  44.63 
 
 
167 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.22 
 
 
163 aa  102  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.62 
 
 
159 aa  101  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  37.32 
 
 
159 aa  101  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.32 
 
 
159 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  37.32 
 
 
159 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1402  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.5 
 
 
146 aa  101  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2565  alkylhydroperoxidase AhpD core  55.56 
 
 
129 aa  100  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.929389  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  37.04 
 
 
147 aa  100  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.99 
 
 
159 aa  100  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0050  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.22 
 
 
158 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464213  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0020  alkylhydroperoxidase  46.22 
 
 
158 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0039  alkylhydroperoxidase  46.22 
 
 
158 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.67 
 
 
153 aa  100  9e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0027  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.87 
 
 
157 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.456012 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3205  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.45 
 
 
158 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.019288  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3241  hypothetical protein  35.66 
 
 
144 aa  100  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.371033  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  38.28 
 
 
159 aa  100  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  41.01 
 
 
151 aa  99.8  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4693  alkylhydroperoxidase  36.99 
 
 
149 aa  99.4  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.92 
 
 
159 aa  99.4  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  41.86 
 
 
154 aa  99  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  39.26 
 
 
143 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0761488 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2464  alkylhydroperoxidase  41.94 
 
 
151 aa  99.8  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>