238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4693 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_4693  alkylhydroperoxidase  100 
 
 
149 aa  308  1e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2623  alkylhydroperoxidase  60.67 
 
 
153 aa  185  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1070  alkylhydroperoxidase  57.33 
 
 
153 aa  184  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000236  4-carboxymuconolactone decarboxylase domain/alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  55.33 
 
 
153 aa  176  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1341  alkylhydroperoxidase  57.33 
 
 
156 aa  173  9e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.728032 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2464  alkylhydroperoxidase  50 
 
 
151 aa  160  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2738  alkylhydroperoxidase  44.59 
 
 
147 aa  130  6e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0546441  hitchhiker  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  40.54 
 
 
158 aa  127  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  40.94 
 
 
162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.73 
 
 
146 aa  118  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.14 
 
 
146 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.96 
 
 
152 aa  116  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  39.86 
 
 
159 aa  115  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.76 
 
 
153 aa  116  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  38.03 
 
 
145 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.6 
 
 
155 aa  114  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0272  alkylhydroperoxidase  40.82 
 
 
150 aa  114  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300614  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.32 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  37.32 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  37.32 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.32 
 
 
145 aa  111  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.77 
 
 
155 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  40.69 
 
 
147 aa  111  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  36.62 
 
 
145 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2179  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.17 
 
 
146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  40.14 
 
 
147 aa  110  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  35.92 
 
 
145 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.51 
 
 
157 aa  110  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  45.45 
 
 
155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  36.42 
 
 
157 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.1 
 
 
163 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.77 
 
 
163 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.24 
 
 
145 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  38.85 
 
 
154 aa  105  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.11 
 
 
163 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.24 
 
 
145 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  37.24 
 
 
149 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3949  alkylhydroperoxidase  39.61 
 
 
156 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.55 
 
 
153 aa  105  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1998  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.67 
 
 
159 aa  104  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.21 
 
 
145 aa  104  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  38.3 
 
 
157 aa  104  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.58 
 
 
159 aa  104  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4737  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.32 
 
 
152 aa  103  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223994  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  38.16 
 
 
159 aa  103  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  38.16 
 
 
159 aa  103  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  35.92 
 
 
145 aa  103  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.24 
 
 
145 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.32 
 
 
145 aa  102  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  36.62 
 
 
145 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.01 
 
 
155 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3241  hypothetical protein  37.14 
 
 
144 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.371033  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6098  alkylhydroperoxidase  35.66 
 
 
149 aa  101  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3843  putative peroxidase  36.88 
 
 
167 aa  100  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1327  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.57 
 
 
150 aa  100  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.284107  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3196  alkylhydroperoxidase  36.99 
 
 
167 aa  99.4  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  35.92 
 
 
154 aa  99.4  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0021  alkylhydroperoxidase  36.62 
 
 
158 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106747  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  38.82 
 
 
159 aa  99  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.97 
 
 
145 aa  98.2  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  34.9 
 
 
159 aa  98.6  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.71 
 
 
159 aa  98.2  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  36.13 
 
 
159 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0039  alkylhydroperoxidase  37.5 
 
 
158 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0050  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.5 
 
 
158 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464213  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.13 
 
 
159 aa  98.2  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0020  alkylhydroperoxidase  37.5 
 
 
158 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  36.13 
 
 
159 aa  98.2  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.42 
 
 
159 aa  97.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.97 
 
 
152 aa  97.4  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0021  alkylhydroperoxidase  38.46 
 
 
157 aa  97.8  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.1 
 
 
145 aa  97.1  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.77 
 
 
159 aa  97.1  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3205  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.62 
 
 
158 aa  96.7  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.019288  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  35.25 
 
 
143 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1333  alkylhydroperoxidase  37.5 
 
 
151 aa  96.7  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.59317 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6133  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.66 
 
 
151 aa  95.9  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0013  alkylhydroperoxidase  36.81 
 
 
158 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6989  alkylhydroperoxidase  35.66 
 
 
151 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.793098  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3734  alkylhydroperoxidase  35.37 
 
 
150 aa  95.5  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51777  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  35.29 
 
 
153 aa  95.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5468  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.75 
 
 
156 aa  94.7  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3133  alkylhydroperoxidase  36.11 
 
 
158 aa  94.7  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.39 
 
 
145 aa  94.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6087  alkylhydroperoxidase  34.27 
 
 
151 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6384  alkylhydroperoxidase  34.27 
 
 
151 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39128  normal  0.0625105 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.48 
 
 
152 aa  94.4  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3554  alkylhydroperoxidase  34.97 
 
 
151 aa  93.6  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.249618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0791  alkylhydroperoxidase  34.44 
 
 
167 aa  93.6  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.06 
 
 
154 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.47 
 
 
151 aa  93.2  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3104  alkylhydroperoxidase  38.19 
 
 
149 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207419  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.06 
 
 
159 aa  92.8  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0029  alkylhydroperoxidase  37.68 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622456  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.55 
 
 
159 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1929  alkylhydroperoxidase  42.37 
 
 
149 aa  91.7  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6812  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.55 
 
 
151 aa  90.9  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  34.06 
 
 
145 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.12 
 
 
159 aa  90.9  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>