267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2935 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2935  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  301  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1680  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  61.81 
 
 		 159 aa  181  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.581321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2014  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  61.81 
 
 		 159 aa  181  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3272  alkylhydroperoxidase  57.64 
 
 		 152 aa  165  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3275  alkylhydroperoxidase AhpD core  56.85 
 
 		 159 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3440  alkylhydroperoxidase AhpD core  52.74 
 
 		 152 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3956  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  53.95 
 
 		 165 aa  154  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4069  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  53.95 
 
 		 165 aa  154  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.86 
 
 		 153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.85 
 
 		 155 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  49.61 
 
 		 152 aa  123  7e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  42.96 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  45.8 
 
 		 145 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.86 
 
 		 153 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  45 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  46.92 
 
 		 154 aa  120  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2331  alkylhydroperoxidase  46.1 
 
 		 149 aa  120  7e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.224128  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2015  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.1 
 
 		 149 aa  120  8e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.419604  hitchhiker  0.00248557 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  48.46 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.26 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2448  alkylhydroperoxidase  46.1 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.19874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  43.18 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2657  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.17 
 
 		 149 aa  118  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0722342  normal  0.0242397 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2331  alkylhydroperoxidase  45.39 
 
 		 149 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  43.51 
 
 		 145 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  50 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  43.66 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.36 
 
 		 151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.52 
 
 		 154 aa  117  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  41.43 
 
 		 153 aa  116  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.32 
 
 		 152 aa  116  9e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1874  alkylhydroperoxidase  44.96 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  44.7 
 
 		 159 aa  115  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1913  alkylhydroperoxidase  40.97 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1929  alkylhydroperoxidase  45.74 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.03 
 
 		 145 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.91 
 
 		 155 aa  115  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.03 
 
 		 145 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.04 
 
 		 155 aa  114  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  43.61 
 
 		 151 aa  113  6.9999999999999995e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  41.18 
 
 		 145 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2104  alkylhydroperoxidase  44.19 
 
 		 149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.41 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3133  alkylhydroperoxidase  46.09 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  42.03 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40.58 
 
 		 145 aa  110  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  40.43 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.58 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40.58 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.86 
 
 		 145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.54 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0606  putative redox protein  43.51 
 
 		 157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.03 
 
 		 145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  42.75 
 
 		 157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  50 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3949  alkylhydroperoxidase  48.76 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.79 
 
 		 143 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0761488 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0791  alkylhydroperoxidase  39.13 
 
 		 167 aa  107  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  39.13 
 
 		 145 aa  107  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  40.46 
 
 		 145 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2269  alkylhydroperoxidase  43.51 
 
 		 157 aa  107  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608052  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  43.38 
 
 		 145 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3517  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.04 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  39.86 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4773  alkylhydroperoxidase  42.45 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.792481  normal  0.557734 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  47.79 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3003  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  41.04 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047955 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2951  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  41.04 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0696867  normal  0.0134978 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.3 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.315709  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2986  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  41.04 
 
 		 144 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.81 
 
 		 153 aa  104  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  39.47 
 
 		 162 aa  103  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3109  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  41.04 
 
 		 144 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280387  normal  0.494752 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2920  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  41.04 
 
 		 144 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789877  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4737  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.02 
 
 		 152 aa  103  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.26 
 
 		 163 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.96 
 
 		 163 aa  103  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6384  alkylhydroperoxidase  41.13 
 
 		 151 aa  103  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39128  normal  0.0625105 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6087  alkylhydroperoxidase  41.13 
 
 		 151 aa  103  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.44 
 
 		 145 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  40.44 
 
 		 145 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3720  alkylhydroperoxidase  41.67 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.52 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0021  alkylhydroperoxidase  46.72 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.44 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  43.59 
 
 		 145 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  41.86 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  42.5 
 
 		 145 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.86 
 
 		 145 aa  101  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.92 
 
 		 159 aa  100  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.28 
 
 		 157 aa  99.8  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  38.33 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2061  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.08 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3554  alkylhydroperoxidase  40.43 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.249618 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  35.11 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3843  putative peroxidase  44.63 
 
 		 167 aa  99.4  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.46 
 
 		 159 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0013  alkylhydroperoxidase  47.32 
 
 		 158 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  38.46 
 
 		 159 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1182  alkylhydroperoxidase  44.44 
 
 		 163 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>