222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4152 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4152  alkylhydroperoxidase AhpD core  100 
 
 		 90 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0101808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  87.5 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  84.09 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  71.59 
 
 		 152 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  64.71 
 
 		 153 aa  120  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  61.36 
 
 		 159 aa  117  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  60.23 
 
 		 163 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  60.23 
 
 		 163 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  68.54 
 
 		 158 aa  117  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  60.23 
 
 		 163 aa  115  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  62.5 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  62.07 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2565  alkylhydroperoxidase AhpD core  61.36 
 
 		 129 aa  114  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.929389  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  60.23 
 
 		 146 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  64.04 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  58.62 
 
 		 153 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  57.95 
 
 		 157 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  58.62 
 
 		 153 aa  110  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2179  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  55.17 
 
 		 146 aa  110  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  59.09 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  59.55 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  57.95 
 
 		 145 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  57.95 
 
 		 149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  60.23 
 
 		 157 aa  107  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  56.82 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  56.82 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  60.23 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  56.82 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  56.82 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  55.68 
 
 		 154 aa  104  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  55.68 
 
 		 145 aa  104  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  55.68 
 
 		 145 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  55.68 
 
 		 145 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  56.82 
 
 		 145 aa  103  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3133  alkylhydroperoxidase  55.17 
 
 		 158 aa  103  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  54.55 
 
 		 145 aa  103  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  56.82 
 
 		 145 aa  103  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  54.55 
 
 		 145 aa  103  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  57.95 
 
 		 145 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0050  alkylhydroperoxidase AhpD core  57.95 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464213  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0020  alkylhydroperoxidase  57.95 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0039  alkylhydroperoxidase  57.95 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7113  hypothetical protein  56.96 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3734  alkylhydroperoxidase  55.13 
 
 		 150 aa  101  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51777  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5468  alkylhydroperoxidase AhpD core  56.82 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3843  putative peroxidase  56.82 
 
 		 167 aa  100  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  56.82 
 
 		 145 aa  100  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  58.97 
 
 		 152 aa  100  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0021  alkylhydroperoxidase  57.95 
 
 		 157 aa  99.8  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  56.82 
 
 		 145 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3205  alkylhydroperoxidase AhpD core  55.68 
 
 		 158 aa  98.6  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.019288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3949  alkylhydroperoxidase  55.68 
 
 		 156 aa  99.4  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0013  alkylhydroperoxidase  56.82 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  53.41 
 
 		 145 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0021  alkylhydroperoxidase  56.82 
 
 		 158 aa  98.2  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  53.41 
 
 		 145 aa  97.4  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  52.27 
 
 		 145 aa  97.4  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0029  alkylhydroperoxidase  49.43 
 
 		 144 aa  97.1  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622456  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  56.47 
 
 		 143 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  50 
 
 		 145 aa  96.3  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  51.14 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  51.14 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  51.14 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  50 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.14 
 
 		 159 aa  95.5  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0272  alkylhydroperoxidase  48.86 
 
 		 150 aa  95.1  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300614  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  52.27 
 
 		 159 aa  94.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  50.59 
 
 		 146 aa  94.7  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  51.14 
 
 		 146 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2061  alkylhydroperoxidase AhpD core  53.41 
 
 		 151 aa  93.6  8e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.86 
 
 		 159 aa  93.6  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  47.73 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  51.14 
 
 		 159 aa  92.8  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  55.17 
 
 		 151 aa  92  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  50.57 
 
 		 152 aa  91.3  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.86 
 
 		 159 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3822  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.07 
 
 		 152 aa  91.3  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.86 
 
 		 145 aa  91.3  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  50.67 
 
 		 147 aa  90.1  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  48.86 
 
 		 159 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1070  alkylhydroperoxidase  51.61 
 
 		 153 aa  89  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.73 
 
 		 145 aa  87.8  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  52.94 
 
 		 152 aa  88.2  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3272  alkylhydroperoxidase  55.13 
 
 		 152 aa  87.8  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50 
 
 		 147 aa  87  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  54.02 
 
 		 151 aa  87  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.73 
 
 		 159 aa  86.7  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  46.59 
 
 		 159 aa  86.7  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  46.59 
 
 		 159 aa  86.7  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1943  hypothetical protein  47.44 
 
 		 159 aa  86.3  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.278152  normal  0.0324993 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.59 
 
 		 159 aa  85.9  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  49.41 
 
 		 150 aa  85.5  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.84 
 
 		 155 aa  85.5  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  47.73 
 
 		 159 aa  85.5  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1402  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50.59 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2040  alkylhydroperoxidase  42.68 
 
 		 168 aa  85.1  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.86 
 
 		 159 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  47.06 
 
 		 150 aa  84.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4773  alkylhydroperoxidase  50.67 
 
 		 157 aa  84  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.792481  normal  0.557734 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0606  putative redox protein  47.19 
 
 		 157 aa  83.6  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>