More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2646 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  100 
 
 		 176 aa  361  3e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  71.59 
 
 		 176 aa  272  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  33.15 
 
 		 178 aa  100  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.46 
 
 		 180 aa  99.8  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.58 
 
 		 181 aa  98.2  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  35.56 
 
 		 180 aa  92  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1859  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.23 
 
 		 176 aa  91.7  5e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0505741  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1257  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.53 
 
 		 160 aa  91.3  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  31.82 
 
 		 181 aa  89.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0485  hypothetical protein  29.94 
 
 		 177 aa  89.4  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.58 
 
 		 178 aa  89.4  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  34.08 
 
 		 225 aa  88.6  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1701  hypothetical protein  31.1 
 
 		 177 aa  88.2  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0984593  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  30.68 
 
 		 183 aa  87.8  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1603  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 		 179 aa  85.9  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  31.65 
 
 		 172 aa  85.5  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  27.53 
 
 		 183 aa  83.6  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6296  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.02 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1632  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.39 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134838  normal  0.2145 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1750  alkylhydroperoxidase  45.05 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.430274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2761  carboxymuconolactone decarboxylase  29.94 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1371  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.29 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3408  response regulator  31.41 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.594008  normal  0.220961 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5015  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.61 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0965008  normal  0.0295015 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  28.1 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0194  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.14 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5073  alkylhydroperoxidase  35.19 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.28 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.98 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3164  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.85 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5204  alkylhydroperoxidase  35.85 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  28.41 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.14 
 
 		 214 aa  77.8  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  31.25 
 
 		 177 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.02 
 
 		 184 aa  77.4  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1476  Carboxymuconolactone decarboxylase  24 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.399629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  30 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  30 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.54 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.59 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  31.25 
 
 		 177 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.82 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3832  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.14 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.942836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2827  peroxidase-like  26.71 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00537954  normal  0.0498212 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1745  hypothetical protein  27.07 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3877  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.74 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.14 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.68 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.83 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  30 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  30.13 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.58 
 
 		 217 aa  74.3  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.95 
 
 		 199 aa  74.3  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0600  alkylhydroperoxidase  38 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.61 
 
 		 181 aa  74.3  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.61 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  26.35 
 
 		 192 aa  74.3  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  26.47 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2816  alkylhydroperoxidase AhpD domain protein  25.29 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0335697  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.15 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  28.41 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4285  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.11 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0195  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.83 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.87 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0758  hypothetical protein  28.48 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0970  alkylhydroperoxidase  30.34 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  32.37 
 
 		 201 aa  72  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02815  probable fusion protein  31.85 
 
 		 196 aa  72  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.159587  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.75 
 
 		 192 aa  72  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.43 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.67 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3382  hypothetical protein  36.73 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282694  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3133  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.75 
 
 		 190 aa  70.9  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4098  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.42 
 
 		 211 aa  71.2  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1945  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.65 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1869  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.09 
 
 		 201 aa  70.9  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0138584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  26.35 
 
 		 214 aa  70.9  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.1 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  27.54 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.06 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3926  carboxymuconolactone decarboxylase  29.55 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2544  alkylhydroperoxidase AhpD core  23.53 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.165226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2089  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.53 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.38 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.84 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  25 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  25.14 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4868  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.71 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.405716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1447  hypothetical protein  24.71 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218618  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  30.71 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1446  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.29 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3028  alkylhydroperoxidase  38.1 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.71 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1766  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.53 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.472183 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2606  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.53 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3860  alcohol dehydrogenase  33.67 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.29 
 
 		 192 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0563256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>