23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3408 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014213  Mesil_3408  response regulator  100 
 
 		 160 aa  317  3.9999999999999996e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.594008  normal  0.220961 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1257  Carboxymuconolactone decarboxylase  82.5 
 
 		 160 aa  263  5.999999999999999e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.41 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.29 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1859  alkylhydroperoxidase AhpD core  25 
 
 		 176 aa  52  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0505741  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  29.41 
 
 		 180 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0617  hypothetical protein  23.64 
 
 		 190 aa  48.5  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0028  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.83 
 
 		 372 aa  47.8  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  29.41 
 
 		 201 aa  45.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  24.2 
 
 		 184 aa  45.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0419  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.04 
 
 		 204 aa  44.3  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0820  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.17 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.48 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0026  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.73 
 
 		 371 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4179  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.13 
 
 		 377 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3260  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.22 
 
 		 210 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737438  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.86 
 
 		 212 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1766  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.3 
 
 		 196 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.472183 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4461  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.13 
 
 		 377 aa  41.6  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  27.15 
 
 		 172 aa  41.2  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1447  hypothetical protein  25.23 
 
 		 199 aa  41.2  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218618  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02815  probable fusion protein  25.95 
 
 		 196 aa  41.2  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.159587  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1681  hypothetical protein  30.26 
 
 		 88 aa  40.8  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.803434 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>