195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02815 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_02815  probable fusion protein  100 
 
 
196 aa  412  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.159587  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1938  carboxymuconolactone decarboxylase  75.38 
 
 
196 aa  308  2.9999999999999997e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0420591  normal  0.0162629 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3926  carboxymuconolactone decarboxylase  49.49 
 
 
196 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2761  carboxymuconolactone decarboxylase  42.11 
 
 
188 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.18 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.85 
 
 
176 aa  72  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1838  hypothetical protein  38.27 
 
 
88 aa  68.6  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.866107  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.33 
 
 
189 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.43 
 
 
192 aa  65.1  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2723  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.97 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.114348  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3281  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.73 
 
 
192 aa  64.7  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3133  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30 
 
 
190 aa  62.4  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  30.52 
 
 
194 aa  62  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.13 
 
 
192 aa  61.6  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  31.03 
 
 
192 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.25 
 
 
192 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.94 
 
 
192 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4285  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.87 
 
 
207 aa  58.9  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.75 
 
 
176 aa  58.9  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.78 
 
 
193 aa  58.5  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.78 
 
 
193 aa  58.9  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  30.61 
 
 
192 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2472  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.33 
 
 
182 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.61 
 
 
192 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.14 
 
 
192 aa  58.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.93 
 
 
192 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.61 
 
 
198 aa  58.2  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.82 
 
 
199 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.21 
 
 
196 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  29.14 
 
 
192 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.83 
 
 
201 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4868  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.93 
 
 
192 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.405716  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1899  hypothetical protein  29.11 
 
 
209 aa  57  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.25 
 
 
192 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.969731 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01722  hypothetical protein  32.32 
 
 
182 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1889  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.32 
 
 
182 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0189172  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01710  hypothetical protein  32.32 
 
 
182 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1186  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.76 
 
 
192 aa  56.2  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1437  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.32 
 
 
182 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.355525  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1976  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.32 
 
 
182 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1879  carboxymuconolactone decarboxylase  32.32 
 
 
182 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116324 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2668  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.72 
 
 
202 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2002  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.32 
 
 
182 aa  56.2  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.52682  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1913  alkylhydroperoxidase  33.83 
 
 
149 aa  55.8  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2501  alkylhydroperoxidase  25.23 
 
 
140 aa  56.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2551  alkylhydroperoxidase  25.23 
 
 
140 aa  56.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1837  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.32 
 
 
182 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2093  hypothetical protein  29.66 
 
 
201 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.868254 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8682  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.18 
 
 
192 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2999  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.16 
 
 
196 aa  55.8  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2331  alkylhydroperoxidase  33.08 
 
 
149 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.224128  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  29.25 
 
 
201 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2015  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.08 
 
 
149 aa  55.5  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.419604  hitchhiker  0.00248557 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0758  hypothetical protein  24.67 
 
 
194 aa  55.1  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3260  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.55 
 
 
210 aa  55.1  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737438  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2448  alkylhydroperoxidase  33.08 
 
 
149 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.19874  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  27.78 
 
 
202 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0103  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.17 
 
 
157 aa  54.7  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.335572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6841  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.59 
 
 
192 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6041  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.1 
 
 
152 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3847  Carboxymuconolactone decarboxylase  25 
 
 
184 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3171  carboxymuconolactone decarboxylase  24.42 
 
 
201 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1945  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.8 
 
 
196 aa  53.9  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2827  peroxidase-like  27.56 
 
 
191 aa  53.9  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00537954  normal  0.0498212 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4271  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.74 
 
 
192 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0429275  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2331  alkylhydroperoxidase  32.33 
 
 
149 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  27.91 
 
 
159 aa  53.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.68 
 
 
216 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  29.1 
 
 
145 aa  51.6  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25 
 
 
178 aa  51.2  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1695  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.4 
 
 
157 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.232521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8880  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.16 
 
 
156 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0488  Carboxymuconolactone decarboxylase  23.57 
 
 
197 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  27.33 
 
 
201 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  23.81 
 
 
183 aa  50.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3877  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.41 
 
 
200 aa  50.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0431  alkylhydroperoxidase  20.89 
 
 
195 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.283177  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4101  alkylhydroperoxidase  28.68 
 
 
143 aa  50.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3003  hypothetical protein  27.4 
 
 
191 aa  49.7  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  22.1 
 
 
182 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  22.73 
 
 
159 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  22.38 
 
 
159 aa  49.3  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  27.74 
 
 
145 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  27.74 
 
 
149 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  27.18 
 
 
156 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.53 
 
 
155 aa  49.7  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  24.43 
 
 
143 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  22.73 
 
 
159 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  39.24 
 
 
181 aa  49.3  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  26.72 
 
 
147 aa  48.9  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  25.19 
 
 
143 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0761488 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0121  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.71 
 
 
191 aa  48.9  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.464175  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  23.74 
 
 
159 aa  48.5  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  23.02 
 
 
159 aa  48.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  23.74 
 
 
159 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  23.74 
 
 
159 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2362  hypothetical protein  29.11 
 
 
113 aa  48.1  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.671484  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  23.74 
 
 
159 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  22.95 
 
 
159 aa  48.1  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  23.72 
 
 
184 aa  47.8  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>