194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6841 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6841  uncharacterized peroxidase-related enzyme  100 
 
 
192 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8682  uncharacterized peroxidase-related enzyme  94.27 
 
 
192 aa  380  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  76.56 
 
 
192 aa  318  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  77.08 
 
 
192 aa  313  9e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  73.96 
 
 
192 aa  311  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  73.96 
 
 
192 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  74.48 
 
 
192 aa  308  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  74.48 
 
 
192 aa  308  4e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  75 
 
 
189 aa  307  8e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  73.96 
 
 
192 aa  305  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  73.96 
 
 
192 aa  305  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4868  uncharacterized peroxidase-related enzyme  73.44 
 
 
192 aa  303  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.405716  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  75 
 
 
194 aa  301  5.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  71.88 
 
 
192 aa  300  9e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  72.4 
 
 
192 aa  297  7e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  72.11 
 
 
201 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2093  hypothetical protein  70 
 
 
201 aa  287  8e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.868254 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4271  uncharacterized peroxidase-related enzyme  76.84 
 
 
192 aa  286  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0429275  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2723  uncharacterized peroxidase-related enzyme  74.47 
 
 
189 aa  279  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.114348  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  68.59 
 
 
199 aa  278  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  70.05 
 
 
192 aa  277  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  68.78 
 
 
201 aa  275  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  70.27 
 
 
202 aa  275  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  69.89 
 
 
198 aa  275  3e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  66.84 
 
 
196 aa  271  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0758  hypothetical protein  66.13 
 
 
194 aa  268  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3877  uncharacterized peroxidase-related enzyme  66.49 
 
 
200 aa  267  8.999999999999999e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  68.65 
 
 
201 aa  266  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1945  uncharacterized peroxidase-related enzyme  63.02 
 
 
196 aa  263  8e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3071  uncharacterized peroxidase-related enzyme  63.35 
 
 
192 aa  261  4e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000318179  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2199  uncharacterized peroxidase-related enzyme  63.98 
 
 
195 aa  260  6.999999999999999e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2999  uncharacterized peroxidase-related enzyme  63.02 
 
 
196 aa  258  4e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1446  uncharacterized peroxidase-related enzyme  62.37 
 
 
235 aa  258  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3003  hypothetical protein  64.71 
 
 
191 aa  254  4e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3133  uncharacterized peroxidase-related enzyme  64.32 
 
 
190 aa  254  8e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1899  hypothetical protein  61.42 
 
 
209 aa  252  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2668  uncharacterized peroxidase-related enzyme  62.77 
 
 
202 aa  251  5.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4285  uncharacterized peroxidase-related enzyme  64.67 
 
 
207 aa  250  8.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.57 
 
 
193 aa  248  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.57 
 
 
193 aa  248  5e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3281  uncharacterized peroxidase-related enzyme  62.3 
 
 
192 aa  243  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1186  uncharacterized peroxidase-related enzyme  60.87 
 
 
192 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3260  uncharacterized peroxidase-related enzyme  50 
 
 
210 aa  202  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737438  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1633  uncharacterized peroxidase-related enzyme  52.91 
 
 
194 aa  191  4e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3197  uncharacterized peroxidase-related enzyme  47.83 
 
 
202 aa  190  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2532  uncharacterized peroxidase-related enzyme  48.37 
 
 
228 aa  187  9e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.872008  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  40.31 
 
 
201 aa  161  7e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  41.71 
 
 
216 aa  154  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  41.71 
 
 
217 aa  152  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  41.88 
 
 
212 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2827  peroxidase-like  38.04 
 
 
191 aa  139  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00537954  normal  0.0498212 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0121  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.99 
 
 
191 aa  139  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.464175  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  37.97 
 
 
214 aa  138  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.68 
 
 
214 aa  137  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  37.71 
 
 
190 aa  135  5e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  34.78 
 
 
195 aa  125  4.0000000000000003e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0194  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.98 
 
 
202 aa  80.9  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2585  hypothetical protein  27.89 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2630  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.89 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544935  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2624  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.89 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19737  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2544  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.09 
 
 
195 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.165226  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3017  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.19 
 
 
209 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.271489  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5106  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.33 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.153962 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2816  alkylhydroperoxidase AhpD domain protein  30.6 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0335697  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3579  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.95961  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3941  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0161606  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.17 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  29.65 
 
 
177 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0419  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.1 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  27.27 
 
 
177 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5313  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30 
 
 
197 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2539  uncharacterized peroxidase  29.33 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.82 
 
 
182 aa  67.8  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.66 
 
 
176 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1476  Carboxymuconolactone decarboxylase  25 
 
 
205 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.399629  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  26.32 
 
 
177 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4098  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.25 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.43 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  25 
 
 
172 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25 
 
 
172 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  25.88 
 
 
172 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1447  hypothetical protein  28.36 
 
 
199 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218618  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1371  Carboxymuconolactone decarboxylase  23.68 
 
 
207 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.82 
 
 
181 aa  63.5  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0195  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.01 
 
 
178 aa  62.4  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0091  alkylhydroperoxidase-related  24.63 
 
 
191 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336937  normal  0.314057 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1888  hypothetical protein  29.1 
 
 
197 aa  61.2  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0113894  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0701  macrophage infectivity potentiator-related protein, putative  25 
 
 
182 aa  61.2  0.000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000764627  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  26.63 
 
 
205 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1766  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.1 
 
 
196 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.472183 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34460  hypothetical protein  25.99 
 
 
186 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000949639  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.95 
 
 
181 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0820  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.2 
 
 
196 aa  59.3  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2761  carboxymuconolactone decarboxylase  25.73 
 
 
188 aa  58.9  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  26.67 
 
 
208 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  30.6 
 
 
192 aa  58.5  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.27 
 
 
176 aa  58.5  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  30.51 
 
 
183 aa  58.5  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2089  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.61 
 
 
196 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.82 
 
 
181 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0799261 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>