166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5313 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5313  uncharacterized peroxidase-related enzyme  100 
 
 		 197 aa  400  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2539  uncharacterized peroxidase  95.94 
 
 		 197 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3579  uncharacterized peroxidase-related enzyme  92.39 
 
 		 197 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.95961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3941  uncharacterized peroxidase-related enzyme  92.39 
 
 		 197 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0161606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5106  uncharacterized peroxidase-related enzyme  93.23 
 
 		 196 aa  362  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.153962 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0091  alkylhydroperoxidase-related  76.47 
 
 		 191 aa  294  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336937  normal  0.314057 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1888  hypothetical protein  75.39 
 
 		 197 aa  293  9e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0113894  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1766  uncharacterized peroxidase-related enzyme  73.8 
 
 		 196 aa  285  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.472183 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2089  uncharacterized peroxidase-related enzyme  71.58 
 
 		 196 aa  281  6.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0820  uncharacterized peroxidase-related enzyme  68.45 
 
 		 196 aa  280  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2544  alkylhydroperoxidase AhpD core  70.97 
 
 		 195 aa  276  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.165226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1447  hypothetical protein  67.38 
 
 		 199 aa  274  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218618  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2816  alkylhydroperoxidase AhpD domain protein  70.43 
 
 		 196 aa  272  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0335697  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0419  uncharacterized peroxidase-related enzyme  62.37 
 
 		 204 aa  250  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4506  uncharacterized peroxidase-related enzyme  63.64 
 
 		 398 aa  244  4e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256167 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3885  uncharacterized peroxidase-related enzyme  61.62 
 
 		 369 aa  237  6.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0113459  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0531  uncharacterized peroxidase-related enzyme  59.04 
 
 		 386 aa  234  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  hitchhiker  0.0000452351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3158  uncharacterized peroxidase-related enzyme  60.54 
 
 		 369 aa  233  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0028  uncharacterized peroxidase-related enzyme  46.11 
 
 		 372 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3853  uncharacterized peroxidase-related enzyme  43.09 
 
 		 192 aa  161  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.26579 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3152  uncharacterized peroxidase-related enzyme  44.5 
 
 		 372 aa  145  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.93611 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0026  uncharacterized peroxidase-related enzyme  42.63 
 
 		 371 aa  143  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0666  uncharacterized peroxidase-related enzyme  43.92 
 
 		 191 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.240929  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4461  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.68 
 
 		 377 aa  142  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4179  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.79 
 
 		 377 aa  142  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7169  hypothetical protein  40.74 
 
 		 200 aa  131  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.360229  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05610  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain  39.79 
 
 		 197 aa  120  9e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.429163  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4848  hypothetical protein  44.86 
 
 		 202 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645989 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2634  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.17 
 
 		 396 aa  114  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143285 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1051  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.89 
 
 		 195 aa  105  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2744  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.78 
 
 		 472 aa  104  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17780  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain  38.12 
 
 		 391 aa  103  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.162216  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4899  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.92 
 
 		 202 aa  101  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2316  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.5 
 
 		 210 aa  93.2  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.463838 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2999  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.01 
 
 		 196 aa  86.3  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2827  peroxidase-like  33.81 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00537954  normal  0.0498212 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.67 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  34 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.82 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  33.82 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.45 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.35 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  29.68 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.09 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.62 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1186  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.57 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.62 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  32.35 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.35 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0121  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.57 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.464175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  31.61 
 
 		 194 aa  77.8  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4868  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.35 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.405716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3071  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.35 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000318179  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.15 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.3 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.19 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.33 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0758  hypothetical protein  29.19 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1446  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.33 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3003  hypothetical protein  27.81 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  35.16 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.19 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3281  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1945  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.79 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.53 
 
 		 198 aa  71.2  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3877  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.12 
 
 		 200 aa  71.2  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  28.22 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6841  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2199  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.09 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.53 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1633  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.43 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2093  hypothetical protein  27.22 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.868254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3017  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.77 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.271489  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.67 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3133  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.99 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8682  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.67 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  29.93 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4562  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.53 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2723  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.67 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.114348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3260  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.65 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737438  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  27.78 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4285  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.5 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0194  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.08 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2668  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.57 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6526  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.33 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00474121  normal  0.101119 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1739  hypothetical protein  27.68 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0852288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1899  hypothetical protein  27.27 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.7 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4271  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.88 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0429275  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.62 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  29.84 
 
 		 201 aa  62  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.33 
 
 		 193 aa  62  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2585  hypothetical protein  34.15 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2630  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.15 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2624  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.15 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1869  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.43 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0138584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8777  peroxidase family protein  33.56 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2532  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.39 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.872008  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3197  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.75 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0195  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.28 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>