227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4522 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  100 
 
 
217 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  88.94 
 
 
216 aa  390  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  72.73 
 
 
212 aa  279  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0121  uncharacterized peroxidase-related enzyme  67.39 
 
 
191 aa  252  3e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.464175  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  64.29 
 
 
190 aa  239  2e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2827  peroxidase-like  57.49 
 
 
191 aa  194  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00537954  normal  0.0498212 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  47.13 
 
 
192 aa  176  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  46.86 
 
 
192 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  46.29 
 
 
192 aa  174  9e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.98 
 
 
192 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  48.81 
 
 
201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  46.55 
 
 
192 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  46.55 
 
 
192 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  47.62 
 
 
202 aa  171  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4868  uncharacterized peroxidase-related enzyme  46.55 
 
 
192 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.405716  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  48.54 
 
 
199 aa  171  9e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  44.83 
 
 
192 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.55 
 
 
196 aa  169  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  44.83 
 
 
192 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  47.67 
 
 
198 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  45.09 
 
 
192 aa  168  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  47.09 
 
 
201 aa  168  7e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  44.57 
 
 
192 aa  167  8e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  45.71 
 
 
189 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2532  uncharacterized peroxidase-related enzyme  47.13 
 
 
228 aa  165  5e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.872008  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  47.22 
 
 
201 aa  164  9e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1945  uncharacterized peroxidase-related enzyme  47.37 
 
 
196 aa  162  4.0000000000000004e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  45.4 
 
 
194 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2093  hypothetical protein  45.56 
 
 
201 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.868254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0758  hypothetical protein  45.88 
 
 
194 aa  161  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3197  uncharacterized peroxidase-related enzyme  45.98 
 
 
202 aa  161  8.000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2199  uncharacterized peroxidase-related enzyme  44.38 
 
 
195 aa  159  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1446  uncharacterized peroxidase-related enzyme  43.68 
 
 
235 aa  159  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3003  hypothetical protein  44.69 
 
 
191 aa  157  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  44.83 
 
 
192 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8682  uncharacterized peroxidase-related enzyme  42.29 
 
 
192 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2668  uncharacterized peroxidase-related enzyme  45.45 
 
 
202 aa  156  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  44.71 
 
 
193 aa  156  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3071  uncharacterized peroxidase-related enzyme  44.12 
 
 
192 aa  156  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000318179  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3281  uncharacterized peroxidase-related enzyme  45.88 
 
 
192 aa  155  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  45.71 
 
 
201 aa  155  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4285  uncharacterized peroxidase-related enzyme  45.61 
 
 
207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  44.71 
 
 
193 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3133  uncharacterized peroxidase-related enzyme  44.12 
 
 
190 aa  155  6e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2999  uncharacterized peroxidase-related enzyme  46.99 
 
 
196 aa  153  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6841  uncharacterized peroxidase-related enzyme  41.71 
 
 
192 aa  152  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  45.2 
 
 
214 aa  152  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3877  uncharacterized peroxidase-related enzyme  42.94 
 
 
200 aa  151  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1899  hypothetical protein  44.32 
 
 
209 aa  151  8.999999999999999e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1186  uncharacterized peroxidase-related enzyme  45.03 
 
 
192 aa  150  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2723  uncharacterized peroxidase-related enzyme  50 
 
 
189 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.114348  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4271  uncharacterized peroxidase-related enzyme  45.66 
 
 
192 aa  142  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0429275  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  37.57 
 
 
195 aa  134  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  40.46 
 
 
214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3260  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.36 
 
 
210 aa  123  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737438  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1633  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.64 
 
 
194 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0194  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.99 
 
 
202 aa  96.7  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3017  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.16 
 
 
209 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.271489  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2585  hypothetical protein  30.99 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2630  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.99 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544935  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2624  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.99 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19737  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.29 
 
 
181 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0195  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.07 
 
 
178 aa  79.3  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  31.29 
 
 
181 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.72 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0531  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.9 
 
 
386 aa  76.3  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  hitchhiker  0.0000452351 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  31.61 
 
 
227 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2539  uncharacterized peroxidase  34.19 
 
 
197 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.58 
 
 
176 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4506  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.52 
 
 
398 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.256167 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1766  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.33 
 
 
196 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.472183 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5313  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.19 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3941  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.33 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0161606  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30 
 
 
172 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  30 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.59 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6526  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.04 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00474121  normal  0.101119 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3579  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.33 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.95961  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5106  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.33 
 
 
196 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.153962 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.74 
 
 
178 aa  71.2  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0820  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.77 
 
 
196 aa  71.2  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1888  hypothetical protein  32.48 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0113894  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0091  alkylhydroperoxidase-related  31.62 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336937  normal  0.314057 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.87 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2695  peroxidase-like  27.61 
 
 
202 aa  69.7  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.500229 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.14 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  30.54 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2816  alkylhydroperoxidase AhpD domain protein  31.34 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0335697  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  28.57 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2089  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.77 
 
 
196 aa  68.6  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.41 
 
 
172 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1447  hypothetical protein  28.05 
 
 
199 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218618  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2544  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.51 
 
 
195 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.165226  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0419  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.16 
 
 
204 aa  67  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  32.26 
 
 
178 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3164  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 
179 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5073  alkylhydroperoxidase  33.54 
 
 
179 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5204  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
179 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.28 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.19 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>