222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5290 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  100 
 
 
192 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  97.4 
 
 
192 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  92.71 
 
 
192 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  92.71 
 
 
192 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4868  uncharacterized peroxidase-related enzyme  91.67 
 
 
192 aa  370  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.405716  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  91.15 
 
 
192 aa  371  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  91.15 
 
 
192 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  83.33 
 
 
192 aa  337  5e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  82.81 
 
 
192 aa  336  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  80.21 
 
 
192 aa  324  6e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  80.43 
 
 
189 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8682  uncharacterized peroxidase-related enzyme  76.04 
 
 
192 aa  313  8e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  77.54 
 
 
201 aa  310  9e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  78.26 
 
 
194 aa  309  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6841  uncharacterized peroxidase-related enzyme  74.48 
 
 
192 aa  308  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4271  uncharacterized peroxidase-related enzyme  80.53 
 
 
192 aa  308  5e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0429275  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  75 
 
 
192 aa  306  9e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2093  hypothetical protein  74.46 
 
 
201 aa  299  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.868254 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  74.87 
 
 
192 aa  298  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  73.58 
 
 
201 aa  296  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  72.97 
 
 
202 aa  291  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  71.96 
 
 
201 aa  288  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  71.51 
 
 
199 aa  288  4e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  72.43 
 
 
196 aa  288  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  71.51 
 
 
198 aa  285  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0758  hypothetical protein  69.89 
 
 
194 aa  284  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2723  uncharacterized peroxidase-related enzyme  77.3 
 
 
189 aa  284  5e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.114348  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2199  uncharacterized peroxidase-related enzyme  67.74 
 
 
195 aa  274  7e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3877  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.41 
 
 
200 aa  272  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3071  uncharacterized peroxidase-related enzyme  66.67 
 
 
192 aa  271  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000318179  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1945  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.1 
 
 
196 aa  270  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1446  uncharacterized peroxidase-related enzyme  64.21 
 
 
235 aa  268  4e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3003  hypothetical protein  66.84 
 
 
191 aa  265  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4285  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.95 
 
 
207 aa  261  4.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  67.93 
 
 
193 aa  261  4.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  67.93 
 
 
193 aa  260  6.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2668  uncharacterized peroxidase-related enzyme  64.02 
 
 
202 aa  259  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1186  uncharacterized peroxidase-related enzyme  66.85 
 
 
192 aa  258  3e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3133  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.41 
 
 
190 aa  258  5.0000000000000005e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3281  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.57 
 
 
192 aa  257  9e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1899  hypothetical protein  61.69 
 
 
209 aa  256  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2999  uncharacterized peroxidase-related enzyme  64.67 
 
 
196 aa  253  8e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3260  uncharacterized peroxidase-related enzyme  56.61 
 
 
210 aa  221  6e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737438  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3197  uncharacterized peroxidase-related enzyme  53.26 
 
 
202 aa  210  9e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2532  uncharacterized peroxidase-related enzyme  50.79 
 
 
228 aa  202  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.872008  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1633  uncharacterized peroxidase-related enzyme  54.07 
 
 
194 aa  197  7e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  44.83 
 
 
217 aa  170  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  43.1 
 
 
216 aa  168  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  43.02 
 
 
190 aa  167  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0121  uncharacterized peroxidase-related enzyme  40.76 
 
 
191 aa  160  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.464175  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  46.88 
 
 
212 aa  159  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  40 
 
 
201 aa  159  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2827  peroxidase-like  39.67 
 
 
191 aa  152  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00537954  normal  0.0498212 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  37.97 
 
 
214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.46 
 
 
214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  35.87 
 
 
195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0194  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.46 
 
 
202 aa  89.7  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2585  hypothetical protein  29.57 
 
 
208 aa  87.8  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2630  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.57 
 
 
208 aa  87.8  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544935  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2624  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.57 
 
 
208 aa  87.8  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19737  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3017  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.5 
 
 
209 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.271489  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3579  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.88 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.95961  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3941  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.88 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0161606  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5106  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.62 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.153962 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5313  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.62 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2539  uncharacterized peroxidase  30.88 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  26.47 
 
 
172 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2544  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.19 
 
 
195 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.165226  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  25.29 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2816  alkylhydroperoxidase AhpD domain protein  30.19 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0335697  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.29 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  31.48 
 
 
177 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0419  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.34 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.3 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.25 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  28.48 
 
 
177 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1476  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.79 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.399629  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.67 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0820  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.41 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.57 
 
 
181 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  29.94 
 
 
181 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.26 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1371  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.37 
 
 
207 aa  71.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2089  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30 
 
 
196 aa  71.2  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.68 
 
 
181 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  27.81 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0745  hypothetical protein  25.57 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.680464  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  27.5 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6526  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.71 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00474121  normal  0.101119 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1766  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.93 
 
 
196 aa  68.2  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.472183 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.08 
 
 
178 aa  67.8  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1888  hypothetical protein  29.77 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0113894  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  30.41 
 
 
227 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.19 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0195  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.94 
 
 
178 aa  67  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0103  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.1 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1447  hypothetical protein  26.32 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218618  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.8 
 
 
176 aa  67  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0531  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.21 
 
 
386 aa  66.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  hitchhiker  0.0000452351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>