193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3003 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3003  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1899  hypothetical protein  86.01 
 
 		 209 aa  342  2.9999999999999997e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3281  uncharacterized peroxidase-related enzyme  84.04 
 
 		 192 aa  330  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2668  uncharacterized peroxidase-related enzyme  81.68 
 
 		 202 aa  327  7e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4285  uncharacterized peroxidase-related enzyme  80.73 
 
 		 207 aa  326  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3133  uncharacterized peroxidase-related enzyme  80.32 
 
 		 190 aa  322  1e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  80.85 
 
 		 193 aa  320  9.999999999999999e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  80.32 
 
 		 193 aa  318  3e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  79.14 
 
 		 196 aa  309  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0758  hypothetical protein  78.72 
 
 		 194 aa  307  5e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  76.06 
 
 		 198 aa  303  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  75 
 
 		 199 aa  298  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  76.22 
 
 		 202 aa  299  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  73.4 
 
 		 201 aa  295  4e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  75.68 
 
 		 201 aa  294  5e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  69.35 
 
 		 201 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  71.98 
 
 		 192 aa  281  4.0000000000000003e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1945  uncharacterized peroxidase-related enzyme  68.72 
 
 		 196 aa  279  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2093  hypothetical protein  66.84 
 
 		 201 aa  278  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.868254 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  68.45 
 
 		 194 aa  278  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  69.23 
 
 		 192 aa  275  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  69.23 
 
 		 192 aa  274  6e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  67.58 
 
 		 192 aa  274  6e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  69.78 
 
 		 189 aa  272  3e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  68.13 
 
 		 192 aa  268  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  66.31 
 
 		 192 aa  267  5.9999999999999995e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  66.84 
 
 		 192 aa  265  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  67.2 
 
 		 192 aa  265  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4868  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.24 
 
 		 192 aa  263  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.405716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  65.24 
 
 		 192 aa  263  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.24 
 
 		 192 aa  263  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  65.93 
 
 		 192 aa  261  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8682  uncharacterized peroxidase-related enzyme  66.31 
 
 		 192 aa  261  4e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2999  uncharacterized peroxidase-related enzyme  66.13 
 
 		 196 aa  258  4e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1186  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.41 
 
 		 192 aa  258  5.0000000000000005e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6841  uncharacterized peroxidase-related enzyme  64.71 
 
 		 192 aa  254  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2723  uncharacterized peroxidase-related enzyme  70.88 
 
 		 189 aa  246  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.114348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4271  uncharacterized peroxidase-related enzyme  68.68 
 
 		 192 aa  243  9e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0429275  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3071  uncharacterized peroxidase-related enzyme  61.2 
 
 		 192 aa  241  7e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000318179  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2199  uncharacterized peroxidase-related enzyme  60.66 
 
 		 195 aa  239  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3877  uncharacterized peroxidase-related enzyme  57.92 
 
 		 200 aa  235  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1446  uncharacterized peroxidase-related enzyme  58.47 
 
 		 235 aa  231  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3197  uncharacterized peroxidase-related enzyme  52.2 
 
 		 202 aa  204  5e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3260  uncharacterized peroxidase-related enzyme  51.61 
 
 		 210 aa  204  6e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737438  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1633  uncharacterized peroxidase-related enzyme  53.67 
 
 		 194 aa  197  7e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2532  uncharacterized peroxidase-related enzyme  49.17 
 
 		 228 aa  190  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.872008  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  44.13 
 
 		 216 aa  159  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  43.98 
 
 		 190 aa  158  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0121  uncharacterized peroxidase-related enzyme  42.46 
 
 		 191 aa  156  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.464175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  44.69 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  47.2 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2827  peroxidase-like  39.23 
 
 		 191 aa  148  6e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00537954  normal  0.0498212 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  39.23 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  39.13 
 
 		 214 aa  144  9e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  37.78 
 
 		 195 aa  140  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.96 
 
 		 214 aa  135  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0194  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.13 
 
 		 202 aa  81.3  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0195  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.48 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2585  hypothetical protein  28.8 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2630  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.8 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2624  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.8 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3017  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.26 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.271489  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3579  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.48 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.95961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3941  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.48 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0161606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5106  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.48 
 
 		 196 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.153962 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5313  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.81 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2539  uncharacterized peroxidase  27.81 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2816  alkylhydroperoxidase AhpD domain protein  28.48 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0335697  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2089  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.81 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3853  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.15 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.26579 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1888  hypothetical protein  27.15 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0113894  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  27.84 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2544  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.49 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.165226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.55 
 
 		 180 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  28.99 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0820  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.62 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0419  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.12 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  25.45 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0531  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.68 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  hitchhiker  0.0000452351 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0091  alkylhydroperoxidase-related  24.68 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336937  normal  0.314057 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0745  hypothetical protein  25.48 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.680464  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  27.03 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.88 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0460  carboxymuconolactone decarboxylase  27.22 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.04 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.3 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  24.24 
 
 		 172 aa  62  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2695  peroxidase-like  28.03 
 
 		 202 aa  62  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.500229 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.24 
 
 		 172 aa  62  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  27.22 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6526  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.16 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00474121  normal  0.101119 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1537  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.97 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1766  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.17 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.472183 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.24 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  26.63 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.31 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0103  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.56 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.52 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.44 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  26.44 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>