189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8682 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011892  Mnod_8682  uncharacterized peroxidase-related enzyme  100 
 
 
192 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6841  uncharacterized peroxidase-related enzyme  94.27 
 
 
192 aa  380  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  75.52 
 
 
192 aa  317  7.999999999999999e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  77.6 
 
 
192 aa  316  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  76.04 
 
 
192 aa  313  8e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  74.48 
 
 
192 aa  312  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  76.04 
 
 
192 aa  312  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  74.48 
 
 
192 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  76.04 
 
 
192 aa  310  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  76.04 
 
 
192 aa  310  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4868  uncharacterized peroxidase-related enzyme  75.52 
 
 
192 aa  309  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.405716  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  75.53 
 
 
189 aa  308  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  73.96 
 
 
192 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  75.53 
 
 
194 aa  302  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  73.44 
 
 
192 aa  300  1e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  73.68 
 
 
201 aa  295  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2093  hypothetical protein  71.58 
 
 
201 aa  292  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.868254 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4271  uncharacterized peroxidase-related enzyme  75.79 
 
 
192 aa  282  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0429275  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2723  uncharacterized peroxidase-related enzyme  75 
 
 
189 aa  281  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.114348  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  69.11 
 
 
199 aa  281  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  71.12 
 
 
192 aa  280  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  71.35 
 
 
202 aa  280  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  68.78 
 
 
201 aa  278  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  70.43 
 
 
198 aa  277  5e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  67.89 
 
 
196 aa  276  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0758  hypothetical protein  67.2 
 
 
194 aa  272  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1945  uncharacterized peroxidase-related enzyme  64.58 
 
 
196 aa  271  4.0000000000000004e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  69.73 
 
 
201 aa  270  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3877  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.95 
 
 
200 aa  267  5e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2199  uncharacterized peroxidase-related enzyme  64.52 
 
 
195 aa  265  2.9999999999999995e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3071  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.05 
 
 
192 aa  265  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000318179  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1446  uncharacterized peroxidase-related enzyme  62.9 
 
 
235 aa  262  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3003  hypothetical protein  66.31 
 
 
191 aa  261  4e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2999  uncharacterized peroxidase-related enzyme  63.02 
 
 
196 aa  261  4.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3133  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.41 
 
 
190 aa  258  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1899  hypothetical protein  62.94 
 
 
209 aa  257  8e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4285  uncharacterized peroxidase-related enzyme  66.3 
 
 
207 aa  256  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2668  uncharacterized peroxidase-related enzyme  63.83 
 
 
202 aa  255  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  66.67 
 
 
193 aa  253  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  66.67 
 
 
193 aa  252  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3281  uncharacterized peroxidase-related enzyme  63.39 
 
 
192 aa  249  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1186  uncharacterized peroxidase-related enzyme  61.96 
 
 
192 aa  248  5e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3260  uncharacterized peroxidase-related enzyme  49.74 
 
 
210 aa  203  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737438  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1633  uncharacterized peroxidase-related enzyme  52.91 
 
 
194 aa  194  6e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3197  uncharacterized peroxidase-related enzyme  48.37 
 
 
202 aa  193  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2532  uncharacterized peroxidase-related enzyme  48.37 
 
 
228 aa  188  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.872008  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  41.71 
 
 
216 aa  159  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  38.74 
 
 
201 aa  159  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  42.29 
 
 
217 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0121  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.31 
 
 
191 aa  141  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.464175  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  40.24 
 
 
190 aa  141  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  41.88 
 
 
212 aa  141  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  36.9 
 
 
214 aa  135  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.67 
 
 
214 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2827  peroxidase-like  36.41 
 
 
191 aa  133  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00537954  normal  0.0498212 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  33.15 
 
 
195 aa  119  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0194  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.94 
 
 
202 aa  77.8  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2544  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.34 
 
 
195 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.165226  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.87 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5106  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.41 
 
 
196 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.153962 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2816  alkylhydroperoxidase AhpD domain protein  29.85 
 
 
196 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0335697  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2585  hypothetical protein  27.67 
 
 
208 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2630  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.67 
 
 
208 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544935  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2624  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.67 
 
 
208 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19737  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3941  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.36 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0161606  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3579  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.36 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.95961  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  26.22 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  26.86 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0419  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.36 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1476  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.67 
 
 
205 aa  68.6  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.399629  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.41 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5313  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.67 
 
 
197 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  38.1 
 
 
172 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3017  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.45 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.271489  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2539  uncharacterized peroxidase  27.21 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1371  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.42 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  38.1 
 
 
172 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34460  hypothetical protein  27.12 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000949639  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.1 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  27.57 
 
 
205 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.82 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4098  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.89 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.47 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  28.33 
 
 
208 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  27.04 
 
 
177 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.76 
 
 
182 aa  62.8  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2761  carboxymuconolactone decarboxylase  26.9 
 
 
188 aa  62  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0701  macrophage infectivity potentiator-related protein, putative  23.73 
 
 
182 aa  62  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000764627  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.65 
 
 
181 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1888  hypothetical protein  28.36 
 
 
197 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0113894  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.29 
 
 
181 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1766  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.36 
 
 
196 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.472183 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3639  alkylhydroperoxidase  26.97 
 
 
219 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0195  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.74 
 
 
178 aa  59.7  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2094  alkylhydroperoxidase  26.97 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.89 
 
 
176 aa  58.9  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1447  hypothetical protein  26.12 
 
 
199 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218618  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  28.3 
 
 
181 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2089  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.87 
 
 
196 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0820  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.37 
 
 
196 aa  58.5  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>