227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2001 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  100 
 
 		 198 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  96.46 
 
 		 199 aa  401  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  87.56 
 
 		 201 aa  370  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0758  hypothetical protein  81.96 
 
 		 194 aa  348  4e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  81.73 
 
 		 196 aa  337  9e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  83.07 
 
 		 202 aa  331  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  83.07 
 
 		 201 aa  328  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  78.42 
 
 		 193 aa  318  1.9999999999999998e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3281  uncharacterized peroxidase-related enzyme  78.84 
 
 		 192 aa  317  6e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  77.89 
 
 		 193 aa  317  7.999999999999999e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4285  uncharacterized peroxidase-related enzyme  77.89 
 
 		 207 aa  317  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2668  uncharacterized peroxidase-related enzyme  76.41 
 
 		 202 aa  315  2e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1899  hypothetical protein  76.5 
 
 		 209 aa  312  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3133  uncharacterized peroxidase-related enzyme  75.79 
 
 		 190 aa  311  2.9999999999999996e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1945  uncharacterized peroxidase-related enzyme  75.26 
 
 		 196 aa  311  4.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  72.92 
 
 		 194 aa  303  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3003  hypothetical protein  76.06 
 
 		 191 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  72.16 
 
 		 201 aa  300  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  74.73 
 
 		 192 aa  298  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  75.94 
 
 		 189 aa  298  4e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  74.19 
 
 		 192 aa  296  1e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  76.88 
 
 		 192 aa  296  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2093  hypothetical protein  70.1 
 
 		 201 aa  295  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.868254 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  73.68 
 
 		 192 aa  295  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  70.98 
 
 		 192 aa  294  7e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  72.04 
 
 		 192 aa  288  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  71.28 
 
 		 192 aa  287  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  71.73 
 
 		 192 aa  286  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  71.51 
 
 		 192 aa  285  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  71.51 
 
 		 192 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  71.51 
 
 		 192 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4868  uncharacterized peroxidase-related enzyme  71.51 
 
 		 192 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.405716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8682  uncharacterized peroxidase-related enzyme  70.43 
 
 		 192 aa  277  6e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6841  uncharacterized peroxidase-related enzyme  69.89 
 
 		 192 aa  275  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2999  uncharacterized peroxidase-related enzyme  68.09 
 
 		 196 aa  267  8e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1186  uncharacterized peroxidase-related enzyme  66.67 
 
 		 192 aa  266  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4271  uncharacterized peroxidase-related enzyme  72.4 
 
 		 192 aa  264  7e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0429275  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3877  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.26 
 
 		 200 aa  261  6.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2723  uncharacterized peroxidase-related enzyme  73.66 
 
 		 189 aa  260  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.114348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3071  uncharacterized peroxidase-related enzyme  63.21 
 
 		 192 aa  256  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000318179  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1446  uncharacterized peroxidase-related enzyme  64.17 
 
 		 235 aa  252  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2199  uncharacterized peroxidase-related enzyme  62.69 
 
 		 195 aa  251  6e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3260  uncharacterized peroxidase-related enzyme  53.93 
 
 		 210 aa  221  7e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737438  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3197  uncharacterized peroxidase-related enzyme  53.51 
 
 		 202 aa  207  8e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2532  uncharacterized peroxidase-related enzyme  50.27 
 
 		 228 aa  199  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.872008  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1633  uncharacterized peroxidase-related enzyme  53.37 
 
 		 194 aa  190  1e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  47.09 
 
 		 216 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  47.67 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  45.29 
 
 		 190 aa  158  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  42.47 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0121  uncharacterized peroxidase-related enzyme  41.49 
 
 		 191 aa  156  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.464175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  40.64 
 
 		 214 aa  154  6e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.13 
 
 		 214 aa  149  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  44.12 
 
 		 212 aa  148  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  39.8 
 
 		 195 aa  148  5e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2827  peroxidase-like  41.4 
 
 		 191 aa  141  5e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00537954  normal  0.0498212 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2585  hypothetical protein  31.58 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2630  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.58 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2624  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.58 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3017  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.69 
 
 		 209 aa  88.2  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.271489  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0194  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.98 
 
 		 202 aa  87.4  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.54 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.9 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2816  alkylhydroperoxidase AhpD domain protein  29.53 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0335697  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  26.9 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  29.31 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0195  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.41 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.65 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3579  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.93 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.95961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.32 
 
 		 172 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  26.32 
 
 		 172 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  28.99 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2539  uncharacterized peroxidase  29.53 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5313  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.53 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6526  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.37 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00474121  normal  0.101119 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  29.38 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  28.41 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.76 
 
 		 180 aa  70.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.98 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3941  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.19 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0161606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.63 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5106  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.83 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.153962 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34460  hypothetical protein  28.98 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000949639  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1739  hypothetical protein  29.35 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0852288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2544  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.17 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.165226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.41 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0460  carboxymuconolactone decarboxylase  27.87 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  28.4 
 
 		 181 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.81 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1476  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.64 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.399629  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1021  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.67 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.24 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4098  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.14 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.25 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3853  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.45 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.26579 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.53 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1371  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.45 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3159  carboxymuconolactone decarboxylase  31.45 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  28.87 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0419  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.41 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>