193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3260 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3260  uncharacterized peroxidase-related enzyme  100 
 
 		 210 aa  412  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737438  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  55.91 
 
 		 192 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  55.32 
 
 		 194 aa  226  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2093  hypothetical protein  53.85 
 
 		 201 aa  225  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.868254 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  53.89 
 
 		 199 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  52.85 
 
 		 201 aa  223  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0758  hypothetical protein  52.36 
 
 		 194 aa  221  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1186  uncharacterized peroxidase-related enzyme  56.02 
 
 		 192 aa  221  4.9999999999999996e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  56.61 
 
 		 192 aa  221  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  53.93 
 
 		 198 aa  221  6e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  55.26 
 
 		 192 aa  219  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  53.09 
 
 		 201 aa  218  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  54.26 
 
 		 192 aa  216  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3071  uncharacterized peroxidase-related enzyme  54.01 
 
 		 192 aa  216  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000318179  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  55.03 
 
 		 192 aa  215  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  55.03 
 
 		 192 aa  215  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  54.21 
 
 		 192 aa  215  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4868  uncharacterized peroxidase-related enzyme  55.03 
 
 		 192 aa  215  5e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.405716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4285  uncharacterized peroxidase-related enzyme  53.19 
 
 		 207 aa  214  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3877  uncharacterized peroxidase-related enzyme  55.85 
 
 		 200 aa  213  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  53.97 
 
 		 196 aa  211  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2199  uncharacterized peroxidase-related enzyme  52.63 
 
 		 195 aa  211  5.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  52.69 
 
 		 192 aa  211  7.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  52.97 
 
 		 189 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  53.44 
 
 		 202 aa  210  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  52.94 
 
 		 192 aa  210  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  52.69 
 
 		 192 aa  209  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3133  uncharacterized peroxidase-related enzyme  50.79 
 
 		 190 aa  209  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1945  uncharacterized peroxidase-related enzyme  53.16 
 
 		 196 aa  207  7e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  52.15 
 
 		 192 aa  207  7e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1446  uncharacterized peroxidase-related enzyme  52.41 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  53.44 
 
 		 201 aa  206  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3003  hypothetical protein  51.61 
 
 		 191 aa  204  6e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2668  uncharacterized peroxidase-related enzyme  48.96 
 
 		 202 aa  204  6e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8682  uncharacterized peroxidase-related enzyme  49.74 
 
 		 192 aa  203  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6841  uncharacterized peroxidase-related enzyme  50 
 
 		 192 aa  202  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  50.8 
 
 		 193 aa  202  4e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3281  uncharacterized peroxidase-related enzyme  51.08 
 
 		 192 aa  201  9e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  50.27 
 
 		 193 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1899  hypothetical protein  49.21 
 
 		 209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2999  uncharacterized peroxidase-related enzyme  52.66 
 
 		 196 aa  193  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2532  uncharacterized peroxidase-related enzyme  49.19 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.872008  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4271  uncharacterized peroxidase-related enzyme  52.94 
 
 		 192 aa  185  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0429275  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3197  uncharacterized peroxidase-related enzyme  49.73 
 
 		 202 aa  183  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1633  uncharacterized peroxidase-related enzyme  52.49 
 
 		 194 aa  181  7e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2723  uncharacterized peroxidase-related enzyme  51.83 
 
 		 189 aa  180  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.114348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  42.71 
 
 		 201 aa  158  6e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  37.7 
 
 		 195 aa  129  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0121  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.33 
 
 		 191 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.464175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.5 
 
 		 216 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  31.28 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  33.71 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.5 
 
 		 212 aa  125  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.36 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2827  peroxidase-like  31.89 
 
 		 191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00537954  normal  0.0498212 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.98 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0194  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.25 
 
 		 202 aa  90.9  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0195  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.29 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2585  hypothetical protein  26.73 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2630  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.73 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2624  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.73 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  31.13 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1476  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.57 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.399629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3017  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.42 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.271489  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  30.46 
 
 		 177 aa  72  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1371  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.57 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5313  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.65 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  31.43 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6526  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.94 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00474121  normal  0.101119 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.73 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  28.73 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4562  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.13 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.54 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0091  alkylhydroperoxidase-related  36.11 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336937  normal  0.314057 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5106  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.65 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.153962 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2544  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.86 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.165226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2539  uncharacterized peroxidase  31.01 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3579  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.75 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.95961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  29.3 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3941  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.75 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0161606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.15 
 
 		 179 aa  62  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2816  alkylhydroperoxidase AhpD domain protein  34.86 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0335697  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1739  hypothetical protein  29.11 
 
 		 202 aa  62  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0852288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.7 
 
 		 184 aa  62  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.51 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1447  hypothetical protein  33.33 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218618  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0745  hypothetical protein  25.82 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.680464  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1888  hypothetical protein  35.19 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0113894  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  24.86 
 
 		 178 aa  61.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.17 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2089  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.26 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6744  alkylhydroperoxidase  30.29 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20217  normal  0.329225 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0419  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.41 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2695  peroxidase-like  27.91 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.500229 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2094  alkylhydroperoxidase  30.6 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4078  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.71 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.201946  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0460  carboxymuconolactone decarboxylase  31.4 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6383  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  decreased coverage  0.00344136 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  28 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0320  carboxymuconolactone decarboxylase  27.1 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>