213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5135 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  100 
 
 		 189 aa  390  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  84.24 
 
 		 192 aa  333  7.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  83.7 
 
 		 192 aa  332  2e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  82.54 
 
 		 194 aa  329  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2093  hypothetical protein  82.01 
 
 		 201 aa  328  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.868254 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  81.77 
 
 		 192 aa  329  2e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  79.79 
 
 		 192 aa  320  5e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  78.84 
 
 		 201 aa  316  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  80.43 
 
 		 192 aa  317  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  79.35 
 
 		 192 aa  314  5e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  78.8 
 
 		 192 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  78.8 
 
 		 192 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  78.8 
 
 		 192 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4868  uncharacterized peroxidase-related enzyme  78.26 
 
 		 192 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.405716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8682  uncharacterized peroxidase-related enzyme  75.53 
 
 		 192 aa  308  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6841  uncharacterized peroxidase-related enzyme  75 
 
 		 192 aa  307  6.999999999999999e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  78.84 
 
 		 192 aa  305  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  76.63 
 
 		 192 aa  305  4.0000000000000004e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  75.13 
 
 		 199 aa  298  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  74.35 
 
 		 196 aa  299  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  75.94 
 
 		 198 aa  298  3e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  75.79 
 
 		 201 aa  298  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  75.54 
 
 		 202 aa  296  9e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  74.07 
 
 		 201 aa  294  6e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2723  uncharacterized peroxidase-related enzyme  79.89 
 
 		 189 aa  288  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.114348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0758  hypothetical protein  70.53 
 
 		 194 aa  283  7e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4271  uncharacterized peroxidase-related enzyme  77.72 
 
 		 192 aa  281  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0429275  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3877  uncharacterized peroxidase-related enzyme  68.78 
 
 		 200 aa  276  9e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1945  uncharacterized peroxidase-related enzyme  67.91 
 
 		 196 aa  273  9e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3003  hypothetical protein  69.78 
 
 		 191 aa  272  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1186  uncharacterized peroxidase-related enzyme  70.65 
 
 		 192 aa  270  6e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2199  uncharacterized peroxidase-related enzyme  69.19 
 
 		 195 aa  270  7e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3281  uncharacterized peroxidase-related enzyme  69.95 
 
 		 192 aa  268  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4285  uncharacterized peroxidase-related enzyme  68.82 
 
 		 207 aa  269  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1446  uncharacterized peroxidase-related enzyme  68.65 
 
 		 235 aa  268  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  69.02 
 
 		 193 aa  266  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2668  uncharacterized peroxidase-related enzyme  67.2 
 
 		 202 aa  266  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  69.02 
 
 		 193 aa  266  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2999  uncharacterized peroxidase-related enzyme  69.19 
 
 		 196 aa  266  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3071  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.41 
 
 		 192 aa  265  4e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000318179  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1899  hypothetical protein  66.32 
 
 		 209 aa  263  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3133  uncharacterized peroxidase-related enzyme  66.49 
 
 		 190 aa  262  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3197  uncharacterized peroxidase-related enzyme  52.97 
 
 		 202 aa  209  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3260  uncharacterized peroxidase-related enzyme  52.97 
 
 		 210 aa  210  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737438  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2532  uncharacterized peroxidase-related enzyme  48.15 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.872008  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1633  uncharacterized peroxidase-related enzyme  52.91 
 
 		 194 aa  190  1e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  43.09 
 
 		 216 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  45.71 
 
 		 217 aa  167  8e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  42.39 
 
 		 201 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  48.12 
 
 		 212 aa  160  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  41.05 
 
 		 190 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0121  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.83 
 
 		 191 aa  154  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.464175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  39.78 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2827  peroxidase-like  38.59 
 
 		 191 aa  146  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00537954  normal  0.0498212 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.57 
 
 		 214 aa  141  7e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  36.36 
 
 		 195 aa  140  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2585  hypothetical protein  29.32 
 
 		 208 aa  87  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2630  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.32 
 
 		 208 aa  87  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2624  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.32 
 
 		 208 aa  87  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3017  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.03 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.271489  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0194  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.03 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5106  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.63 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.153962 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0195  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.88 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3579  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.48 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.95961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.33 
 
 		 180 aa  74.3  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3941  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.67 
 
 		 197 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0161606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0419  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.6 
 
 		 204 aa  74.3  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2539  uncharacterized peroxidase  31.33 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5313  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.33 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2816  alkylhydroperoxidase AhpD domain protein  28.48 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0335697  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.29 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  25.29 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  28.75 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  29.14 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1476  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.33 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.399629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2544  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.1 
 
 		 195 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.165226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  28.57 
 
 		 177 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0820  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.81 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  28.21 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.25 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.41 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  25.58 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.13 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.49 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.61 
 
 		 172 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1371  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.67 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.75 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.61 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  28.98 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.24 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  27.94 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  29.41 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.67 
 
 		 178 aa  67  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02815  probable fusion protein  33.33 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.159587  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.49 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  23.95 
 
 		 176 aa  67  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1524  carboxymuconolactone decarboxylase  27.65 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  28.57 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  29.24 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2761  carboxymuconolactone decarboxylase  28.07 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>