234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4675 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  100 
 
 
201 aa  416  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  94.55 
 
 
202 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  83.59 
 
 
196 aa  338  5e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  83.07 
 
 
198 aa  328  3e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0758  hypothetical protein  80.63 
 
 
194 aa  324  7e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  81.48 
 
 
199 aa  323  9e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  79.37 
 
 
201 aa  315  4e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  74.74 
 
 
194 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1945  uncharacterized peroxidase-related enzyme  76.56 
 
 
196 aa  305  4.0000000000000004e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2668  uncharacterized peroxidase-related enzyme  75.77 
 
 
202 aa  304  7e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  76.06 
 
 
201 aa  298  3e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  75.79 
 
 
189 aa  298  3e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3133  uncharacterized peroxidase-related enzyme  75.53 
 
 
190 aa  298  4e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  76.47 
 
 
193 aa  296  2e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2093  hypothetical protein  73.8 
 
 
201 aa  295  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.868254 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  76.22 
 
 
192 aa  296  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3003  hypothetical protein  75.68 
 
 
191 aa  294  5e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  75.94 
 
 
193 aa  294  5e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  74.59 
 
 
192 aa  294  6e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  74.59 
 
 
192 aa  293  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  71.96 
 
 
192 aa  293  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1899  hypothetical protein  72.14 
 
 
209 aa  292  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  73.3 
 
 
192 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  71.96 
 
 
192 aa  290  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4285  uncharacterized peroxidase-related enzyme  74.33 
 
 
207 aa  289  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  71.96 
 
 
192 aa  288  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  72.97 
 
 
192 aa  286  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  72.43 
 
 
192 aa  283  9e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  72.43 
 
 
192 aa  283  9e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  70.37 
 
 
192 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3281  uncharacterized peroxidase-related enzyme  73.66 
 
 
192 aa  283  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4868  uncharacterized peroxidase-related enzyme  72.43 
 
 
192 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.405716  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8682  uncharacterized peroxidase-related enzyme  69.73 
 
 
192 aa  270  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2999  uncharacterized peroxidase-related enzyme  69.15 
 
 
196 aa  267  7e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6841  uncharacterized peroxidase-related enzyme  68.65 
 
 
192 aa  266  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1186  uncharacterized peroxidase-related enzyme  67.37 
 
 
192 aa  265  4e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3877  uncharacterized peroxidase-related enzyme  66.13 
 
 
200 aa  260  8.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4271  uncharacterized peroxidase-related enzyme  71.96 
 
 
192 aa  259  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0429275  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1446  uncharacterized peroxidase-related enzyme  63.68 
 
 
235 aa  253  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2199  uncharacterized peroxidase-related enzyme  63.64 
 
 
195 aa  252  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2723  uncharacterized peroxidase-related enzyme  72.04 
 
 
189 aa  250  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.114348  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3071  uncharacterized peroxidase-related enzyme  62.57 
 
 
192 aa  250  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000318179  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3260  uncharacterized peroxidase-related enzyme  53.44 
 
 
210 aa  206  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737438  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3197  uncharacterized peroxidase-related enzyme  52.17 
 
 
202 aa  203  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2532  uncharacterized peroxidase-related enzyme  50.54 
 
 
228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.872008  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1633  uncharacterized peroxidase-related enzyme  53.01 
 
 
194 aa  194  6e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  48.81 
 
 
217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  47.7 
 
 
216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  44.09 
 
 
190 aa  167  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0121  uncharacterized peroxidase-related enzyme  43.17 
 
 
191 aa  166  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.464175  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  41.62 
 
 
214 aa  154  7e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  44.38 
 
 
212 aa  153  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2827  peroxidase-like  41.05 
 
 
191 aa  150  8.999999999999999e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00537954  normal  0.0498212 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  40.31 
 
 
214 aa  150  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  38.92 
 
 
201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  37.44 
 
 
195 aa  139  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0194  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.42 
 
 
202 aa  89  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2585  hypothetical protein  30.65 
 
 
208 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2624  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.65 
 
 
208 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19737  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2630  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.65 
 
 
208 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544935  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3017  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.72 
 
 
209 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.271489  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.46 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.49 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  31.03 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2816  alkylhydroperoxidase AhpD domain protein  31.76 
 
 
196 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0335697  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  28.82 
 
 
172 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.82 
 
 
172 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.69 
 
 
172 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  28.82 
 
 
172 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.34 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3853  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.89 
 
 
192 aa  78.2  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.26579 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  35.07 
 
 
183 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  30.59 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0820  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.48 
 
 
196 aa  77.4  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2544  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.05 
 
 
195 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.165226  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.59 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.61 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.59 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5313  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.3 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5106  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.01 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.153962 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  31.82 
 
 
225 aa  75.5  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2539  uncharacterized peroxidase  29.3 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.65 
 
 
178 aa  74.7  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3941  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.7 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0161606  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3579  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.7 
 
 
197 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.95961  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.33 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0419  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.36 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.65 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.92 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.3 
 
 
181 aa  72.4  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  29.76 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0531  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.71 
 
 
386 aa  72  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  hitchhiker  0.0000452351 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  29.1 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1888  hypothetical protein  27.7 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0113894  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  27.16 
 
 
177 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  30.41 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0195  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.88 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1766  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.03 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.472183 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1447  hypothetical protein  28.99 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218618  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  37.65 
 
 
177 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>