148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1371 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1371  Carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
207 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1476  Carboxymuconolactone decarboxylase  97.54 
 
 
205 aa  411  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.399629  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1021  uncharacterized peroxidase-related enzyme  56.19 
 
 
210 aa  198  3.9999999999999996e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3159  carboxymuconolactone decarboxylase  35.14 
 
 
203 aa  109  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.29 
 
 
176 aa  81.6  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  28.95 
 
 
192 aa  82  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4868  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.33 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.405716  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2382  hypothetical protein  32.96 
 
 
170 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  26.71 
 
 
192 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  28.14 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.71 
 
 
192 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.08 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.57 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  26.97 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  26.8 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3877  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.32 
 
 
200 aa  72  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3260  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.57 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737438  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.52 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2093  hypothetical protein  27.56 
 
 
201 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.868254 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.95 
 
 
192 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.37 
 
 
192 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.1 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.67 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0758  hypothetical protein  26.75 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.18 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.1 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  28.41 
 
 
195 aa  68.6  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  25 
 
 
196 aa  68.2  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  24.18 
 
 
214 aa  67.8  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  25.49 
 
 
202 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3133  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.1 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8682  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.42 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4285  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.45 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  26.52 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.53 
 
 
192 aa  65.5  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.45 
 
 
198 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1945  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.49 
 
 
196 aa  65.1  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  24.36 
 
 
201 aa  64.7  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.64 
 
 
199 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  23.35 
 
 
190 aa  63.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6841  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.68 
 
 
192 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24 
 
 
192 aa  63.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.76 
 
 
192 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3071  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.81 
 
 
192 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000318179  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1446  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.81 
 
 
235 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.44 
 
 
181 aa  62.4  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.84 
 
 
201 aa  62  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.45 
 
 
193 aa  61.6  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.45 
 
 
193 aa  61.6  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.92 
 
 
178 aa  61.2  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1186  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.22 
 
 
192 aa  60.1  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  22.58 
 
 
177 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1633  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.76 
 
 
194 aa  60.1  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2199  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25 
 
 
195 aa  59.3  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.94 
 
 
181 aa  58.2  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  26.71 
 
 
178 aa  58.2  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4098  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.55 
 
 
211 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  25.93 
 
 
225 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  23.88 
 
 
177 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2668  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.14 
 
 
202 aa  55.5  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1899  hypothetical protein  25.15 
 
 
209 aa  55.1  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  29.41 
 
 
186 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.87 
 
 
212 aa  55.1  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3003  hypothetical protein  30.37 
 
 
191 aa  55.1  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.78 
 
 
216 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  23.45 
 
 
177 aa  54.7  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  25.5 
 
 
181 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.66 
 
 
172 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  27.7 
 
 
183 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1888  hypothetical protein  25.5 
 
 
197 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0113894  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1766  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.53 
 
 
196 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.472183 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0820  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.24 
 
 
196 aa  53.9  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2089  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.53 
 
 
196 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0121  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.81 
 
 
191 aa  52.8  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.464175  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  20.44 
 
 
217 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3281  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.93 
 
 
192 aa  52.8  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2723  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.37 
 
 
189 aa  52.4  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.114348  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.32 
 
 
181 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0485  hypothetical protein  22.45 
 
 
177 aa  52.4  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2999  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.88 
 
 
196 aa  52.4  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.42 
 
 
181 aa  52.4  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.14 
 
 
178 aa  51.6  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  26.04 
 
 
174 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  25.16 
 
 
227 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1745  hypothetical protein  21.74 
 
 
177 aa  50.1  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3579  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.11 
 
 
197 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.95961  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3941  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.11 
 
 
197 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0161606  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2539  uncharacterized peroxidase  23.4 
 
 
197 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  22.15 
 
 
181 aa  49.7  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  23.08 
 
 
188 aa  49.7  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  22.29 
 
 
184 aa  49.3  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  24.84 
 
 
183 aa  48.9  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4271  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.2 
 
 
192 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0429275  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5106  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.4 
 
 
196 aa  48.1  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.153962 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2816  alkylhydroperoxidase AhpD domain protein  23.4 
 
 
196 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0335697  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  23.49 
 
 
180 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1701  hypothetical protein  25.48 
 
 
177 aa  48.1  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0984593  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0091  alkylhydroperoxidase-related  24.11 
 
 
191 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336937  normal  0.314057 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4506  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.78 
 
 
398 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.256167 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3037  hypothetical protein  23.36 
 
 
172 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0597089 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>