151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2273 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  100 
 
 		 208 aa  427  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3639  alkylhydroperoxidase  94.69 
 
 		 219 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2094  alkylhydroperoxidase  96.22 
 
 		 186 aa  363  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  73.12 
 
 		 205 aa  277  7e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34460  hypothetical protein  73.89 
 
 		 186 aa  275  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000949639  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1537  alkylhydroperoxidase AhpD core  62.64 
 
 		 189 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0103  alkylhydroperoxidase AhpD core  58.7 
 
 		 211 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6744  alkylhydroperoxidase  53.92 
 
 		 207 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20217  normal  0.329225 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6510  alkylhydroperoxidase AhpD core  58.24 
 
 		 188 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.616705  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0460  carboxymuconolactone decarboxylase  58.7 
 
 		 190 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6333  alkylhydroperoxidase  58.24 
 
 		 198 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5826  alkylhydroperoxidase  56.18 
 
 		 213 aa  202  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835369  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0701  macrophage infectivity potentiator-related protein, putative  50 
 
 		 182 aa  181  1e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000764627  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12088  hypothetical protein  39.13 
 
 		 185 aa  142  5e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  38.5 
 
 		 189 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0320  carboxymuconolactone decarboxylase  35.16 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0745  hypothetical protein  34.27 
 
 		 180 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.680464  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1394  hypothetical protein  36.07 
 
 		 184 aa  122  3e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00257534  normal  0.766681 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5163  carboxymuconolactone decarboxylase  37.71 
 
 		 191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218763  normal  0.975035 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02225  putative alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein MED92  34.44 
 
 		 183 aa  119  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4052  hypothetical protein  34.25 
 
 		 181 aa  119  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000149727  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0971  hypothetical protein  35.36 
 
 		 184 aa  118  6e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838785 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  41.86 
 
 		 172 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0850  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 183 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0269901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  41.86 
 
 		 172 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1625  carboxymuconolactone decarboxylase  37.85 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.95 
 
 		 172 aa  116  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  40.7 
 
 		 172 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.67 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.67 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2694  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.13 
 
 		 191 aa  111  7.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5712  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.58 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1524  carboxymuconolactone decarboxylase  34.3 
 
 		 180 aa  109  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.42 
 
 		 178 aa  105  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.63 
 
 		 184 aa  105  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2561  carboxymuconolactone decarboxylase  34.81 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.947792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.43 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4635  hypothetical protein  31.67 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.382862 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0918  hypothetical protein  32.04 
 
 		 182 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.775247 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.14 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.32 
 
 		 181 aa  101  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  34.1 
 
 		 183 aa  101  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.62 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.34 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  32.73 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1674  alkylhydroperoxidase AhpD family protein  28.41 
 
 		 181 aa  99.4  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.77 
 
 		 181 aa  96.3  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4328  alkylhydroperoxidase  34.48 
 
 		 184 aa  94.7  9e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.646034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3832  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.51 
 
 		 184 aa  91.3  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.942836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.33 
 
 		 172 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  33.54 
 
 		 227 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.65 
 
 		 178 aa  89  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.49 
 
 		 179 aa  88.2  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  30.73 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.66 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5073  alkylhydroperoxidase  30.22 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3164  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.18 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5204  alkylhydroperoxidase  31.18 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.58 
 
 		 178 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  33.54 
 
 		 409 aa  79  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1603  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.39 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  29.75 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  28 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  31.68 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.9 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0096  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.05 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.14 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.55 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.48 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.57 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  28.57 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3701  alkylhydroperoxidase (AhpD family core domain protein)  31.48 
 
 		 151 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.716433  normal  0.202413 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.49 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  30.95 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.65 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6296  alkylhydroperoxidase  29.71 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  28.99 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.5 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2093  hypothetical protein  28.89 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.868254 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4868  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.88 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.405716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2790  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.57 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  26.38 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.1 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  26.88 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.88 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.25 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.33 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  30.77 
 
 		 172 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.92 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3989  alkylhydroperoxidase  30.49 
 
 		 177 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00333801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0970  alkylhydroperoxidase  30.81 
 
 		 183 aa  67  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4271  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.45 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0429275  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  27.62 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.12 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8682  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.33 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  26.03 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.07 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.87 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  28.09 
 
 		 180 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1446  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.63 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>