232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4328 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4328  alkylhydroperoxidase  100 
 
 		 184 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.646034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  63.89 
 
 		 184 aa  241  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  58.99 
 
 		 182 aa  221  6e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  57.46 
 
 		 183 aa  201  6e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1524  carboxymuconolactone decarboxylase  58.33 
 
 		 180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.19 
 
 		 182 aa  179  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  51.98 
 
 		 181 aa  178  4e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  58.68 
 
 		 409 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  46.15 
 
 		 183 aa  154  6e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  45 
 
 		 181 aa  145  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.71 
 
 		 178 aa  142  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  42.51 
 
 		 172 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  46.39 
 
 		 225 aa  142  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  40.11 
 
 		 181 aa  141  6e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  41.14 
 
 		 172 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  40.57 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  42.86 
 
 		 181 aa  139  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  44.44 
 
 		 178 aa  137  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  41.62 
 
 		 181 aa  136  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.07 
 
 		 181 aa  136  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  39.33 
 
 		 183 aa  135  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  44.69 
 
 		 178 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0970  alkylhydroperoxidase  48.1 
 
 		 183 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  38.42 
 
 		 177 aa  125  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.59 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.29 
 
 		 188 aa  122  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  42.22 
 
 		 181 aa  122  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3832  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.27 
 
 		 184 aa  121  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.942836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  37.85 
 
 		 177 aa  121  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.85 
 
 		 172 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5191  alkylhydroperoxidase AhpD core  63.53 
 
 		 195 aa  119  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  40.13 
 
 		 172 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.01 
 
 		 179 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  40.76 
 
 		 227 aa  117  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1603  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.85 
 
 		 179 aa  114  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0460  carboxymuconolactone decarboxylase  35.56 
 
 		 190 aa  112  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0103  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.78 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6510  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.91 
 
 		 188 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.616705  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6744  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20217  normal  0.329225 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  39.56 
 
 		 180 aa  108  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5826  alkylhydroperoxidase  36.07 
 
 		 213 aa  107  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835369  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6296  alkylhydroperoxidase  36.11 
 
 		 179 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5073  alkylhydroperoxidase  38.22 
 
 		 179 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3164  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.22 
 
 		 179 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5204  alkylhydroperoxidase  38.22 
 
 		 179 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.78 
 
 		 178 aa  106  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1537  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.43 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.03 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34460  hypothetical protein  34.48 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000949639  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  34.64 
 
 		 205 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2694  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.36 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.43 
 
 		 179 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  32.32 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2094  alkylhydroperoxidase  35.06 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  34.48 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3639  alkylhydroperoxidase  35.06 
 
 		 219 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  36.69 
 
 		 192 aa  101  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.6 
 
 		 178 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2790  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.29 
 
 		 182 aa  99.4  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5163  carboxymuconolactone decarboxylase  36.75 
 
 		 191 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218763  normal  0.975035 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3989  alkylhydroperoxidase  39.66 
 
 		 177 aa  99  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00333801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1625  carboxymuconolactone decarboxylase  34.86 
 
 		 189 aa  97.8  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6333  alkylhydroperoxidase  33.91 
 
 		 198 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5712  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.48 
 
 		 197 aa  95.9  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0701  macrophage infectivity potentiator-related protein, putative  31.21 
 
 		 182 aa  93.6  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000764627  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.46 
 
 		 186 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.46 
 
 		 186 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  38.06 
 
 		 189 aa  92  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0745  hypothetical protein  31.93 
 
 		 180 aa  88.6  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.680464  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0850  alkylhydroperoxidase  31.33 
 
 		 183 aa  88.6  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0269901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0320  carboxymuconolactone decarboxylase  28.07 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1394  hypothetical protein  28.66 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00257534  normal  0.766681 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12088  hypothetical protein  27.44 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0971  hypothetical protein  30.87 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0022  alkylhydroperoxidase  32.68 
 
 		 175 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236735  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4052  hypothetical protein  28.82 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000149727  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2561  carboxymuconolactone decarboxylase  30.36 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.947792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02225  putative alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein MED92  26.35 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  30.23 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0918  hypothetical protein  27.11 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.775247 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0096  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.77 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1674  alkylhydroperoxidase AhpD family protein  24.55 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.21 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4635  hypothetical protein  27.01 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.382862 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.31 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4244  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.21 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.502353  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  27.22 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.12 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.33 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  27.33 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0895  carboxymuconolactone decarboxylase  26.71 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  27.17 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2093  hypothetical protein  27.33 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.868254 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.16 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3701  alkylhydroperoxidase (AhpD family core domain protein)  33 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.716433  normal  0.202413 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.33 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1446  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.64 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  27.5 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  28.07 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>