171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3989 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3989  alkylhydroperoxidase  100 
 
 		 177 aa  352  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00333801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  53.14 
 
 		 179 aa  187  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1603  alkylhydroperoxidase AhpD core  53.14 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5073  alkylhydroperoxidase  52 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3164  alkylhydroperoxidase AhpD core  51.43 
 
 		 179 aa  168  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5204  alkylhydroperoxidase  51.43 
 
 		 179 aa  168  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3832  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.59 
 
 		 184 aa  161  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.942836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6296  alkylhydroperoxidase  41.57 
 
 		 179 aa  141  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  41.34 
 
 		 180 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  36.16 
 
 		 183 aa  117  7e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.91 
 
 		 178 aa  116  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.29 
 
 		 172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.98 
 
 		 172 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36 
 
 		 178 aa  111  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.43 
 
 		 178 aa  111  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  35.39 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  35.59 
 
 		 181 aa  108  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  38.31 
 
 		 172 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  34.83 
 
 		 177 aa  106  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.38 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  38.55 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.73 
 
 		 178 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  39.53 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  36 
 
 		 178 aa  102  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  36.72 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.94 
 
 		 179 aa  101  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.2 
 
 		 172 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  36.2 
 
 		 172 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.85 
 
 		 178 aa  100  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1524  carboxymuconolactone decarboxylase  38.2 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  38.06 
 
 		 225 aa  99.4  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.03 
 
 		 181 aa  99.8  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4328  alkylhydroperoxidase  39.66 
 
 		 184 aa  97.8  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.646034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.24 
 
 		 182 aa  98.2  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.26 
 
 		 184 aa  96.3  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 172 aa  95.5  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5712  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 197 aa  95.5  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.39 
 
 		 181 aa  94.7  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.9 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.54 
 
 		 181 aa  91.3  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2694  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.82 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5826  alkylhydroperoxidase  33.96 
 
 		 213 aa  89.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835369  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0970  alkylhydroperoxidase  37.85 
 
 		 183 aa  89.4  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0103  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.74 
 
 		 211 aa  88.2  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.33 
 
 		 181 aa  87.8  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  34.91 
 
 		 227 aa  87  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.54 
 
 		 186 aa  86.3  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5163  carboxymuconolactone decarboxylase  32.95 
 
 		 191 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218763  normal  0.975035 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.54 
 
 		 186 aa  86.3  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0320  carboxymuconolactone decarboxylase  33.78 
 
 		 188 aa  85.5  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6510  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.95 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.616705  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0460  carboxymuconolactone decarboxylase  32.18 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  34.42 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6744  alkylhydroperoxidase  33.1 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20217  normal  0.329225 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1537  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.77 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  36.05 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1625  carboxymuconolactone decarboxylase  34.81 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  29.94 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.42 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2790  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.77 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  30.49 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0096  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.14 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6333  alkylhydroperoxidase  33.79 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  32.16 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.11 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34460  hypothetical protein  32.37 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000949639  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2094  alkylhydroperoxidase  29.8 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3639  alkylhydroperoxidase  30.77 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0850  alkylhydroperoxidase  25.43 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0269901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0745  hypothetical protein  27.74 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.680464  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  35.62 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1674  alkylhydroperoxidase AhpD family protein  24.83 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02225  putative alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein MED92  26.67 
 
 		 183 aa  64.3  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.82 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1394  hypothetical protein  27.81 
 
 		 184 aa  62  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00257534  normal  0.766681 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12088  hypothetical protein  23.46 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0971  hypothetical protein  27.33 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838785 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0918  hypothetical protein  27.15 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.775247 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2561  carboxymuconolactone decarboxylase  26.8 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.947792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  30.56 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4052  hypothetical protein  25 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000149727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0022  alkylhydroperoxidase  30.3 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236735  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.07 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4635  hypothetical protein  24.07 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.382862 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3197  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.72 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  29.78 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  28.67 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5191  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.46 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0758  hypothetical protein  31.41 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  29.59 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.4 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2532  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.24 
 
 		 228 aa  52  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.872008  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1859  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.27 
 
 		 176 aa  52  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0505741  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.49 
 
 		 192 aa  51.2  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4098  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.64 
 
 		 211 aa  51.2  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  25.61 
 
 		 190 aa  51.2  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0701  macrophage infectivity potentiator-related protein, putative  23.65 
 
 		 182 aa  50.8  0.000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000764627  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3701  alkylhydroperoxidase (AhpD family core domain protein)  25.23 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.716433  normal  0.202413 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.03 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>